More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5063 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5063  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 228 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4539  lytic transglycosylase, catalytic  89.43 
 
 		 224 aa  345  5e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5136  lytic transglycosylase catalytic  85.09 
 
 		 228 aa  334  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3221  lytic transglycosylase, catalytic  85.09 
 
 		 228 aa  325  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5146  lytic transglycosylase, catalytic  85.09 
 
 		 228 aa  325  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00474071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0495  lytic transglycosylase, catalytic  85.33 
 
 		 252 aa  323  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.358787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3509  lytic transglycosylase catalytic  77.17 
 
 		 219 aa  299  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0262  hypothetical protein  53.93 
 
 		 217 aa  195  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447321 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3693  Lytic transglycosylase catalytic  66.91 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00345887  hitchhiker  0.000000358582 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  57.82 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  40.11 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  36.77 
 
 		 208 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  31.76 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0364  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0365  Lytic transglycosylase catalytic  31.06 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  31.08 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  31.4 
 
 		 261 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0915  lytic transglycosylase catalytic  27.78 
 
 		 378 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.423978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  29.05 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0953  lytic transglycosylase, catalytic  27.78 
 
 		 378 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  37.76 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  33.04 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  33.03 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0968  lytic transglycosylase, catalytic  27.74 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.669307  normal  0.333056 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  33.03 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  33.03 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2444  lytic transglycosylase catalytic  29.24 
 
 		 374 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  33.03 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  32.14 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  32.23 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4054  lytic transglycosylase, catalytic  28.02 
 
 		 370 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0088  Lytic transglycosylase catalytic  36 
 
 		 262 aa  65.1  0.0000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  36.84 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0615  lytic transglycosylase catalytic  28.16 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.659925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  38.3 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  37.11 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  37.11 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  36.36 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  36.56 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2873  lytic transglycosylase, catalytic  32.17 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113557  normal  0.33639 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3276  lytic transglycosylase, catalytic  41.18 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0474  lytic transglycosylase, catalytic  26.92 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  35.83 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0702  Lytic transglycosylase catalytic  27.5 
 
 		 394 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.417607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0812  lytic transglycosylase, catalytic  28.49 
 
 		 372 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0709  hypothetical protein  28.99 
 
 		 362 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0823  lytic transglycosylase catalytic  28.49 
 
 		 372 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.600223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0658  Lytic transglycosylase catalytic  28.99 
 
 		 395 aa  62  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.118125 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2697  lytic transglycosylase, catalytic  29.5 
 
 		 355 aa  62  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0766  lytic transglycosylase, catalytic  29.67 
 
 		 354 aa  62  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.892374  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2995  lytic transglycosylase, catalytic  29.41 
 
 		 287 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.891675  normal  0.0342596 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  33.54 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3105  Lytic transglycosylase catalytic  31.78 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  38.04 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2906  lytic transglycosylase, catalytic  33.08 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0327296  normal  0.0416217 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2149  transglycosylase SLT domain-containing protein  29.14 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1089  lytic transglycosylase catalytic  29.41 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3074  Slt family transglycosylase  29.14 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  37.25 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3105  transglycosylase SLT domain-containing protein  29.14 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2592  Slt family transglycosylase  29.14 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  38.2 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1527  transglycosylase SLT domain-containing protein  29.14 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.165503  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  35.44 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2021  Slt family transglycosylase  29.14 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0889  transglycosylase SLT domain-containing lipoprotein  31.16 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0759  Slt family transglycosylase  29.14 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.404866  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2904  soluble lytic transglycosylase  36.26 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2017  lytic transglycosylase, catalytic  31.2 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275292  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  24.1 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3021  Slt family transglycosylase  29.14 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.734248  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  42.47 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2866  Lytic transglycosylase catalytic  33.93 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918978  normal  0.297415 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  35.79 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  42.47 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3628  lytic transglycosylase, catalytic  32.31 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4351  lytic transglycosylase catalytic  31.21 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.744622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  35.87 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  34.65 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  33.13 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  32.69 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  33.68 
 
 		 282 aa  58.5  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  34.78 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  33.12 
 
 		 253 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4954  lytic transglycosylase catalytic  32.31 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  31.15 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2991  lytic transglycosylase, catalytic  31.69 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.617808  normal  0.305104 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 724 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  30.33 
 
 		 747 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  35.35 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  36.46 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1733  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254136  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  39.73 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2606  Lytic transglycosylase catalytic  31.36 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  34 
 
 		 782 aa  56.2  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  39.19 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3533  lytic transglycosylase, catalytic  29.32 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  33.04 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>