268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2113 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2113  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  426  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0643  lytic transglycosylase, catalytic  60.3 
 
 		 203 aa  250  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.849619  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0421  lytic transglycosylase, catalytic  62.37 
 
 		 190 aa  249  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.829572 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1226  Lytic transglycosylase catalytic  59.78 
 
 		 221 aa  239  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793802  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3099  lytic transglycosylase, catalytic  55.61 
 
 		 251 aa  213  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  54.4 
 
 		 253 aa  201  8e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0518  putative signal peptide protein  57.44 
 
 		 206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106136 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  53.89 
 
 		 253 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  52.97 
 
 		 245 aa  197  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2951  lytic transglycosylase, catalytic  54.79 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3669  lytic transglycosylase, catalytic  53.12 
 
 		 226 aa  184  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0575  lytic transglycosylase catalytic  55.93 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.445014 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5480  lytic transglycosylase catalytic  51.56 
 
 		 194 aa  182  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0832  lytic transglycosylase, catalytic  52.13 
 
 		 218 aa  182  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0776  Lytic transglycosylase catalytic  51.56 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0847  lytic transglycosylase, catalytic  51.56 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4211  Lytic transglycosylase catalytic  51.81 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0744  lytic transglycosylase, catalytic  51.89 
 
 		 221 aa  175  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0220327 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1275  lytic transglycosylase, catalytic  52.75 
 
 		 185 aa  174  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2391  lytic transglycosylase, catalytic  54.6 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0538  lytic transglycosylase, catalytic  47.78 
 
 		 194 aa  162  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.527113  hitchhiker  0.00520856 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  46.2 
 
 		 190 aa  148  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  39.76 
 
 		 175 aa  131  7.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  43.62 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  40.4 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  36.62 
 
 		 281 aa  65.1  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  41.05 
 
 		 603 aa  61.6  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  37.01 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  37.62 
 
 		 661 aa  61.6  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  38.93 
 
 		 782 aa  61.2  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  31.13 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  33.93 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  34.82 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  33.79 
 
 		 304 aa  58.5  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  38.78 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  28.49 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2444  lytic transglycosylase catalytic  39.82 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4054  lytic transglycosylase, catalytic  43.68 
 
 		 370 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  33.93 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  34.01 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  38.2 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0474  lytic transglycosylase, catalytic  38.94 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0823  lytic transglycosylase catalytic  40.38 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.600223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0953  lytic transglycosylase, catalytic  40.38 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0915  lytic transglycosylase catalytic  40.38 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.423978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  38.38 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  31.73 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2937  hypothetical protein  37.17 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.88861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0812  lytic transglycosylase, catalytic  40.38 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  37.86 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  33.96 
 
 		 833 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2346  Lytic transglycosylase catalytic  31.3 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  33.9 
 
 		 300 aa  54.3  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  35.48 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1297  lytic transglycosylase, catalytic  34.91 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3276  lytic transglycosylase, catalytic  36.45 
 
 		 152 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  33.9 
 
 		 292 aa  54.3  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  28.35 
 
 		 296 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  37.08 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  35.79 
 
 		 777 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0265  transglycosylase SLT domain protein  30.95 
 
 		 717 aa  53.1  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00304053  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  33.33 
 
 		 690 aa  52.8  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8299  Lytic transglycosylase catalytic  34.31 
 
 		 325 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103911  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6207  Lytic transglycosylase catalytic  33.06 
 
 		 390 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287429  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  31.73 
 
 		 235 aa  52.4  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  31.31 
 
 		 251 aa  52.4  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  34.34 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  29.36 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  31.48 
 
 		 189 aa  52.4  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  36.67 
 
 		 362 aa  52.4  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2659  Lytic transglycosylase catalytic  33.02 
 
 		 228 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.725375  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3164  lytic transglycosylase, catalytic  34.81 
 
 		 284 aa  52  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.205276 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2690  lytic transglycosylase catalytic  36.26 
 
 		 800 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 215 aa  52  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 		 283 aa  52  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  38.27 
 
 		 258 aa  52  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  32.61 
 
 		 278 aa  51.6  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3427  Lytic transglycosylase catalytic  27.52 
 
 		 295 aa  51.6  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2697  lytic transglycosylase, catalytic  32.71 
 
 		 355 aa  51.6  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2563  Lytic transglycosylase catalytic  33.96 
 
 		 228 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0148918  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  36.67 
 
 		 362 aa  51.6  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2874  Lytic transglycosylase catalytic  36 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0680806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2592  Slt family transglycosylase  37.5 
 
 		 319 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  34.15 
 
 		 271 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2149  transglycosylase SLT domain-containing protein  37.5 
 
 		 370 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3105  transglycosylase SLT domain-containing protein  37.5 
 
 		 370 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2926  lytic transglycosylase catalytic  32.5 
 
 		 311 aa  51.2  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1527  transglycosylase SLT domain-containing protein  37.5 
 
 		 367 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.165503  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  29.87 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3021  Slt family transglycosylase  37.5 
 
 		 370 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.734248  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0759  Slt family transglycosylase  37.5 
 
 		 337 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.404866  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3565  Lytic transglycosylase catalytic  36.27 
 
 		 158 aa  50.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0512  Lytic transglycosylase catalytic  41.24 
 
 		 154 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.318275 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  32.23 
 
 		 649 aa  51.2  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3074  Slt family transglycosylase  37.5 
 
 		 370 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  37.76 
 
 		 261 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2021  Slt family transglycosylase  37.5 
 
 		 337 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  34.75 
 
 		 678 aa  51.2  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  30.4 
 
 		 715 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  32.23 
 
 		 649 aa  51.2  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>