More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0643 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0643  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 203 aa  418  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.849619  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1226  Lytic transglycosylase catalytic  70.59 
 
 		 221 aa  257  7e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793802  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0421  lytic transglycosylase, catalytic  66.67 
 
 		 190 aa  251  6e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.829572 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2113  hypothetical protein  60.3 
 
 		 210 aa  250  9.000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  55.67 
 
 		 253 aa  218  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  55.17 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3099  lytic transglycosylase, catalytic  58.08 
 
 		 251 aa  215  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  56.7 
 
 		 245 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2951  lytic transglycosylase, catalytic  60.11 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3669  lytic transglycosylase, catalytic  53.68 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0518  putative signal peptide protein  57.14 
 
 		 206 aa  193  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106136 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0832  lytic transglycosylase, catalytic  52.88 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4211  Lytic transglycosylase catalytic  54.95 
 
 		 219 aa  186  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0847  lytic transglycosylase, catalytic  52.66 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0776  Lytic transglycosylase catalytic  52.66 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5480  lytic transglycosylase catalytic  51.04 
 
 		 194 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0575  lytic transglycosylase catalytic  55.17 
 
 		 223 aa  183  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.445014 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1275  lytic transglycosylase, catalytic  53.33 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0744  lytic transglycosylase, catalytic  52.41 
 
 		 221 aa  180  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0220327 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0538  lytic transglycosylase, catalytic  51.93 
 
 		 194 aa  177  8e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.527113  hitchhiker  0.00520856 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2391  lytic transglycosylase, catalytic  53.85 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  49.43 
 
 		 190 aa  162  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  44.81 
 
 		 175 aa  151  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  46.81 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  45.83 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  41.23 
 
 		 603 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  34.58 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  29.89 
 
 		 261 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  29.89 
 
 		 261 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  29.73 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  30.68 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  40.2 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  29.31 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  29.31 
 
 		 261 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  29.31 
 
 		 261 aa  61.2  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  31.67 
 
 		 678 aa  60.1  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  34.58 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  40.86 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  34.51 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  29.31 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  36.54 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  37.65 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  31.25 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3276  lytic transglycosylase, catalytic  40.74 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  29.31 
 
 		 261 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  40.45 
 
 		 244 aa  58.2  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  29.89 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  38.54 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  35.34 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  29.31 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  31.97 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  36.17 
 
 		 241 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  32.81 
 
 		 649 aa  56.6  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  29.25 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  32.81 
 
 		 649 aa  56.6  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  41.11 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  37.89 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  39.76 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  31.36 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  40 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0265  transglycosylase SLT domain protein  32.79 
 
 		 717 aa  56.2  0.0000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00304053  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  38.82 
 
 		 438 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0177  Lytic transglycosylase catalytic  38.83 
 
 		 429 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119021 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6207  Lytic transglycosylase catalytic  32.5 
 
 		 390 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287429  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  32.73 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  35.09 
 
 		 690 aa  55.5  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  36.59 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  37.62 
 
 		 782 aa  55.5  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  40.45 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  29.82 
 
 		 279 aa  55.1  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  37.14 
 
 		 280 aa  55.1  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  31.64 
 
 		 296 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  36.61 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3231  Peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 390 aa  54.7  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0309569 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  37.21 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  35.79 
 
 		 777 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2874  Lytic transglycosylase catalytic  37.86 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0680806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  38.55 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  38.82 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  39.33 
 
 		 245 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  39.32 
 
 		 182 aa  53.9  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  37.78 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8299  Lytic transglycosylase catalytic  32.71 
 
 		 325 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103911  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  36.73 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2296  Lytic transglycosylase catalytic  37.21 
 
 		 271 aa  52.8  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000211124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  35.56 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  33.88 
 
 		 226 aa  52.8  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1010  lytic transglycosylase catalytic  36.9 
 
 		 153 aa  53.1  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0664563  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2563  Lytic transglycosylase catalytic  32.26 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0148918  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4054  lytic transglycosylase, catalytic  35.04 
 
 		 370 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3693  Lytic transglycosylase catalytic  32.61 
 
 		 227 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00345887  hitchhiker  0.000000358582 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 296 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  35.87 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2543  Lytic transglycosylase catalytic  30.5 
 
 		 249 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  38.75 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3628  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 252 aa  52.8  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  33.61 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2165  lytic transglycosylase catalytic  34.71 
 
 		 499 aa  52.4  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0915  lytic transglycosylase catalytic  34.82 
 
 		 378 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.423978  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>