More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2296 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2296  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
271 aa  553  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000211124  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0901  copper amine oxidase domain protein  52.86 
 
 
340 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.948767  normal  0.18587 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  41.9 
 
 
603 aa  92.4  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  39.29 
 
 
195 aa  87.8  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  35.77 
 
 
664 aa  86.3  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  44.21 
 
 
206 aa  84  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  38.33 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2541  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 
677 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00863759  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0881  putative soluble lytic transglycosylase  40 
 
 
653 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  34.53 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  36.61 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 
721 aa  79.7  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  40.82 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  37.61 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  41.12 
 
 
196 aa  79  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  41.35 
 
 
244 aa  79  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0276  soluble lytic transglycosylase  37.61 
 
 
681 aa  78.2  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 
281 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  35 
 
 
187 aa  78.2  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  41.3 
 
 
261 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  41.3 
 
 
261 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2874  Lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0680806  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  29.51 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  40.78 
 
 
719 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0187  lytic transglycosylase, catalytic  42.55 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0753643  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  41.3 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  45.26 
 
 
698 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  41.3 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  41.3 
 
 
259 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  42.27 
 
 
677 aa  75.9  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  41 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  38.1 
 
 
804 aa  74.7  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  41.3 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  41.3 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  41.3 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  43.16 
 
 
198 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  41.3 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3276  lytic transglycosylase, catalytic  34.04 
 
 
152 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 
235 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  36.09 
 
 
216 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  39.45 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  39.45 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  35.51 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  32.54 
 
 
672 aa  74.7  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0125  lytic transglycosylase, catalytic  35.96 
 
 
680 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1606  Lytic transglycosylase catalytic  35.94 
 
 
166 aa  73.9  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000533374  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1446  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  33.33 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  40.19 
 
 
241 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  42.39 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5084  lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0436378  normal  0.0244706 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  36.27 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1248  Lytic transglycosylase catalytic  37.27 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00404625  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  35.24 
 
 
833 aa  73.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  37.96 
 
 
677 aa  73.2  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  41.3 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  42.11 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  40 
 
 
655 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3087  lytic transglycosylase catalytic  36.46 
 
 
726 aa  72.8  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522258  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  36.08 
 
 
776 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  36.08 
 
 
774 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  36.08 
 
 
774 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  29.9 
 
 
279 aa  72  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  32.82 
 
 
747 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  34.38 
 
 
217 aa  71.6  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  39.39 
 
 
663 aa  72  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  36.61 
 
 
212 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  38 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  39.42 
 
 
207 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3427  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 
295 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  32.32 
 
 
616 aa  71.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  43 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  37.04 
 
 
690 aa  70.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  43 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3164  lytic transglycosylase, catalytic  30.1 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.205276 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3738  Lytic transglycosylase catalytic  39.26 
 
 
655 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0927783  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  35.92 
 
 
679 aa  70.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  37.25 
 
 
716 aa  71.2  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  41 
 
 
442 aa  70.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  33.87 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  35.05 
 
 
760 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  42 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  36.08 
 
 
757 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  39.22 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  35.96 
 
 
657 aa  69.7  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  35.96 
 
 
657 aa  69.7  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  38.95 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  36.89 
 
 
669 aa  70.1  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  34 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2068  soluble lytic transglycosylase  35.85 
 
 
700 aa  69.7  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  35 
 
 
653 aa  69.7  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  30.99 
 
 
730 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  39.05 
 
 
724 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  34.58 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0150  putative lytic transglycosylase catalytic  33.93 
 
 
649 aa  69.3  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.862262  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  30.99 
 
 
730 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  37.61 
 
 
649 aa  69.3  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  35.58 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>