183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2814 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2814  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 342 aa  642    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2397  lytic transglycosylase catalytic  78.11 
 
 		 375 aa  293  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279322  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3663  Lytic transglycosylase catalytic  44.01 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6221  hypothetical protein  59.05 
 
 		 277 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2103  lytic transglycosylase, catalytic  59.81 
 
 		 249 aa  125  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25465  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0067  transglycosylase SLT domain-containing protein  55 
 
 		 287 aa  125  9e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2108  lytic transglycosylase catalytic  50.86 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.344374 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0066  transglycosylase SLT domain-containing protein  55 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0077  lytic transglycosylase catalytic  55 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2912  lytic murein transglycosylase  49.55 
 
 		 368 aa  122  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.647608  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3465  lytic transglycosylase catalytic  40.49 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2611  Lytic transglycosylase catalytic  46.02 
 
 		 310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2746  lytic transglycosylase catalytic  52.07 
 
 		 259 aa  117  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3561  Lytic transglycosylase catalytic  43.66 
 
 		 428 aa  117  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2871  Lytic transglycosylase catalytic  46.02 
 
 		 305 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2463  lytic transglycosylase, catalytic  55.56 
 
 		 158 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2890  lytic transglycosylase, catalytic  54.63 
 
 		 158 aa  113  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.576703  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0582  lytic transglycosylase, catalytic  52.38 
 
 		 150 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0650  transglycosylase  51.92 
 
 		 150 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2303  lytic transglycosylase, catalytic  51.92 
 
 		 150 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.176095 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0550  lytic transglycosylase, catalytic  53.33 
 
 		 164 aa  99  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2904  soluble lytic transglycosylase  47.92 
 
 		 197 aa  85.1  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1017  lytic transglycosylase, catalytic  45.1 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.520766 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1037  lytic transglycosylase, catalytic  45.63 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166947 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  43.56 
 
 		 179 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1399  transglycosylase SLT domain-containing protein  39.64 
 
 		 214 aa  78.6  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.861628  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2017  lytic transglycosylase, catalytic  41.35 
 
 		 205 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275292  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1443  transglycosylase SLT domain-containing protein  40 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1733  lytic transglycosylase catalytic  39.81 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254136  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0514  Lytic transglycosylase catalytic  38.83 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2866  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 206 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918978  normal  0.297415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2606  Lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 		 175 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1014  Lytic transglycosylase catalytic  41.75 
 
 		 250 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1465  lytic transglycosylase catalytic  41.24 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2555  Lytic transglycosylase catalytic  43.16 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2543  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 249 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3883  lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 252 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8299  Lytic transglycosylase catalytic  39.8 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103911  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2995  lytic transglycosylase, catalytic  36.63 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.891675  normal  0.0342596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2909  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.368798 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  41.84 
 
 		 206 aa  62  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  41.86 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  32.14 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  36.27 
 
 		 282 aa  59.3  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  32.11 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4016  lytic transglycosylase, catalytic  47.06 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0926261  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  36.54 
 
 		 204 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  37.38 
 
 		 212 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1463  lytic transglycosylase, catalytic  34.95 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  36.13 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 		 189 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  36.13 
 
 		 296 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  39.42 
 
 		 203 aa  53.9  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  50.79 
 
 		 199 aa  53.9  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  34.26 
 
 		 207 aa  53.5  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  41.1 
 
 		 197 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  35.42 
 
 		 217 aa  52.8  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  41.56 
 
 		 202 aa  52.8  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  44.12 
 
 		 197 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  45.21 
 
 		 203 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  32.29 
 
 		 283 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  39.42 
 
 		 198 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  35.58 
 
 		 204 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  37 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  34.88 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  38.2 
 
 		 603 aa  51.6  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  36.59 
 
 		 191 aa  51.6  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  49.02 
 
 		 174 aa  51.2  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  31.97 
 
 		 280 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  44.12 
 
 		 218 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1089  lytic transglycosylase catalytic  39.77 
 
 		 238 aa  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  37 
 
 		 321 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  33.91 
 
 		 175 aa  50.8  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  39.08 
 
 		 661 aa  51.2  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2959  lytic transglycosylase catalytic  33.04 
 
 		 280 aa  50.4  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  36.73 
 
 		 217 aa  50.4  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  31.91 
 
 		 258 aa  50.4  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  37.65 
 
 		 243 aa  50.1  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  39.24 
 
 		 211 aa  49.7  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0901  copper amine oxidase domain protein  41.56 
 
 		 340 aa  49.7  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.948767  normal  0.18587 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  36.73 
 
 		 251 aa  49.3  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0029  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 276 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240678  normal  0.132165 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  39.39 
 
 		 340 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  39.71 
 
 		 224 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  43.42 
 
 		 202 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  40.79 
 
 		 242 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1908  lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 340 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2102  Lytic transglycosylase catalytic  40.51 
 
 		 239 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2611  lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 251 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.59616 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  36.73 
 
 		 251 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  32.52 
 
 		 747 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  34.65 
 
 		 239 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  27.08 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  36.73 
 
 		 251 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1424  lytic transglycosylase, catalytic  42.67 
 
 		 191 aa  48.1  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0284128  normal  0.0259883 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  32.67 
 
 		 251 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  32.29 
 
 		 238 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  27.08 
 
 		 261 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  34.69 
 
 		 196 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>