More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1226 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1226  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793802  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0643  lytic transglycosylase, catalytic  67.88 
 
 		 203 aa  271  5.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.849619  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0421  lytic transglycosylase, catalytic  67.8 
 
 		 190 aa  257  8e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.829572 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2113  hypothetical protein  58.21 
 
 		 210 aa  250  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  55.46 
 
 		 245 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  55.07 
 
 		 253 aa  221  8e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  55.91 
 
 		 253 aa  221  9e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3099  lytic transglycosylase, catalytic  56.37 
 
 		 251 aa  215  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2951  lytic transglycosylase, catalytic  56.57 
 
 		 241 aa  211  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0518  putative signal peptide protein  54.46 
 
 		 206 aa  203  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106136 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0832  lytic transglycosylase, catalytic  53.54 
 
 		 218 aa  203  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0575  lytic transglycosylase catalytic  58.19 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.445014 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3669  lytic transglycosylase, catalytic  54.27 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1275  lytic transglycosylase, catalytic  55.8 
 
 		 185 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4211  Lytic transglycosylase catalytic  55.26 
 
 		 219 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0847  lytic transglycosylase, catalytic  54.77 
 
 		 218 aa  197  7.999999999999999e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0776  Lytic transglycosylase catalytic  54.55 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5480  lytic transglycosylase catalytic  53.61 
 
 		 194 aa  195  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0744  lytic transglycosylase, catalytic  50.26 
 
 		 221 aa  191  5e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0220327 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2391  lytic transglycosylase, catalytic  53.59 
 
 		 228 aa  184  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0538  lytic transglycosylase, catalytic  51.4 
 
 		 194 aa  166  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.527113  hitchhiker  0.00520856 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  49.09 
 
 		 175 aa  156  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  55.97 
 
 		 190 aa  155  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 217 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  37.5 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  39.45 
 
 		 603 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  35.34 
 
 		 282 aa  67  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  37.62 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  31.16 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0265  transglycosylase SLT domain protein  35 
 
 		 717 aa  60.5  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00304053  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  33.33 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2468  lytic transglycosylase catalytic  42.06 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  35.25 
 
 		 678 aa  60.1  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  36.97 
 
 		 649 aa  60.1  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  30.38 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  36.79 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  38.61 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  39.13 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  36.97 
 
 		 649 aa  59.7  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  35.64 
 
 		 782 aa  58.5  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  34.02 
 
 		 661 aa  58.2  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  32.99 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  34.82 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  36.46 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  39.8 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3276  lytic transglycosylase, catalytic  38.75 
 
 		 152 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  38.71 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8299  Lytic transglycosylase catalytic  34.95 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103911  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  37.11 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  34.04 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  32.14 
 
 		 664 aa  55.8  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3693  Lytic transglycosylase catalytic  29.71 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00345887  hitchhiker  0.000000358582 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  37.65 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  32.17 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  31.86 
 
 		 833 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  37 
 
 		 690 aa  54.7  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  36.47 
 
 		 438 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  37.89 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  38.54 
 
 		 281 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  34.51 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  37.23 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  31.02 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  39.36 
 
 		 657 aa  53.1  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  29.9 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  37.08 
 
 		 442 aa  53.5  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  39.36 
 
 		 657 aa  53.1  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  32.74 
 
 		 263 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1133  lytic transglycosylase catalytic  33.79 
 
 		 282 aa  52.8  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  35.14 
 
 		 256 aa  52.8  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3509  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  37.25 
 
 		 254 aa  53.1  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3847  lytic transglycosylase, catalytic  38.38 
 
 		 240 aa  52.8  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.081015  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2874  Lytic transglycosylase catalytic  35.92 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0680806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1297  lytic transglycosylase, catalytic  37.25 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0262  hypothetical protein  28.57 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447321 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  31.68 
 
 		 198 aa  52.4  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  35.29 
 
 		 261 aa  52  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  35.29 
 
 		 261 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1892  Lytic transglycosylase catalytic  38.54 
 
 		 643 aa  52  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 661 aa  52.4  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  36.47 
 
 		 204 aa  52.4  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  26.5 
 
 		 187 aa  52  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  35.29 
 
 		 261 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2296  Lytic transglycosylase catalytic  31.37 
 
 		 271 aa  52  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000211124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  35.29 
 
 		 261 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  34.38 
 
 		 222 aa  52  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  36.56 
 
 		 218 aa  51.6  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  29.79 
 
 		 715 aa  51.6  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  32.97 
 
 		 235 aa  51.6  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  32.52 
 
 		 296 aa  52  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  31.58 
 
 		 777 aa  51.6  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  32.82 
 
 		 285 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  34.38 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  35.29 
 
 		 261 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2165  lytic transglycosylase catalytic  37.63 
 
 		 499 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  28.36 
 
 		 637 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2007  lytic transglycosylase, catalytic  29.58 
 
 		 278 aa  51.2  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00437999  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0915  lytic transglycosylase catalytic  32.38 
 
 		 378 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.423978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0953  lytic transglycosylase, catalytic  32.38 
 
 		 378 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>