299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1089 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1089  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 238 aa  479  1e-134  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0244  lytic transglycosylase catalytic  40.1 
 
 		 197 aa  152  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0246  lytic transglycosylase, catalytic  47.44 
 
 		 197 aa  150  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1311  lytic transglycosylase, catalytic  42.95 
 
 		 177 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3509  lytic transglycosylase catalytic  29.65 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  31.88 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0495  lytic transglycosylase, catalytic  28.38 
 
 		 252 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.358787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5136  lytic transglycosylase catalytic  26.63 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1010  lytic transglycosylase catalytic  32.81 
 
 		 153 aa  64.7  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0664563  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1328  Lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  38.83 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0006  lytic transglycosylase, catalytic  33.81 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1014  lytic transglycosylase catalytic  34.78 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.316435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  38.83 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1606  Lytic transglycosylase catalytic  40.57 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000533374  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0006  lytic transglycosylase catalytic  31.72 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3221  lytic transglycosylase, catalytic  29.05 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4539  lytic transglycosylase, catalytic  28.16 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5146  lytic transglycosylase, catalytic  29.05 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00474071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  29.41 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  29.17 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  29.94 
 
 		 233 aa  62  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1248  Lytic transglycosylase catalytic  31.89 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00404625  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5063  lytic transglycosylase catalytic  28.85 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  37.86 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  38.18 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1407  lytic transglycosylase, catalytic  35.11 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1794  lytic transglycosylase, catalytic  29.28 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  28.47 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  27.89 
 
 		 659 aa  59.3  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2874  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0680806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  28.57 
 
 		 663 aa  58.5  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  26.53 
 
 		 678 aa  58.5  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  36.54 
 
 		 661 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  40.4 
 
 		 663 aa  58.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  31.93 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  37.11 
 
 		 673 aa  58.5  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  31.93 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  34.62 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  31.11 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3427  Lytic transglycosylase catalytic  33.09 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  39.09 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  36.08 
 
 		 677 aa  56.2  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3693  Lytic transglycosylase catalytic  27.89 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00345887  hitchhiker  0.000000358582 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  36.97 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  28.19 
 
 		 657 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  28.19 
 
 		 657 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  37.38 
 
 		 724 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0265  transglycosylase SLT domain protein  40.66 
 
 		 717 aa  55.8  0.0000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00304053  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  29.8 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  30.71 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  25.97 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  28.38 
 
 		 693 aa  55.5  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  26.79 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2248  Slt family transglycosylase  32.41 
 
 		 181 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.469686  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  30.08 
 
 		 202 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  26.79 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  26.62 
 
 		 690 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  28.57 
 
 		 182 aa  54.3  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0177  Lytic transglycosylase catalytic  32.14 
 
 		 429 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119021 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0365  Lytic transglycosylase catalytic  31.25 
 
 		 330 aa  54.3  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1960  secreted protein  32.41 
 
 		 181 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  25.78 
 
 		 661 aa  53.9  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0307  lytic transglycosylase, catalytic  33.01 
 
 		 332 aa  53.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0262  hypothetical protein  30.25 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447321 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  24.86 
 
 		 798 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  36.27 
 
 		 649 aa  52.8  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  35.09 
 
 		 438 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  36.27 
 
 		 649 aa  52.8  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  33.05 
 
 		 247 aa  52.8  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0652  lytic transglycosylase, catalytic  27.52 
 
 		 707 aa  52.4  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 603 aa  52.4  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3164  lytic transglycosylase, catalytic  32.35 
 
 		 284 aa  52.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.205276 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  30.33 
 
 		 282 aa  52  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  31.03 
 
 		 215 aa  52  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  33.98 
 
 		 260 aa  52  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  27.08 
 
 		 747 aa  52  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  23.08 
 
 		 263 aa  52  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2814  Lytic transglycosylase catalytic  43.06 
 
 		 342 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0364  lytic transglycosylase, catalytic  33.08 
 
 		 321 aa  51.2  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  33.98 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2727  lytic transglycosylase, catalytic  28.17 
 
 		 192 aa  51.6  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.742597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  29.17 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  36.56 
 
 		 748 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2397  lytic transglycosylase catalytic  44.44 
 
 		 375 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279322  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  25.5 
 
 		 660 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0850  lytic transglycosylase, catalytic  27.73 
 
 		 336 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0266609 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  34.51 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  26.87 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  37.11 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3185  lytic transglycosylase, catalytic  25.4 
 
 		 268 aa  50.1  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  31.29 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  35.64 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0675  lytic murein transglycosylase  33.67 
 
 		 642 aa  50.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.586863 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  29.37 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  33.85 
 
 		 651 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  33.85 
 
 		 651 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3554  lytic transglycosylase, catalytic  29.46 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  30.23 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>