More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2543 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2543  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 249 aa  501  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8299  Lytic transglycosylase catalytic  62.94 
 
 		 325 aa  203  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103911  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0514  Lytic transglycosylase catalytic  57.14 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1465  lytic transglycosylase catalytic  51.56 
 
 		 294 aa  182  6e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3883  lytic transglycosylase catalytic  53.93 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  61.6 
 
 		 263 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1014  Lytic transglycosylase catalytic  55 
 
 		 250 aa  163  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2909  lytic transglycosylase, catalytic  60.98 
 
 		 262 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.368798 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2995  lytic transglycosylase, catalytic  62.4 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.891675  normal  0.0342596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2555  Lytic transglycosylase catalytic  66.38 
 
 		 260 aa  158  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526771 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1399  transglycosylase SLT domain-containing protein  40.36 
 
 		 214 aa  123  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.861628  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1443  transglycosylase SLT domain-containing protein  39.76 
 
 		 214 aa  121  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  44.35 
 
 		 179 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1733  lytic transglycosylase catalytic  41.48 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254136  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2866  Lytic transglycosylase catalytic  47.79 
 
 		 206 aa  118  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918978  normal  0.297415 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2904  soluble lytic transglycosylase  46.61 
 
 		 197 aa  118  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2017  lytic transglycosylase, catalytic  46.09 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275292  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2606  Lytic transglycosylase catalytic  46.61 
 
 		 175 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3772  lytic transglycosylase catalytic  46.51 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  38.21 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2463  lytic transglycosylase, catalytic  41.94 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2746  lytic transglycosylase catalytic  43.68 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  38.39 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2814  Lytic transglycosylase catalytic  43.37 
 
 		 342 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  35.86 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3561  Lytic transglycosylase catalytic  33.67 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  38.39 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2397  lytic transglycosylase catalytic  42.17 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279322  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3663  Lytic transglycosylase catalytic  45.24 
 
 		 309 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6221  hypothetical protein  41.49 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2303  lytic transglycosylase, catalytic  41.18 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.176095 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0650  transglycosylase  41.18 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3465  lytic transglycosylase catalytic  44.05 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2890  lytic transglycosylase, catalytic  39.78 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.576703  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3773  Lytic transglycosylase catalytic  44.05 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  29.94 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0582  lytic transglycosylase, catalytic  41.18 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  30.11 
 
 		 260 aa  62  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  39.22 
 
 		 280 aa  62  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  35.92 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  30.61 
 
 		 709 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  36.36 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  41.24 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2912  lytic murein transglycosylase  36.84 
 
 		 368 aa  58.9  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.647608  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0006  lytic transglycosylase catalytic  32.41 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 		 199 aa  58.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  32.8 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0006  lytic transglycosylase, catalytic  32.41 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  37.37 
 
 		 603 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  40.4 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  36.54 
 
 		 175 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  29.93 
 
 		 709 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2108  lytic transglycosylase catalytic  39.08 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.344374 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2280  Slt family transglycosylase  31.06 
 
 		 688 aa  56.6  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  36.7 
 
 		 281 aa  57  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  35 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  35 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  36.17 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0421  lytic transglycosylase, catalytic  32.04 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.829572 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  34.02 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  34.02 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  35.35 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  34.86 
 
 		 698 aa  55.5  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  34.02 
 
 		 715 aa  55.5  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  40.23 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  32.2 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1248  Lytic transglycosylase catalytic  27.4 
 
 		 175 aa  55.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00404625  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  35 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  38.04 
 
 		 673 aa  53.9  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  31.68 
 
 		 279 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1955  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  34.48 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal  0.211884 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  37.21 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  34.62 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  32.99 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  34.31 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  35.58 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  28 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  29.17 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0575  lytic transglycosylase catalytic  33.64 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.445014 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01168  lytic murein endotransglycosylase E  34.48 
 
 		 203 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.349324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2455  Lytic transglycosylase catalytic  34.48 
 
 		 203 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00170587  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  28 
 
 		 261 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  32.43 
 
 		 193 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01178  hypothetical protein  34.48 
 
 		 203 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2432  lytic transglycosylase catalytic  34.48 
 
 		 203 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.283102  normal  0.357576 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  31.25 
 
 		 190 aa  53.1  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1680  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  34.48 
 
 		 203 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  normal  0.45988 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1351  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  34.48 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0495  lytic transglycosylase, catalytic  29.34 
 
 		 252 aa  53.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.358787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  28 
 
 		 261 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1295  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  34.48 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0532934  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3164  lytic transglycosylase, catalytic  32.67 
 
 		 284 aa  53.1  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.205276 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1338  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  34.48 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.243882  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  28 
 
 		 261 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0643  lytic transglycosylase, catalytic  30.5 
 
 		 203 aa  52.8  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.849619  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1226  Lytic transglycosylase catalytic  29.93 
 
 		 221 aa  52.8  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793802  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  36.47 
 
 		 207 aa  52.8  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1010  lytic transglycosylase catalytic  30.56 
 
 		 153 aa  52.4  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0664563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>