More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2873 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2873  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113557  normal  0.33639 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2906  lytic transglycosylase, catalytic  67.1 
 
 		 306 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0327296  normal  0.0416217 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3099  Lytic transglycosylase catalytic  65.44 
 
 		 272 aa  352  5e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2991  lytic transglycosylase, catalytic  64.01 
 
 		 295 aa  350  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.617808  normal  0.305104 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2657  lytic transglycosylase, catalytic  72.41 
 
 		 267 aa  350  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00887082  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1661  lytic transglycosylase, catalytic  72.1 
 
 		 279 aa  349  4e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2043  Lytic transglycosylase catalytic  71.67 
 
 		 279 aa  347  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.944666  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4954  lytic transglycosylase catalytic  63.81 
 
 		 303 aa  333  3e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2937  hypothetical protein  56.41 
 
 		 306 aa  296  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.88861 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3628  lytic transglycosylase, catalytic  67.44 
 
 		 252 aa  291  7e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2926  lytic transglycosylase catalytic  51.66 
 
 		 311 aa  272  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2444  lytic transglycosylase catalytic  55.68 
 
 		 374 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2592  Slt family transglycosylase  53.45 
 
 		 319 aa  178  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2021  Slt family transglycosylase  53.45 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0759  Slt family transglycosylase  53.45 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.404866  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0658  Lytic transglycosylase catalytic  51.91 
 
 		 395 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.118125 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3074  Slt family transglycosylase  53.45 
 
 		 370 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2149  transglycosylase SLT domain-containing protein  53.45 
 
 		 370 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0702  Lytic transglycosylase catalytic  52.43 
 
 		 394 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.417607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3105  transglycosylase SLT domain-containing protein  53.45 
 
 		 370 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4054  lytic transglycosylase, catalytic  53.98 
 
 		 370 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1527  transglycosylase SLT domain-containing protein  53.45 
 
 		 367 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.165503  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3105  Lytic transglycosylase catalytic  55.35 
 
 		 393 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3021  Slt family transglycosylase  53.45 
 
 		 370 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.734248  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0889  transglycosylase SLT domain-containing lipoprotein  54.09 
 
 		 398 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0474  lytic transglycosylase, catalytic  53.71 
 
 		 378 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0709  hypothetical protein  56.17 
 
 		 362 aa  176  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0915  lytic transglycosylase catalytic  53.71 
 
 		 378 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.423978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0823  lytic transglycosylase catalytic  53.41 
 
 		 372 aa  175  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.600223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0812  lytic transglycosylase, catalytic  53.41 
 
 		 372 aa  175  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0953  lytic transglycosylase, catalytic  53.71 
 
 		 378 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2697  lytic transglycosylase, catalytic  58.33 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0615  lytic transglycosylase catalytic  49.44 
 
 		 404 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.659925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0766  lytic transglycosylase, catalytic  56.85 
 
 		 354 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.892374  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0365  Lytic transglycosylase catalytic  47.56 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0364  lytic transglycosylase, catalytic  47.56 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3533  lytic transglycosylase, catalytic  44.83 
 
 		 226 aa  123  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  38.95 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5136  lytic transglycosylase catalytic  34.62 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3221  lytic transglycosylase, catalytic  33.56 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5146  lytic transglycosylase, catalytic  33.56 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00474071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  36.8 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5063  lytic transglycosylase catalytic  32.17 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  32.24 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  36.13 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0495  lytic transglycosylase, catalytic  32.17 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.358787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  45.45 
 
 		 639 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  45.45 
 
 		 639 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  45.45 
 
 		 639 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1794  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 		 152 aa  61.6  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4539  lytic transglycosylase, catalytic  33.85 
 
 		 224 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  39.78 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  46.15 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1297  lytic transglycosylase, catalytic  30.23 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  29.37 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2563  Lytic transglycosylase catalytic  31.85 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0148918  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  30.92 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0538  lytic transglycosylase, catalytic  36.11 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.527113  hitchhiker  0.00520856 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  40.48 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2659  Lytic transglycosylase catalytic  31.85 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.725375  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  41.98 
 
 		 661 aa  57.4  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  31.18 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3509  lytic transglycosylase catalytic  32.31 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  31.39 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  40.22 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2951  lytic transglycosylase, catalytic  32.3 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2468  lytic transglycosylase catalytic  31.62 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  36.56 
 
 		 245 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  36.05 
 
 		 241 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  42.31 
 
 		 198 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  34.33 
 
 		 777 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1275  lytic transglycosylase, catalytic  38.71 
 
 		 185 aa  55.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  38.95 
 
 		 285 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  31.58 
 
 		 198 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  44.16 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  45.83 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  33.61 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  44.16 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3693  Lytic transglycosylase catalytic  32.74 
 
 		 227 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00345887  hitchhiker  0.000000358582 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  28.79 
 
 		 203 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  32.59 
 
 		 175 aa  53.9  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0832  lytic transglycosylase, catalytic  37.62 
 
 		 218 aa  54.3  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  31.58 
 
 		 206 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  30 
 
 		 263 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  45.45 
 
 		 204 aa  53.5  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  30.87 
 
 		 251 aa  53.1  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  36.73 
 
 		 207 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  27.47 
 
 		 216 aa  53.1  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  30.08 
 
 		 202 aa  52.8  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3099  lytic transglycosylase, catalytic  29.49 
 
 		 251 aa  52.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  34.55 
 
 		 196 aa  52.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0776  Lytic transglycosylase catalytic  39.13 
 
 		 218 aa  52.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0847  lytic transglycosylase, catalytic  39.13 
 
 		 218 aa  52.8  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  38.71 
 
 		 245 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3009  lytic transglycosylase catalytic  32.73 
 
 		 238 aa  52.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  31.51 
 
 		 256 aa  52.4  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15830  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  34.78 
 
 		 414 aa  52.4  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103964  normal  0.0951382 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  37.66 
 
 		 280 aa  52.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2391  lytic transglycosylase, catalytic  44.16 
 
 		 228 aa  52.4  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0262  hypothetical protein  31.86 
 
 		 217 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>