More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2951 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2951  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 241 aa  487  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3099  lytic transglycosylase, catalytic  83.05 
 
 		 251 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  69.51 
 
 		 253 aa  340  2e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  69.26 
 
 		 253 aa  335  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  69.17 
 
 		 245 aa  330  9e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0518  putative signal peptide protein  67.17 
 
 		 206 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106136 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0832  lytic transglycosylase, catalytic  65.75 
 
 		 218 aa  255  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0744  lytic transglycosylase, catalytic  59.7 
 
 		 221 aa  249  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0220327 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4211  Lytic transglycosylase catalytic  62.3 
 
 		 219 aa  245  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3669  lytic transglycosylase, catalytic  63.93 
 
 		 226 aa  244  6.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0776  Lytic transglycosylase catalytic  61.5 
 
 		 218 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0847  lytic transglycosylase, catalytic  61.5 
 
 		 218 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2391  lytic transglycosylase, catalytic  65.14 
 
 		 228 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0575  lytic transglycosylase catalytic  65.38 
 
 		 223 aa  242  3.9999999999999997e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.445014 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1275  lytic transglycosylase, catalytic  64.25 
 
 		 185 aa  240  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5480  lytic transglycosylase catalytic  62.03 
 
 		 194 aa  239  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0643  lytic transglycosylase, catalytic  60.21 
 
 		 203 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.849619  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0421  lytic transglycosylase, catalytic  59.47 
 
 		 190 aa  215  5e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.829572 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1226  Lytic transglycosylase catalytic  56.92 
 
 		 221 aa  207  8e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793802  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2113  hypothetical protein  53.59 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  50.37 
 
 		 190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0538  lytic transglycosylase, catalytic  52.63 
 
 		 194 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.527113  hitchhiker  0.00520856 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  49.62 
 
 		 175 aa  137  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  36.81 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  36.76 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  45.74 
 
 		 206 aa  75.1  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  34.82 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  36.84 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  44.09 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  39.39 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1892  Lytic transglycosylase catalytic  40.32 
 
 		 643 aa  65.5  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  38.4 
 
 		 304 aa  65.5  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  32.37 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  37.62 
 
 		 201 aa  65.1  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  38.37 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  36.78 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  37.21 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  41.58 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  37.93 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  38.37 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  37.93 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2296  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000211124  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  37.21 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  37.21 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  38.79 
 
 		 657 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  37.89 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  38.37 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  39.64 
 
 		 678 aa  63.2  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  36.27 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  38.79 
 
 		 657 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  38.37 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  38.37 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  37.21 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  36.73 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  38.3 
 
 		 671 aa  62.4  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  38.37 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  37.21 
 
 		 259 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  39.29 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  38.61 
 
 		 664 aa  61.6  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2926  lytic transglycosylase catalytic  38.53 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  34.88 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  36.08 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  39.8 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  37.5 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4054  lytic transglycosylase, catalytic  34.97 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  34.31 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  36.46 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2874  Lytic transglycosylase catalytic  38 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0680806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  37.08 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  39.8 
 
 		 660 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0823  lytic transglycosylase catalytic  33.56 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.600223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  41.86 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  39.8 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  36.19 
 
 		 654 aa  60.1  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  39.18 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  42.7 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  41.49 
 
 		 659 aa  60.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0812  lytic transglycosylase, catalytic  33.8 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  37.21 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  33.87 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  35.09 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  40.82 
 
 		 663 aa  59.3  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  32.59 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2248  Slt family transglycosylase  32.82 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.469686  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  32.26 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0615  lytic transglycosylase catalytic  31.85 
 
 		 404 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.659925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0512  Lytic transglycosylase catalytic  41.32 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.318275 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  34.69 
 
 		 709 aa  58.9  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  39.53 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  35.71 
 
 		 709 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  38.95 
 
 		 690 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  33.05 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3276  lytic transglycosylase, catalytic  39.24 
 
 		 152 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0265  transglycosylase SLT domain protein  37.84 
 
 		 717 aa  58.2  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00304053  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0474  lytic transglycosylase, catalytic  32.39 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0953  lytic transglycosylase, catalytic  32.39 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1960  secreted protein  35.35 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0915  lytic transglycosylase catalytic  32.39 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.423978  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>