234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0615 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0615  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
404 aa  811    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.659925  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3105  Lytic transglycosylase catalytic  73.35 
 
 
393 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0889  transglycosylase SLT domain-containing lipoprotein  70.27 
 
 
398 aa  548  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3021  Slt family transglycosylase  60.15 
 
 
370 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.734248  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2149  transglycosylase SLT domain-containing protein  59.41 
 
 
370 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3105  transglycosylase SLT domain-containing protein  59.41 
 
 
370 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3074  Slt family transglycosylase  59.41 
 
 
370 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0915  lytic transglycosylase catalytic  58.84 
 
 
378 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.423978  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0474  lytic transglycosylase, catalytic  58.84 
 
 
378 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1527  transglycosylase SLT domain-containing protein  59.21 
 
 
367 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.165503  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0953  lytic transglycosylase, catalytic  58.84 
 
 
378 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4054  lytic transglycosylase, catalytic  58.68 
 
 
370 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2444  lytic transglycosylase catalytic  59.95 
 
 
374 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0812  lytic transglycosylase, catalytic  56.72 
 
 
372 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0823  lytic transglycosylase catalytic  55.9 
 
 
372 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.600223  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2021  Slt family transglycosylase  57.45 
 
 
337 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0759  Slt family transglycosylase  57.45 
 
 
337 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.404866  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2592  Slt family transglycosylase  57.54 
 
 
319 aa  362  6e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2697  lytic transglycosylase, catalytic  66.27 
 
 
355 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0709  hypothetical protein  63.13 
 
 
362 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24101  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0766  lytic transglycosylase, catalytic  45.34 
 
 
354 aa  233  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.892374  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0658  Lytic transglycosylase catalytic  58 
 
 
395 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.118125 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0702  Lytic transglycosylase catalytic  60.77 
 
 
394 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.417607  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2926  lytic transglycosylase catalytic  55.43 
 
 
311 aa  192  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2657  lytic transglycosylase, catalytic  58.06 
 
 
267 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00887082  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2937  hypothetical protein  58.44 
 
 
306 aa  190  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.88861 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3628  lytic transglycosylase, catalytic  57.89 
 
 
252 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2991  lytic transglycosylase, catalytic  57.62 
 
 
295 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.617808  normal  0.305104 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4954  lytic transglycosylase catalytic  51.74 
 
 
303 aa  183  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2043  Lytic transglycosylase catalytic  56.6 
 
 
279 aa  180  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.944666  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1661  lytic transglycosylase, catalytic  56.6 
 
 
279 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2906  lytic transglycosylase, catalytic  46.08 
 
 
306 aa  178  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0327296  normal  0.0416217 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3099  Lytic transglycosylase catalytic  51.2 
 
 
272 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2873  lytic transglycosylase, catalytic  49.44 
 
 
296 aa  174  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113557  normal  0.33639 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0364  lytic transglycosylase, catalytic  44.94 
 
 
321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0365  Lytic transglycosylase catalytic  44.32 
 
 
330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3533  lytic transglycosylase, catalytic  43.18 
 
 
226 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 
304 aa  102  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5136  lytic transglycosylase catalytic  32.61 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206246  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0495  lytic transglycosylase, catalytic  30.54 
 
 
252 aa  67  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.358787  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3221  lytic transglycosylase, catalytic  32.61 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5146  lytic transglycosylase, catalytic  32.61 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00474071  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  32.85 
 
 
208 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 
217 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  38.32 
 
 
245 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5063  lytic transglycosylase catalytic  28.16 
 
 
228 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126997  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  33.55 
 
 
253 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  37.38 
 
 
253 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4539  lytic transglycosylase, catalytic  31.16 
 
 
224 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628549  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2951  lytic transglycosylase, catalytic  31.85 
 
 
241 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3509  lytic transglycosylase catalytic  30.43 
 
 
219 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  35.65 
 
 
777 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 
202 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  28.87 
 
 
223 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3693  Lytic transglycosylase catalytic  30.22 
 
 
227 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00345887  hitchhiker  0.000000358582 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3796  lytic transglycosylase, catalytic  28.69 
 
 
179 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.823369  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0262  hypothetical protein  31.9 
 
 
217 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447321 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0575  lytic transglycosylase catalytic  34.43 
 
 
223 aa  56.2  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.445014 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2210  lytic transglycosylase catalytic  44.21 
 
 
725 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847947  normal  0.0413346 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  34.21 
 
 
438 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  37.74 
 
 
242 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  35.4 
 
 
388 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0195  lytic transglycosylase catalytic protein  26.89 
 
 
239 aa  53.9  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0518  putative signal peptide protein  28.92 
 
 
206 aa  53.5  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106136 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0832  lytic transglycosylase, catalytic  34.31 
 
 
218 aa  53.1  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0006  lytic transglycosylase, catalytic  30.89 
 
 
154 aa  52.4  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0177  Lytic transglycosylase catalytic  26.05 
 
 
239 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000012846 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1275  lytic transglycosylase, catalytic  32.38 
 
 
185 aa  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3106  murein transglycosylase C  43.24 
 
 
359 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368993 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  41.11 
 
 
782 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  40.38 
 
 
603 aa  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3099  lytic transglycosylase, catalytic  31.97 
 
 
251 aa  51.6  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  37.97 
 
 
661 aa  50.8  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4045  murein transglycosylase C  33.54 
 
 
358 aa  50.8  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.171156 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02793  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  43.24 
 
 
359 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0732  Lytic transglycosylase catalytic  43.24 
 
 
360 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0751  murein transglycosylase C  43.24 
 
 
360 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4267  murein transglycosylase C  43.24 
 
 
359 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.59829  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3124  murein transglycosylase C  43.24 
 
 
359 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  35.9 
 
 
639 aa  50.4  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3309  murein transglycosylase C  43.24 
 
 
359 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02756  hypothetical protein  43.24 
 
 
359 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.128702  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3396  murein transglycosylase C  43.24 
 
 
359 aa  50.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3669  lytic transglycosylase, catalytic  31.86 
 
 
226 aa  50.4  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  38.55 
 
 
251 aa  50.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  35.9 
 
 
639 aa  50.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0248  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 
168 aa  50.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  35.87 
 
 
833 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  35.9 
 
 
639 aa  50.4  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2121  transglycosylase SLT domain-containing protein  31.08 
 
 
168 aa  50.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3368  murein transglycosylase C  38.1 
 
 
359 aa  50.1  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0187243 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  30 
 
 
280 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0643  lytic transglycosylase, catalytic  43.1 
 
 
203 aa  49.3  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.849619  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  35.11 
 
 
283 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  38.1 
 
 
442 aa  48.9  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4187  lytic transglycosylase, catalytic  33.88 
 
 
166 aa  49.3  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000629  decreased coverage  0.0000117899 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3286  murein transglycosylase C  42.11 
 
 
361 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.548913  normal  0.0418173 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3360  murein transglycosylase C  42.11 
 
 
361 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.0857265 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  30.97 
 
 
175 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0421  lytic transglycosylase, catalytic  45.83 
 
 
190 aa  48.5  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.829572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>