More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4954 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4954  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 303 aa  609  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2991  lytic transglycosylase, catalytic  66.89 
 
 		 295 aa  381  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.617808  normal  0.305104 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1661  lytic transglycosylase, catalytic  73.95 
 
 		 279 aa  360  1e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2043  Lytic transglycosylase catalytic  73.53 
 
 		 279 aa  359  3e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.944666  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2657  lytic transglycosylase, catalytic  66.8 
 
 		 267 aa  345  5e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00887082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2873  lytic transglycosylase, catalytic  63.14 
 
 		 296 aa  334  1e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113557  normal  0.33639 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3099  Lytic transglycosylase catalytic  63.02 
 
 		 272 aa  320  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3628  lytic transglycosylase, catalytic  62.81 
 
 		 252 aa  295  4e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2906  lytic transglycosylase, catalytic  54.9 
 
 		 306 aa  294  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0327296  normal  0.0416217 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2926  lytic transglycosylase catalytic  53.49 
 
 		 311 aa  285  9e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2937  hypothetical protein  59.66 
 
 		 306 aa  280  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.88861 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3105  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 393 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0702  Lytic transglycosylase catalytic  53 
 
 		 394 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.417607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0658  Lytic transglycosylase catalytic  54.26 
 
 		 395 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.118125 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2592  Slt family transglycosylase  55.19 
 
 		 319 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2021  Slt family transglycosylase  55.19 
 
 		 337 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0759  Slt family transglycosylase  55.19 
 
 		 337 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.404866  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3021  Slt family transglycosylase  55.19 
 
 		 370 aa  188  9e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.734248  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2149  transglycosylase SLT domain-containing protein  53.72 
 
 		 370 aa  188  9e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3105  transglycosylase SLT domain-containing protein  53.72 
 
 		 370 aa  188  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3074  Slt family transglycosylase  53.72 
 
 		 370 aa  188  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1527  transglycosylase SLT domain-containing protein  55.19 
 
 		 367 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.165503  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2697  lytic transglycosylase, catalytic  58.43 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0709  hypothetical protein  58.33 
 
 		 362 aa  185  8e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0766  lytic transglycosylase, catalytic  56.89 
 
 		 354 aa  185  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.892374  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0889  transglycosylase SLT domain-containing lipoprotein  57.62 
 
 		 398 aa  185  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0615  lytic transglycosylase catalytic  51.12 
 
 		 404 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.659925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2444  lytic transglycosylase catalytic  54.39 
 
 		 374 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0823  lytic transglycosylase catalytic  49.26 
 
 		 372 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.600223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0474  lytic transglycosylase, catalytic  54.22 
 
 		 378 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0915  lytic transglycosylase catalytic  54.22 
 
 		 378 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.423978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0953  lytic transglycosylase, catalytic  54.22 
 
 		 378 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0812  lytic transglycosylase, catalytic  54.39 
 
 		 372 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4054  lytic transglycosylase, catalytic  54.22 
 
 		 370 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0365  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 330 aa  142  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0364  lytic transglycosylase, catalytic  47.71 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3533  lytic transglycosylase, catalytic  48.15 
 
 		 226 aa  122  9e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  45.03 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  37.82 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  31.61 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5136  lytic transglycosylase catalytic  32.61 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3221  lytic transglycosylase, catalytic  32.61 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5146  lytic transglycosylase, catalytic  32.61 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00474071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2468  lytic transglycosylase catalytic  35.25 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  37.11 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  39.29 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1297  lytic transglycosylase, catalytic  38.64 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2563  Lytic transglycosylase catalytic  38.64 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0148918  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  42.86 
 
 		 639 aa  59.3  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  42.86 
 
 		 639 aa  58.9  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  42.86 
 
 		 639 aa  58.9  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2659  Lytic transglycosylase catalytic  38.64 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.725375  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1794  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 		 152 aa  58.9  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2951  lytic transglycosylase, catalytic  33.12 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0495  lytic transglycosylase, catalytic  32.61 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.358787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5063  lytic transglycosylase catalytic  29.84 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  30.81 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  34.07 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  40.21 
 
 		 280 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  38.96 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  31.25 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  36.05 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  40.24 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  35.19 
 
 		 777 aa  55.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  35.48 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3765  lytic transglycosylase, catalytic  30.06 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  38.75 
 
 		 661 aa  55.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4539  lytic transglycosylase, catalytic  31.54 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628549  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  31.82 
 
 		 196 aa  53.9  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  41.89 
 
 		 247 aa  53.9  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  34.78 
 
 		 690 aa  53.9  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0399  Lytic transglycosylase catalytic  32.77 
 
 		 574 aa  54.3  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  37.63 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  34.55 
 
 		 207 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3509  lytic transglycosylase catalytic  29.56 
 
 		 219 aa  53.9  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  40.24 
 
 		 282 aa  53.5  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  32.8 
 
 		 175 aa  53.5  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4351  lytic transglycosylase catalytic  33.62 
 
 		 194 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.744622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  41.46 
 
 		 191 aa  53.1  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  38.46 
 
 		 638 aa  53.1  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  37 
 
 		 272 aa  53.1  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0832  lytic transglycosylase, catalytic  39.77 
 
 		 218 aa  53.5  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0538  lytic transglycosylase, catalytic  40.26 
 
 		 194 aa  53.1  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.527113  hitchhiker  0.00520856 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  33.59 
 
 		 196 aa  53.1  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  37.63 
 
 		 260 aa  53.1  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  30.23 
 
 		 798 aa  52.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2342  lytic transglycosylase, catalytic  34.11 
 
 		 272 aa  53.1  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  30.43 
 
 		 216 aa  52.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  37.96 
 
 		 782 aa  52.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  38.82 
 
 		 190 aa  52.4  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  40.85 
 
 		 388 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1275  lytic transglycosylase, catalytic  39.73 
 
 		 185 aa  52.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  35.9 
 
 		 603 aa  52  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3099  lytic transglycosylase, catalytic  31.78 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  34.86 
 
 		 748 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3106  murein transglycosylase C  44.44 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368993 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  35.43 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  38.55 
 
 		 206 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0262  hypothetical protein  31.86 
 
 		 217 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>