191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0812 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0823  lytic transglycosylase catalytic  99.73 
 
 		 372 aa  746    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.600223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0812  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 372 aa  746    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0953  lytic transglycosylase, catalytic  86.39 
 
 		 378 aa  628  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0474  lytic transglycosylase, catalytic  86.13 
 
 		 378 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0915  lytic transglycosylase catalytic  86.13 
 
 		 378 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.423978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4054  lytic transglycosylase, catalytic  87.2 
 
 		 370 aa  622  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2444  lytic transglycosylase catalytic  85.11 
 
 		 374 aa  590  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2149  transglycosylase SLT domain-containing protein  70.4 
 
 		 370 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3105  transglycosylase SLT domain-containing protein  70.4 
 
 		 370 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1527  transglycosylase SLT domain-containing protein  70.97 
 
 		 367 aa  496  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.165503  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3021  Slt family transglycosylase  70.45 
 
 		 370 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.734248  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3074  Slt family transglycosylase  70.4 
 
 		 370 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3105  Lytic transglycosylase catalytic  61.06 
 
 		 393 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0759  Slt family transglycosylase  69.01 
 
 		 337 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.404866  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2021  Slt family transglycosylase  69.01 
 
 		 337 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0889  transglycosylase SLT domain-containing lipoprotein  58 
 
 		 398 aa  425  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0615  lytic transglycosylase catalytic  56.39 
 
 		 404 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.659925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2592  Slt family transglycosylase  68.21 
 
 		 319 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0702  Lytic transglycosylase catalytic  57.79 
 
 		 394 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.417607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2697  lytic transglycosylase, catalytic  64.88 
 
 		 355 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0658  Lytic transglycosylase catalytic  57.73 
 
 		 395 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.118125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0709  hypothetical protein  52.3 
 
 		 362 aa  223  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0766  lytic transglycosylase, catalytic  63.53 
 
 		 354 aa  222  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.892374  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2926  lytic transglycosylase catalytic  50.75 
 
 		 311 aa  186  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2937  hypothetical protein  57.42 
 
 		 306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.88861 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2991  lytic transglycosylase, catalytic  56.44 
 
 		 295 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.617808  normal  0.305104 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2043  Lytic transglycosylase catalytic  56 
 
 		 279 aa  182  7e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.944666  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1661  lytic transglycosylase, catalytic  56 
 
 		 279 aa  182  7e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2657  lytic transglycosylase, catalytic  56.02 
 
 		 267 aa  182  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00887082  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4954  lytic transglycosylase catalytic  51.87 
 
 		 303 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3628  lytic transglycosylase, catalytic  55.13 
 
 		 252 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3099  Lytic transglycosylase catalytic  54.22 
 
 		 272 aa  178  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2873  lytic transglycosylase, catalytic  53.41 
 
 		 296 aa  175  9e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113557  normal  0.33639 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2906  lytic transglycosylase, catalytic  47.92 
 
 		 306 aa  169  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0327296  normal  0.0416217 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0364  lytic transglycosylase, catalytic  44.19 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0365  Lytic transglycosylase catalytic  42.69 
 
 		 330 aa  147  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3533  lytic transglycosylase, catalytic  46.21 
 
 		 226 aa  122  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  37.75 
 
 		 304 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  35.66 
 
 		 245 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0495  lytic transglycosylase, catalytic  28.74 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.358787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5136  lytic transglycosylase catalytic  30.56 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3221  lytic transglycosylase, catalytic  30.56 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5146  lytic transglycosylase, catalytic  30.56 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00474071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3796  lytic transglycosylase, catalytic  33.06 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.823369  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  31.82 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2951  lytic transglycosylase, catalytic  33.56 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  34 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4539  lytic transglycosylase, catalytic  30.37 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  34.71 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  30.99 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5063  lytic transglycosylase catalytic  30.37 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  31.11 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0575  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.445014 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3509  lytic transglycosylase catalytic  29.17 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  34.82 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2113  hypothetical protein  40.38 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  33.78 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3693  Lytic transglycosylase catalytic  28.75 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00345887  hitchhiker  0.000000358582 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0832  lytic transglycosylase, catalytic  34.31 
 
 		 218 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0262  hypothetical protein  29.53 
 
 		 217 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447321 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1275  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 185 aa  54.3  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0518  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 206 aa  53.9  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106136 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  37.89 
 
 		 782 aa  53.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3099  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 251 aa  53.5  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1794  lytic transglycosylase, catalytic  38.82 
 
 		 152 aa  53.1  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3669  lytic transglycosylase, catalytic  32.74 
 
 		 226 aa  53.1  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0421  lytic transglycosylase, catalytic  34 
 
 		 190 aa  52.8  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.829572 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0643  lytic transglycosylase, catalytic  31.91 
 
 		 203 aa  52.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.849619  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  32.17 
 
 		 777 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0538  lytic transglycosylase, catalytic  38.37 
 
 		 194 aa  52.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.527113  hitchhiker  0.00520856 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2391  lytic transglycosylase, catalytic  33.66 
 
 		 228 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0248  Lytic transglycosylase catalytic  34.26 
 
 		 168 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 190 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2468  lytic transglycosylase catalytic  32.64 
 
 		 234 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1226  Lytic transglycosylase catalytic  32.38 
 
 		 221 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793802  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1431  lytic transglycosylase, catalytic  31.9 
 
 		 170 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  37.61 
 
 		 280 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  38.1 
 
 		 251 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 442 aa  50.8  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  35.44 
 
 		 648 aa  50.4  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  37.29 
 
 		 603 aa  50.4  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0195  lytic transglycosylase catalytic protein  25.19 
 
 		 239 aa  50.4  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2210  lytic transglycosylase catalytic  33.17 
 
 		 725 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847947  normal  0.0413346 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0744  lytic transglycosylase, catalytic  32.35 
 
 		 221 aa  50.1  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0220327 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0088  Lytic transglycosylase catalytic  36.11 
 
 		 262 aa  50.1  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  39.08 
 
 		 198 aa  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1010  lytic transglycosylase catalytic  37.21 
 
 		 153 aa  49.7  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0664563  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4211  Lytic transglycosylase catalytic  32.69 
 
 		 219 aa  49.7  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0847  lytic transglycosylase, catalytic  30.97 
 
 		 218 aa  49.7  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0776  Lytic transglycosylase catalytic  30.97 
 
 		 218 aa  49.3  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  37.5 
 
 		 241 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  36.78 
 
 		 182 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1098  Lytic transglycosylase catalytic  27.5 
 
 		 213 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.891571  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  29.37 
 
 		 233 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0177  Lytic transglycosylase catalytic  24.43 
 
 		 239 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000012846 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0193  lytic transglycosylase, catalytic  34.26 
 
 		 168 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  35.87 
 
 		 833 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  36.46 
 
 		 214 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>