More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1088 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 304 aa  613  9.999999999999999e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3533  lytic transglycosylase, catalytic  43.66 
 
 		 226 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2906  lytic transglycosylase, catalytic  37.44 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0327296  normal  0.0416217 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0709  hypothetical protein  36.41 
 
 		 362 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4954  lytic transglycosylase catalytic  45.03 
 
 		 303 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2657  lytic transglycosylase, catalytic  44.85 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00887082  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0766  lytic transglycosylase, catalytic  39.16 
 
 		 354 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.892374  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3099  Lytic transglycosylase catalytic  41.36 
 
 		 272 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0702  Lytic transglycosylase catalytic  39.22 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.417607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2697  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 		 355 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0658  Lytic transglycosylase catalytic  39.22 
 
 		 395 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.118125 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2873  lytic transglycosylase, catalytic  38.95 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113557  normal  0.33639 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2926  lytic transglycosylase catalytic  38.1 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1661  lytic transglycosylase, catalytic  44.44 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0474  lytic transglycosylase, catalytic  34.89 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2043  Lytic transglycosylase catalytic  44.44 
 
 		 279 aa  103  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.944666  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0953  lytic transglycosylase, catalytic  34.19 
 
 		 378 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0915  lytic transglycosylase catalytic  34.19 
 
 		 378 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.423978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2991  lytic transglycosylase, catalytic  42.61 
 
 		 295 aa  102  9e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.617808  normal  0.305104 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4054  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 		 370 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0823  lytic transglycosylase catalytic  37.75 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.600223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2444  lytic transglycosylase catalytic  39.1 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0812  lytic transglycosylase, catalytic  37.75 
 
 		 372 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0615  lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 		 404 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.659925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3105  Lytic transglycosylase catalytic  38.03 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2937  hypothetical protein  40.91 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.88861 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0889  transglycosylase SLT domain-containing lipoprotein  37.32 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2592  Slt family transglycosylase  38.73 
 
 		 319 aa  99.4  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0759  Slt family transglycosylase  38.73 
 
 		 337 aa  99.4  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.404866  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2021  Slt family transglycosylase  38.73 
 
 		 337 aa  99.4  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3021  Slt family transglycosylase  38.73 
 
 		 370 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.734248  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2149  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.73 
 
 		 370 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3074  Slt family transglycosylase  38.73 
 
 		 370 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3105  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.73 
 
 		 370 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1527  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.73 
 
 		 367 aa  97.8  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.165503  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3628  lytic transglycosylase, catalytic  39.57 
 
 		 252 aa  95.1  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0365  Lytic transglycosylase catalytic  37.01 
 
 		 330 aa  94.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0364  lytic transglycosylase, catalytic  36.03 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  34.29 
 
 		 201 aa  75.1  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  43.62 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  39.25 
 
 		 217 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0538  lytic transglycosylase, catalytic  42.48 
 
 		 194 aa  68.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.527113  hitchhiker  0.00520856 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  32.92 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  32.92 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  37.4 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  31.36 
 
 		 223 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1311  lytic transglycosylase, catalytic  27.23 
 
 		 177 aa  67  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  33.04 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  37.62 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0421  lytic transglycosylase, catalytic  36.76 
 
 		 190 aa  65.1  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.829572 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  46.43 
 
 		 661 aa  65.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  40.22 
 
 		 438 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2951  lytic transglycosylase, catalytic  38.4 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  46.43 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3693  Lytic transglycosylase catalytic  29.87 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00345887  hitchhiker  0.000000358582 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  41.58 
 
 		 603 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0643  lytic transglycosylase, catalytic  40.2 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.849619  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1010  lytic transglycosylase catalytic  34.91 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0664563  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  37.1 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0262  hypothetical protein  30.71 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447321 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4211  Lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0832  lytic transglycosylase, catalytic  31.43 
 
 		 218 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  35.96 
 
 		 442 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0006  lytic transglycosylase catalytic  39.66 
 
 		 154 aa  62  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  42.05 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0006  lytic transglycosylase, catalytic  39.66 
 
 		 154 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  42 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  42.05 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0518  putative signal peptide protein  38.46 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106136 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  37.37 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0088  Lytic transglycosylase catalytic  36.19 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1226  Lytic transglycosylase catalytic  37.62 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793802  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  39.58 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  40.18 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1794  lytic transglycosylase, catalytic  38.82 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  39.81 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0246  lytic transglycosylase, catalytic  25.69 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  37.63 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2113  hypothetical protein  33.79 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 190 aa  58.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  43.01 
 
 		 198 aa  58.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2296  Lytic transglycosylase catalytic  33.63 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000211124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  39.74 
 
 		 195 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5136  lytic transglycosylase catalytic  28.76 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206246  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  39.81 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  40.96 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0244  lytic transglycosylase catalytic  25 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0575  lytic transglycosylase catalytic  36.79 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.445014 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3221  lytic transglycosylase, catalytic  30.3 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5146  lytic transglycosylase, catalytic  30.3 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00474071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  37.96 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  37.76 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  38.64 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2563  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 228 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0148918  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0177  Lytic transglycosylase catalytic  38.64 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119021 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  37.96 
 
 		 209 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>