More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1465 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1465  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 294 aa  588  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0514  Lytic transglycosylase catalytic  59.21 
 
 		 254 aa  248  7e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3883  lytic transglycosylase catalytic  57.14 
 
 		 252 aa  186  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8299  Lytic transglycosylase catalytic  62.96 
 
 		 325 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103911  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2543  Lytic transglycosylase catalytic  51.56 
 
 		 249 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1014  Lytic transglycosylase catalytic  51.81 
 
 		 250 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2555  Lytic transglycosylase catalytic  50.56 
 
 		 260 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2909  lytic transglycosylase, catalytic  41.6 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.368798 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  57.25 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2995  lytic transglycosylase, catalytic  55.15 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.891675  normal  0.0342596 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2904  soluble lytic transglycosylase  48.51 
 
 		 197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2017  lytic transglycosylase, catalytic  45.3 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275292  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  44 
 
 		 179 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2866  Lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 		 206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918978  normal  0.297415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2606  Lytic transglycosylase catalytic  43.07 
 
 		 175 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1733  lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 219 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254136  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1443  transglycosylase SLT domain-containing protein  42.37 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1399  transglycosylase SLT domain-containing protein  42.37 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.861628  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  42.57 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3772  lytic transglycosylase catalytic  43.82 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  33.56 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  38.6 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6221  hypothetical protein  34.13 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2814  Lytic transglycosylase catalytic  43.53 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2397  lytic transglycosylase catalytic  43.53 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279322  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0650  transglycosylase  38.95 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2303  lytic transglycosylase, catalytic  38.95 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.176095 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3561  Lytic transglycosylase catalytic  35.71 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0582  lytic transglycosylase, catalytic  37.93 
 
 		 150 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  38.61 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  38.61 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  35.58 
 
 		 715 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3773  Lytic transglycosylase catalytic  43.02 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3465  lytic transglycosylase catalytic  43.02 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3663  Lytic transglycosylase catalytic  43.02 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  36.36 
 
 		 197 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  36 
 
 		 218 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2463  lytic transglycosylase, catalytic  37.08 
 
 		 158 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2912  lytic murein transglycosylase  36.57 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.647608  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  33.53 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2890  lytic transglycosylase, catalytic  37.08 
 
 		 158 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.576703  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  34.23 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  39.58 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  34.26 
 
 		 833 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  36.19 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  37.74 
 
 		 782 aa  63.2  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2108  lytic transglycosylase catalytic  38.95 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.344374 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  37.74 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  33.9 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  35.35 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  33.06 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  33.86 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  33.06 
 
 		 251 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  33.06 
 
 		 251 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  32.8 
 
 		 244 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 224 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  36.63 
 
 		 203 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  36.36 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  36.79 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  36.63 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  33.64 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  32.17 
 
 		 709 aa  59.7  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  38.1 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1017  lytic transglycosylase, catalytic  32.11 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.520766 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  36.08 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  37.27 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  36.19 
 
 		 603 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  34.34 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2690  lytic transglycosylase catalytic  34.91 
 
 		 800 aa  58.9  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  32.81 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  34.62 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  34.34 
 
 		 239 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  34.34 
 
 		 239 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  31.43 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  34.34 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  33.01 
 
 		 663 aa  57.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5084  lytic transglycosylase catalytic  38.54 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0436378  normal  0.0244706 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1248  Lytic transglycosylase catalytic  35.35 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00404625  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  34.65 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  36.63 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  32.08 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  38.78 
 
 		 217 aa  57  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  30.7 
 
 		 709 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 		 208 aa  57  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2746  lytic transglycosylase catalytic  36.08 
 
 		 259 aa  57  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0006  lytic transglycosylase catalytic  35.63 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0006  lytic transglycosylase, catalytic  35.63 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3164  lytic transglycosylase, catalytic  33.02 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.205276 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  28.34 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  36.59 
 
 		 442 aa  55.8  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  33.02 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0575  lytic transglycosylase catalytic  32.35 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.445014 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  31.67 
 
 		 241 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  31.19 
 
 		 217 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  34.34 
 
 		 204 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  30.99 
 
 		 201 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  35.09 
 
 		 189 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  29.25 
 
 		 193 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0968  lytic transglycosylase, catalytic  36.27 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.669307  normal  0.333056 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  32.35 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>