More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0187 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0187  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 165 aa  339  1e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0753643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2007  lytic transglycosylase, catalytic  45.51 
 
 		 278 aa  148  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00437999  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  36.5 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  37.04 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2296  Lytic transglycosylase catalytic  38.83 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000211124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  36.15 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  37.01 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  38.98 
 
 		 247 aa  77.4  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  33.58 
 
 		 206 aa  77.4  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2611  lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 251 aa  77.4  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.59616 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  38.1 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  39.06 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  36.15 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  35.94 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  37.59 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  35.77 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  40.62 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  38.24 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  33.74 
 
 		 715 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  37.19 
 
 		 282 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  38.33 
 
 		 261 aa  74.7  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  34.88 
 
 		 251 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  36.51 
 
 		 260 aa  73.9  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  35.88 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  40.19 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  37.4 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  34.88 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  39.02 
 
 		 698 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3009  lytic transglycosylase catalytic  34.84 
 
 		 238 aa  71.6  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  38.13 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  35.61 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  36.55 
 
 		 209 aa  70.5  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  37.24 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  36.15 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  37.24 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  34.13 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  36.69 
 
 		 643 aa  69.3  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  34.92 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  38.84 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  38.17 
 
 		 709 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  35.38 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  36.54 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  37.69 
 
 		 709 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  33.96 
 
 		 281 aa  67.8  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0189  lytic transglycosylase, catalytic  28.68 
 
 		 270 aa  67.4  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0519081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  31.58 
 
 		 304 aa  67.4  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  37.1 
 
 		 207 aa  67.4  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  36.55 
 
 		 686 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  32.85 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  37.9 
 
 		 242 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  36.43 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6207  Lytic transglycosylase catalytic  31.85 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287429  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  34.29 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  35.25 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  39.81 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  35.16 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24441  soluble lytic transglycosylase  40.7 
 
 		 677 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  34.33 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  36.43 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0624  lytic transglycosylase, catalytic  38.66 
 
 		 808 aa  65.5  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  31.58 
 
 		 362 aa  65.1  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  33.09 
 
 		 603 aa  64.7  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  33.58 
 
 		 296 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  33.58 
 
 		 296 aa  64.7  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  35.77 
 
 		 218 aa  64.3  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2017  lytic transglycosylase, catalytic  33.08 
 
 		 205 aa  64.3  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275292  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6408  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 253 aa  64.3  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  32.23 
 
 		 215 aa  63.9  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3427  Lytic transglycosylase catalytic  36.19 
 
 		 295 aa  63.9  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  41.24 
 
 		 669 aa  63.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  32.35 
 
 		 645 aa  63.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  35.96 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3883  lytic transglycosylase catalytic  37.62 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0376  Lytic transglycosylase catalytic  32.12 
 
 		 730 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  34.43 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  34.81 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  36.22 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2606  Lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  32.56 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  37.72 
 
 		 677 aa  62.8  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3276  lytic transglycosylase, catalytic  38.38 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5084  lytic transglycosylase catalytic  38.54 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0436378  normal  0.0244706 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1446  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  35.29 
 
 		 373 aa  62.4  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  31.34 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  34.13 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2079  Lytic transglycosylase catalytic  30.06 
 
 		 359 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.929188  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  32.56 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  36.97 
 
 		 216 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1297  lytic transglycosylase, catalytic  37.14 
 
 		 228 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  29.48 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2022  lytic transglycosylase, catalytic  34.46 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2073  Lytic transglycosylase catalytic  33.88 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000112057  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2563  Lytic transglycosylase catalytic  37.14 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0148918  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  35.86 
 
 		 747 aa  62  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  31.75 
 
 		 328 aa  61.6  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  34.44 
 
 		 719 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  32.31 
 
 		 216 aa  62  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.149841 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>