64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0077 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_0077  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 280 aa  559  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0067  transglycosylase SLT domain-containing protein  83.93 
 
 		 287 aa  424  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0066  transglycosylase SLT domain-containing protein  83.93 
 
 		 287 aa  424  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2103  lytic transglycosylase, catalytic  74.34 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25465  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0550  lytic transglycosylase, catalytic  63.91 
 
 		 164 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2912  lytic murein transglycosylase  55.08 
 
 		 368 aa  146  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.647608  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2611  Lytic transglycosylase catalytic  62.5 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2871  Lytic transglycosylase catalytic  62.5 
 
 		 305 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0650  transglycosylase  56.64 
 
 		 150 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2303  lytic transglycosylase, catalytic  56.64 
 
 		 150 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.176095 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2108  lytic transglycosylase catalytic  52.89 
 
 		 333 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.344374 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3561  Lytic transglycosylase catalytic  51.3 
 
 		 428 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1017  lytic transglycosylase, catalytic  54.55 
 
 		 165 aa  125  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.520766 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1037  lytic transglycosylase, catalytic  52.94 
 
 		 156 aa  125  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166947 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0582  lytic transglycosylase, catalytic  55.75 
 
 		 150 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2746  lytic transglycosylase catalytic  57.8 
 
 		 259 aa  125  8.000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6221  hypothetical protein  42.14 
 
 		 277 aa  109  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3663  Lytic transglycosylase catalytic  59.26 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3772  lytic transglycosylase catalytic  55.86 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3773  Lytic transglycosylase catalytic  57.41 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3465  lytic transglycosylase catalytic  57.41 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2463  lytic transglycosylase, catalytic  49.07 
 
 		 158 aa  99  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2890  lytic transglycosylase, catalytic  51.69 
 
 		 158 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.576703  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2866  Lytic transglycosylase catalytic  48.96 
 
 		 206 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918978  normal  0.297415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2606  Lytic transglycosylase catalytic  48.96 
 
 		 175 aa  89.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2904  soluble lytic transglycosylase  49.48 
 
 		 197 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1733  lytic transglycosylase catalytic  41.75 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254136  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2017  lytic transglycosylase, catalytic  41.84 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275292  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2397  lytic transglycosylase catalytic  52.54 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279322  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2814  Lytic transglycosylase catalytic  51.28 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1443  transglycosylase SLT domain-containing protein  40.21 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1399  transglycosylase SLT domain-containing protein  40.21 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.861628  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  38.98 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  39.58 
 
 		 263 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2995  lytic transglycosylase, catalytic  32.67 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.891675  normal  0.0342596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2909  lytic transglycosylase, catalytic  31.25 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.368798 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8299  Lytic transglycosylase catalytic  33.68 
 
 		 325 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103911  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1014  Lytic transglycosylase catalytic  33.02 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  35.05 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  35.05 
 
 		 260 aa  52.4  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  35.24 
 
 		 198 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0514  Lytic transglycosylase catalytic  31 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  33.64 
 
 		 204 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2555  Lytic transglycosylase catalytic  40.26 
 
 		 260 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2543  Lytic transglycosylase catalytic  32.63 
 
 		 249 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  35.05 
 
 		 196 aa  48.9  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  33.64 
 
 		 204 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 196 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  31.16 
 
 		 282 aa  47.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1465  lytic transglycosylase catalytic  32.99 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3883  lytic transglycosylase catalytic  39.66 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  35.11 
 
 		 203 aa  46.6  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  34.74 
 
 		 188 aa  46.2  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 258 aa  45.8  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  32.99 
 
 		 207 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  28.99 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  32.99 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  35.63 
 
 		 217 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  31 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  40.79 
 
 		 328 aa  43.5  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  33.04 
 
 		 603 aa  42.7  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5136  lytic transglycosylase catalytic  32.32 
 
 		 228 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  31.63 
 
 		 198 aa  42.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  29.91 
 
 		 241 aa  42.4  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>