195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0474 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0915  lytic transglycosylase catalytic  99.47 
 
 		 378 aa  751    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.423978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4054  lytic transglycosylase, catalytic  90.5 
 
 		 370 aa  649    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0474  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 378 aa  757    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0953  lytic transglycosylase, catalytic  99.74 
 
 		 378 aa  754    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0823  lytic transglycosylase catalytic  86.65 
 
 		 372 aa  642    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.600223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0812  lytic transglycosylase, catalytic  86.13 
 
 		 372 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2444  lytic transglycosylase catalytic  84.25 
 
 		 374 aa  590  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1527  transglycosylase SLT domain-containing protein  70.53 
 
 		 367 aa  499  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.165503  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3021  Slt family transglycosylase  71.02 
 
 		 370 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.734248  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2149  transglycosylase SLT domain-containing protein  71.54 
 
 		 370 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3105  transglycosylase SLT domain-containing protein  71.54 
 
 		 370 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3074  Slt family transglycosylase  71.54 
 
 		 370 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3105  Lytic transglycosylase catalytic  63.34 
 
 		 393 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0889  transglycosylase SLT domain-containing lipoprotein  62.07 
 
 		 398 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0615  lytic transglycosylase catalytic  59.81 
 
 		 404 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.659925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0759  Slt family transglycosylase  70.29 
 
 		 337 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.404866  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2021  Slt family transglycosylase  70.29 
 
 		 337 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2592  Slt family transglycosylase  69.28 
 
 		 319 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0702  Lytic transglycosylase catalytic  52.5 
 
 		 394 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.417607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0658  Lytic transglycosylase catalytic  52.48 
 
 		 395 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.118125 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2697  lytic transglycosylase, catalytic  64.88 
 
 		 355 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0709  hypothetical protein  61.45 
 
 		 362 aa  225  9e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0766  lytic transglycosylase, catalytic  63.53 
 
 		 354 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.892374  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2926  lytic transglycosylase catalytic  52 
 
 		 311 aa  189  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2657  lytic transglycosylase, catalytic  56.89 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00887082  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2991  lytic transglycosylase, catalytic  51.2 
 
 		 295 aa  187  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.617808  normal  0.305104 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2937  hypothetical protein  57.42 
 
 		 306 aa  187  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.88861 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2043  Lytic transglycosylase catalytic  55.06 
 
 		 279 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.944666  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1661  lytic transglycosylase, catalytic  55.06 
 
 		 279 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4954  lytic transglycosylase catalytic  54.22 
 
 		 303 aa  179  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3628  lytic transglycosylase, catalytic  55.92 
 
 		 252 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3099  Lytic transglycosylase catalytic  53.85 
 
 		 272 aa  178  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2873  lytic transglycosylase, catalytic  53.71 
 
 		 296 aa  176  8e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113557  normal  0.33639 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2906  lytic transglycosylase, catalytic  46.35 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0327296  normal  0.0416217 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0364  lytic transglycosylase, catalytic  43.75 
 
 		 321 aa  149  7e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0365  Lytic transglycosylase catalytic  42.29 
 
 		 330 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3533  lytic transglycosylase, catalytic  45.45 
 
 		 226 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  34.89 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  35.66 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0495  lytic transglycosylase, catalytic  29.88 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.358787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5136  lytic transglycosylase catalytic  29.86 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  31.69 
 
 		 208 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3221  lytic transglycosylase, catalytic  29.86 
 
 		 228 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5146  lytic transglycosylase, catalytic  29.86 
 
 		 228 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00474071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  31.82 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5063  lytic transglycosylase catalytic  27.68 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4539  lytic transglycosylase, catalytic  29.86 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3796  lytic transglycosylase, catalytic  32.54 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.823369  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  30.92 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  33.88 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  36.63 
 
 		 253 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2951  lytic transglycosylase, catalytic  32.21 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3509  lytic transglycosylase catalytic  29.17 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0262  hypothetical protein  29.81 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447321 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  32.46 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0575  lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.445014 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2113  hypothetical protein  40.38 
 
 		 210 aa  57  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3693  Lytic transglycosylase catalytic  26.48 
 
 		 227 aa  57  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00345887  hitchhiker  0.000000358582 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  35.14 
 
 		 175 aa  57  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0538  lytic transglycosylase, catalytic  31.84 
 
 		 194 aa  55.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.527113  hitchhiker  0.00520856 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0832  lytic transglycosylase, catalytic  34.31 
 
 		 218 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  36.19 
 
 		 782 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1275  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 185 aa  53.9  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  32.17 
 
 		 777 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0518  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 206 aa  53.5  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106136 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  32.43 
 
 		 202 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3099  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 251 aa  53.5  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0421  lytic transglycosylase, catalytic  34 
 
 		 190 aa  53.1  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.829572 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3669  lytic transglycosylase, catalytic  32.74 
 
 		 226 aa  52.8  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0248  Lytic transglycosylase catalytic  34.26 
 
 		 168 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0643  lytic transglycosylase, catalytic  34.82 
 
 		 203 aa  52.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.849619  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  35.59 
 
 		 442 aa  52.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1794  lytic transglycosylase, catalytic  38.82 
 
 		 152 aa  52.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 190 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  34.62 
 
 		 603 aa  51.6  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2391  lytic transglycosylase, catalytic  33.66 
 
 		 228 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2468  lytic transglycosylase catalytic  35.63 
 
 		 234 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  37.61 
 
 		 280 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1226  Lytic transglycosylase catalytic  32.38 
 
 		 221 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793802  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  35.44 
 
 		 648 aa  51.2  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0195  lytic transglycosylase catalytic protein  25.21 
 
 		 239 aa  50.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2121  transglycosylase SLT domain-containing protein  30.84 
 
 		 168 aa  50.1  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0744  lytic transglycosylase, catalytic  32.35 
 
 		 221 aa  50.1  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0220327 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1431  lytic transglycosylase, catalytic  31.03 
 
 		 170 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  37.23 
 
 		 251 aa  49.7  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0776  Lytic transglycosylase catalytic  30.97 
 
 		 218 aa  49.7  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2210  lytic transglycosylase catalytic  38.95 
 
 		 725 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847947  normal  0.0413346 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4211  Lytic transglycosylase catalytic  32.69 
 
 		 219 aa  49.7  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0847  lytic transglycosylase, catalytic  30.97 
 
 		 218 aa  49.7  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 639 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  37.23 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  38.71 
 
 		 241 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 639 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 639 aa  48.9  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  36.78 
 
 		 182 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  35.87 
 
 		 833 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0193  lytic transglycosylase, catalytic  33.94 
 
 		 168 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0177  Lytic transglycosylase catalytic  24.37 
 
 		 239 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000012846 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1010  lytic transglycosylase catalytic  37.21 
 
 		 153 aa  48.9  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0664563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>