288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1014 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1014  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 250 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2555  Lytic transglycosylase catalytic  86.56 
 
 		 260 aa  300  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526771 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1465  lytic transglycosylase catalytic  45.34 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8299  Lytic transglycosylase catalytic  59.35 
 
 		 325 aa  175  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103911  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0514  Lytic transglycosylase catalytic  49.3 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2543  Lytic transglycosylase catalytic  55.8 
 
 		 249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3883  lytic transglycosylase catalytic  61.98 
 
 		 252 aa  145  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2909  lytic transglycosylase, catalytic  44.78 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.368798 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  55.3 
 
 		 263 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2995  lytic transglycosylase, catalytic  47.46 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.891675  normal  0.0342596 
 
 
-
 
NC_004310  BR1443  transglycosylase SLT domain-containing protein  42.42 
 
 		 214 aa  117  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1733  lytic transglycosylase catalytic  45.83 
 
 		 219 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254136  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1399  transglycosylase SLT domain-containing protein  42.42 
 
 		 214 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.861628  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2904  soluble lytic transglycosylase  44.27 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  42.25 
 
 		 179 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2866  Lytic transglycosylase catalytic  44.74 
 
 		 206 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918978  normal  0.297415 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2017  lytic transglycosylase, catalytic  41.86 
 
 		 205 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275292  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2606  Lytic transglycosylase catalytic  44.92 
 
 		 175 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3772  lytic transglycosylase catalytic  44.09 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2814  Lytic transglycosylase catalytic  43.96 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3663  Lytic transglycosylase catalytic  43.48 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6221  hypothetical protein  41.84 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  38.81 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2397  lytic transglycosylase catalytic  43.82 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279322  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0650  transglycosylase  39.62 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2303  lytic transglycosylase, catalytic  39.62 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.176095 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3465  lytic transglycosylase catalytic  42.39 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3773  Lytic transglycosylase catalytic  42.39 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2912  lytic murein transglycosylase  34.92 
 
 		 368 aa  68.9  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.647608  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2463  lytic transglycosylase, catalytic  42.39 
 
 		 158 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2890  lytic transglycosylase, catalytic  37.6 
 
 		 158 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.576703  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0582  lytic transglycosylase, catalytic  38.6 
 
 		 150 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  37.84 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  35.83 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  42.57 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2108  lytic transglycosylase catalytic  36.79 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.344374 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  41.58 
 
 		 296 aa  62  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3561  Lytic transglycosylase catalytic  33.67 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0067  transglycosylase SLT domain-containing protein  34.91 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  44.79 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  43.16 
 
 		 603 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  36.73 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  41.58 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2746  lytic transglycosylase catalytic  38.3 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0006  lytic transglycosylase, catalytic  34.34 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  34.4 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0066  transglycosylase SLT domain-containing protein  33.96 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  34.4 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  34.92 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  34.92 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  34.4 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  34.4 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0538  lytic transglycosylase, catalytic  32.76 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.527113  hitchhiker  0.00520856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  34.92 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  35.48 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0077  lytic transglycosylase catalytic  33.02 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  39.25 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2871  Lytic transglycosylase catalytic  26.98 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  35.38 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  40.4 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0006  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  38.61 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  38.94 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  38.94 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  34.62 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  38.83 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  30.56 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  36.29 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2611  Lytic transglycosylase catalytic  25.6 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1275  lytic transglycosylase, catalytic  34.95 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  44.05 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  36 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2103  lytic transglycosylase, catalytic  35.79 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25465  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  30.56 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  30.56 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  31.09 
 
 		 175 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  34.4 
 
 		 326 aa  53.9  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  32.54 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2391  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  32.26 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  30.95 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  36.28 
 
 		 304 aa  53.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  30.88 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  30.56 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  33.87 
 
 		 226 aa  53.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  37.11 
 
 		 218 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  30.56 
 
 		 261 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  30.56 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1017  lytic transglycosylase, catalytic  36 
 
 		 165 aa  53.1  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.520766 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2007  lytic transglycosylase, catalytic  32.09 
 
 		 278 aa  53.1  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00437999  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  37.11 
 
 		 197 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0575  lytic transglycosylase catalytic  34.95 
 
 		 223 aa  52.8  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.445014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  38.83 
 
 		 327 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  36.63 
 
 		 280 aa  52.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  32.03 
 
 		 297 aa  52.4  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  31.76 
 
 		 297 aa  52.4  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  31.31 
 
 		 283 aa  52.4  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  30.56 
 
 		 261 aa  52  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0550  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 		 164 aa  52  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>