More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2815 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  100 
 
 		 245 aa  495  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  86.69 
 
 		 253 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  86.69 
 
 		 253 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3099  lytic transglycosylase, catalytic  69.29 
 
 		 251 aa  333  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2951  lytic transglycosylase, catalytic  72.22 
 
 		 241 aa  323  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0518  putative signal peptide protein  67.96 
 
 		 206 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106136 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5480  lytic transglycosylase catalytic  61.33 
 
 		 194 aa  238  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0832  lytic transglycosylase, catalytic  58.54 
 
 		 218 aa  238  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4211  Lytic transglycosylase catalytic  63.04 
 
 		 219 aa  237  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0575  lytic transglycosylase catalytic  64.29 
 
 		 223 aa  236  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.445014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0847  lytic transglycosylase, catalytic  58.62 
 
 		 218 aa  232  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0776  Lytic transglycosylase catalytic  58.62 
 
 		 218 aa  233  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1275  lytic transglycosylase, catalytic  63.84 
 
 		 185 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3669  lytic transglycosylase, catalytic  59.56 
 
 		 226 aa  231  7.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2391  lytic transglycosylase, catalytic  62.29 
 
 		 228 aa  228  8e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0744  lytic transglycosylase, catalytic  57.44 
 
 		 221 aa  223  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0220327 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0643  lytic transglycosylase, catalytic  56.7 
 
 		 203 aa  211  9e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.849619  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0421  lytic transglycosylase, catalytic  57.3 
 
 		 190 aa  206  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.829572 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1226  Lytic transglycosylase catalytic  55.38 
 
 		 221 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793802  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2113  hypothetical protein  52.97 
 
 		 210 aa  197  9e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0538  lytic transglycosylase, catalytic  53.38 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.527113  hitchhiker  0.00520856 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  48.15 
 
 		 190 aa  135  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  47.37 
 
 		 175 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  36.02 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  37.59 
 
 		 208 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  42.11 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  35.17 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  37.1 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  38.52 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  38.38 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3693  Lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00345887  hitchhiker  0.000000358582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4054  lytic transglycosylase, catalytic  35.66 
 
 		 370 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0823  lytic transglycosylase catalytic  35.66 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.600223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  44.9 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  42.57 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  37.82 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0812  lytic transglycosylase, catalytic  35.66 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  38.02 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2697  lytic transglycosylase, catalytic  34.11 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0915  lytic transglycosylase catalytic  35.66 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.423978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  39.53 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0474  lytic transglycosylase, catalytic  35.66 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0953  lytic transglycosylase, catalytic  35.66 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  39.56 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  38.37 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0262  hypothetical protein  33.12 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447321 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2444  lytic transglycosylase catalytic  35.66 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0615  lytic transglycosylase catalytic  38.32 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.659925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  43.43 
 
 		 657 aa  62.8  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  37.19 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  37.1 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  43.43 
 
 		 657 aa  62.8  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2296  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000211124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3509  lytic transglycosylase catalytic  34.21 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  39.29 
 
 		 233 aa  62  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1892  Lytic transglycosylase catalytic  39.13 
 
 		 643 aa  61.6  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0766  lytic transglycosylase, catalytic  36.27 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.892374  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3105  Lytic transglycosylase catalytic  34.69 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  40.54 
 
 		 678 aa  61.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  38.39 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2874  Lytic transglycosylase catalytic  40.82 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0680806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  40.95 
 
 		 659 aa  60.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  42.42 
 
 		 660 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0702  Lytic transglycosylase catalytic  37.37 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.417607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  40.66 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0658  Lytic transglycosylase catalytic  37.37 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.118125 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  40.82 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  41.41 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3099  Lytic transglycosylase catalytic  39.58 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  41.41 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  41.49 
 
 		 661 aa  60.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2021  Slt family transglycosylase  34.27 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  38.37 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  38.37 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  34.38 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3021  Slt family transglycosylase  34.27 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.734248  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0889  transglycosylase SLT domain-containing lipoprotein  34.67 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0759  Slt family transglycosylase  34.27 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.404866  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  43.43 
 
 		 663 aa  60.1  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  38.46 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2149  transglycosylase SLT domain-containing protein  43.18 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2592  Slt family transglycosylase  43.18 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3105  transglycosylase SLT domain-containing protein  43.18 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3074  Slt family transglycosylase  43.18 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0709  hypothetical protein  37.37 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  39.29 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1527  transglycosylase SLT domain-containing protein  43.18 
 
 		 367 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.165503  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  37.21 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4539  lytic transglycosylase, catalytic  34.21 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  37.21 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  39.53 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  39.53 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  37.21 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  36.96 
 
 		 715 aa  58.9  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  39.22 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>