More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3628 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3628  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 252 aa  511  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2991  lytic transglycosylase, catalytic  65.43 
 
 		 295 aa  322  4e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.617808  normal  0.305104 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2043  Lytic transglycosylase catalytic  64.02 
 
 		 279 aa  305  4.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.944666  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1661  lytic transglycosylase, catalytic  64.02 
 
 		 279 aa  305  4.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4954  lytic transglycosylase catalytic  62.96 
 
 		 303 aa  303  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2657  lytic transglycosylase, catalytic  61.16 
 
 		 267 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00887082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2873  lytic transglycosylase, catalytic  67.44 
 
 		 296 aa  298  5e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113557  normal  0.33639 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3099  Lytic transglycosylase catalytic  66.19 
 
 		 272 aa  286  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2906  lytic transglycosylase, catalytic  56.72 
 
 		 306 aa  256  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0327296  normal  0.0416217 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2937  hypothetical protein  54.01 
 
 		 306 aa  254  9e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.88861 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2926  lytic transglycosylase catalytic  53.78 
 
 		 311 aa  236  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3105  Lytic transglycosylase catalytic  60.53 
 
 		 393 aa  195  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0889  transglycosylase SLT domain-containing lipoprotein  59.21 
 
 		 398 aa  192  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0615  lytic transglycosylase catalytic  54.55 
 
 		 404 aa  188  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.659925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2444  lytic transglycosylase catalytic  56.58 
 
 		 374 aa  179  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0915  lytic transglycosylase catalytic  55.92 
 
 		 378 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.423978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0823  lytic transglycosylase catalytic  55.13 
 
 		 372 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.600223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0474  lytic transglycosylase, catalytic  55.92 
 
 		 378 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0953  lytic transglycosylase, catalytic  55.92 
 
 		 378 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2592  Slt family transglycosylase  57.62 
 
 		 319 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0759  Slt family transglycosylase  57.62 
 
 		 337 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.404866  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2021  Slt family transglycosylase  57.62 
 
 		 337 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0812  lytic transglycosylase, catalytic  55.13 
 
 		 372 aa  178  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2149  transglycosylase SLT domain-containing protein  57.62 
 
 		 370 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3105  transglycosylase SLT domain-containing protein  57.62 
 
 		 370 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3021  Slt family transglycosylase  57.62 
 
 		 370 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.734248  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3074  Slt family transglycosylase  57.62 
 
 		 370 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4054  lytic transglycosylase, catalytic  54.61 
 
 		 370 aa  176  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1527  transglycosylase SLT domain-containing protein  57.62 
 
 		 367 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.165503  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0709  hypothetical protein  55.56 
 
 		 362 aa  176  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0766  lytic transglycosylase, catalytic  57.14 
 
 		 354 aa  175  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.892374  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0702  Lytic transglycosylase catalytic  54.9 
 
 		 394 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.417607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2697  lytic transglycosylase, catalytic  58.87 
 
 		 355 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0658  Lytic transglycosylase catalytic  54.9 
 
 		 395 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.118125 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0365  Lytic transglycosylase catalytic  48.57 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0364  lytic transglycosylase, catalytic  46.98 
 
 		 321 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3533  lytic transglycosylase, catalytic  47.01 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  39.57 
 
 		 304 aa  95.9  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  35.88 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  44.87 
 
 		 639 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  44.87 
 
 		 639 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  44.87 
 
 		 639 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0538  lytic transglycosylase, catalytic  34.68 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.527113  hitchhiker  0.00520856 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  36.13 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5136  lytic transglycosylase catalytic  33.08 
 
 		 228 aa  62  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3221  lytic transglycosylase, catalytic  33.08 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5146  lytic transglycosylase, catalytic  33.08 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00474071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0495  lytic transglycosylase, catalytic  33.09 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.358787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3509  lytic transglycosylase catalytic  29.55 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4539  lytic transglycosylase, catalytic  32.31 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1794  lytic transglycosylase, catalytic  37.35 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  38.61 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  37.76 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0262  hypothetical protein  30.97 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447321 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5063  lytic transglycosylase catalytic  32.31 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  37.76 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  39.78 
 
 		 438 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  29.01 
 
 		 217 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2951  lytic transglycosylase, catalytic  38.68 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0832  lytic transglycosylase, catalytic  40.21 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  36.04 
 
 		 748 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  40.26 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3693  Lytic transglycosylase catalytic  28.57 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00345887  hitchhiker  0.000000358582 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  34.59 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2468  lytic transglycosylase catalytic  33.59 
 
 		 234 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 198 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4351  lytic transglycosylase catalytic  36.44 
 
 		 194 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.744622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  30.5 
 
 		 175 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  38.27 
 
 		 661 aa  54.3  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  33.61 
 
 		 211 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  29.38 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3796  lytic transglycosylase, catalytic  27.34 
 
 		 179 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.823369  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  38.64 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  33.08 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  33.06 
 
 		 272 aa  53.9  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2391  lytic transglycosylase, catalytic  33.82 
 
 		 228 aa  53.1  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  34.19 
 
 		 218 aa  53.1  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  42.5 
 
 		 296 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0643  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 203 aa  52.8  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.849619  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  38.04 
 
 		 190 aa  53.1  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  41.89 
 
 		 388 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1275  lytic transglycosylase, catalytic  39.56 
 
 		 185 aa  52.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  30.08 
 
 		 233 aa  52.4  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2342  lytic transglycosylase, catalytic  31.5 
 
 		 272 aa  52.4  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03362  lytic murein transglycosylase  32.62 
 
 		 272 aa  52.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0675  lytic murein transglycosylase  38.55 
 
 		 642 aa  52.4  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.586863 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  36.05 
 
 		 241 aa  52  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  35.34 
 
 		 777 aa  52  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0575  lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 		 223 aa  52  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.445014 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1010  lytic transglycosylase catalytic  29.41 
 
 		 153 aa  52  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0664563  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  41.25 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  37.37 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1297  lytic transglycosylase, catalytic  34.17 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0421  lytic transglycosylase, catalytic  36.08 
 
 		 190 aa  51.6  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.829572 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0776  Lytic transglycosylase catalytic  39.56 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0847  lytic transglycosylase, catalytic  39.56 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4211  Lytic transglycosylase catalytic  36.52 
 
 		 219 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  32.86 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>