80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3561 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3561  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 428 aa  840    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2746  lytic transglycosylase catalytic  58.71 
 
 		 259 aa  173  5.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2912  lytic murein transglycosylase  48.25 
 
 		 368 aa  133  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.647608  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0067  transglycosylase SLT domain-containing protein  52.17 
 
 		 287 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6221  hypothetical protein  48.59 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0066  transglycosylase SLT domain-containing protein  52.17 
 
 		 287 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0077  lytic transglycosylase catalytic  51.3 
 
 		 280 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2108  lytic transglycosylase catalytic  49.54 
 
 		 333 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.344374 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2103  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 249 aa  116  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25465  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2463  lytic transglycosylase, catalytic  55.68 
 
 		 158 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2611  Lytic transglycosylase catalytic  47.46 
 
 		 310 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2890  lytic transglycosylase, catalytic  55.68 
 
 		 158 aa  114  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.576703  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2871  Lytic transglycosylase catalytic  45.76 
 
 		 305 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2397  lytic transglycosylase catalytic  49.21 
 
 		 375 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279322  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3663  Lytic transglycosylase catalytic  45.21 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3773  Lytic transglycosylase catalytic  52.87 
 
 		 297 aa  102  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3465  lytic transglycosylase catalytic  52.87 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3772  lytic transglycosylase catalytic  52.27 
 
 		 326 aa  99.8  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2814  Lytic transglycosylase catalytic  53.49 
 
 		 342 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0550  lytic transglycosylase, catalytic  45.71 
 
 		 164 aa  97.1  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0650  transglycosylase  46.23 
 
 		 150 aa  97.1  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2303  lytic transglycosylase, catalytic  46.23 
 
 		 150 aa  97.1  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.176095 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0582  lytic transglycosylase, catalytic  45.28 
 
 		 150 aa  94.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1017  lytic transglycosylase, catalytic  42.48 
 
 		 165 aa  92  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.520766 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1037  lytic transglycosylase, catalytic  41.9 
 
 		 156 aa  89  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166947 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1733  lytic transglycosylase catalytic  39.8 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254136  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2017  lytic transglycosylase, catalytic  41.84 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275292  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1399  transglycosylase SLT domain-containing protein  40.82 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.861628  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1443  transglycosylase SLT domain-containing protein  40.82 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2904  soluble lytic transglycosylase  42.86 
 
 		 197 aa  82  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0514  Lytic transglycosylase catalytic  37.76 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2866  Lytic transglycosylase catalytic  39.39 
 
 		 206 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918978  normal  0.297415 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8299  Lytic transglycosylase catalytic  34.91 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103911  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2606  Lytic transglycosylase catalytic  38.78 
 
 		 175 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  38.78 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1465  lytic transglycosylase catalytic  35.71 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2543  Lytic transglycosylase catalytic  33.67 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3883  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  35.4 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2995  lytic transglycosylase, catalytic  35.71 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.891675  normal  0.0342596 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  34.95 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1014  Lytic transglycosylase catalytic  33.67 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  37.37 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2555  Lytic transglycosylase catalytic  33.67 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526771 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  38.75 
 
 		 202 aa  54.7  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  34.58 
 
 		 296 aa  53.5  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  34.58 
 
 		 296 aa  53.5  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  36.08 
 
 		 197 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2909  lytic transglycosylase, catalytic  33.67 
 
 		 262 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.368798 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  35.71 
 
 		 261 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  35.71 
 
 		 261 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  35.71 
 
 		 261 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  36.36 
 
 		 198 aa  52.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  35.71 
 
 		 261 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  30.21 
 
 		 196 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2135  lytic transglycosylase catalytic  37.93 
 
 		 233 aa  51.6  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  35.71 
 
 		 261 aa  51.6  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  35.71 
 
 		 259 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  32.99 
 
 		 217 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  35.56 
 
 		 709 aa  50.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1706  transglycosylase slt family protein  39.29 
 
 		 212 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.190325  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1816  lytic transglycosylase catalytic  39.29 
 
 		 220 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  34.21 
 
 		 174 aa  48.9  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  37.63 
 
 		 215 aa  48.9  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2629  transglycosylase slt family protein  39.29 
 
 		 212 aa  48.9  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00160181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  28.28 
 
 		 198 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  30.91 
 
 		 603 aa  47.4  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  32 
 
 		 244 aa  47  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0452  lytic transglycosylase, catalytic  35.16 
 
 		 204 aa  46.6  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  31.96 
 
 		 243 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  34.15 
 
 		 709 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  34.02 
 
 		 224 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0440  lytic transglycosylase, catalytic  39.47 
 
 		 204 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1794  putative lytic transglycosylase  39.47 
 
 		 204 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  34.02 
 
 		 218 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  32.67 
 
 		 189 aa  44.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  30.84 
 
 		 719 aa  45.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  34.02 
 
 		 197 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  25.76 
 
 		 747 aa  45.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  32.35 
 
 		 203 aa  43.1  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>