124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0189 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0189  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 270 aa  544  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0519081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2007  lytic transglycosylase, catalytic  34.62 
 
 		 278 aa  94  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00437999  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0187  lytic transglycosylase, catalytic  29.13 
 
 		 165 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0753643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1606  Lytic transglycosylase catalytic  31.39 
 
 		 166 aa  57  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000533374  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8299  Lytic transglycosylase catalytic  33.64 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103911  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  36.46 
 
 		 175 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  34.95 
 
 		 208 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  26.67 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  31.3 
 
 		 747 aa  53.1  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  35.58 
 
 		 260 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1297  lytic transglycosylase, catalytic  35.4 
 
 		 228 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  34.91 
 
 		 251 aa  53.1  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6207  Lytic transglycosylase catalytic  29.87 
 
 		 390 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287429  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2468  lytic transglycosylase catalytic  36.28 
 
 		 234 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2659  Lytic transglycosylase catalytic  35.14 
 
 		 228 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.725375  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  30.3 
 
 		 209 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2079  Lytic transglycosylase catalytic  34.44 
 
 		 359 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.929188  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  32.69 
 
 		 201 aa  52  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2563  Lytic transglycosylase catalytic  35.14 
 
 		 228 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0148918  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1960  secreted protein  27.59 
 
 		 181 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0297  lytic transglycosylase, catalytic  33.94 
 
 		 385 aa  52  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.277763  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  29.55 
 
 		 217 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  31.67 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2248  Slt family transglycosylase  27.59 
 
 		 181 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.469686  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  31.25 
 
 		 209 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0514  Lytic transglycosylase catalytic  30.43 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  31.58 
 
 		 209 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  30.1 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1007  transglycosylase, putative  37.62 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232372  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  33.33 
 
 		 285 aa  50.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3164  lytic transglycosylase, catalytic  32.38 
 
 		 284 aa  50.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.205276 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  32.37 
 
 		 204 aa  50.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  26.02 
 
 		 199 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0307  lytic transglycosylase, catalytic  39.13 
 
 		 332 aa  49.7  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  31.29 
 
 		 204 aa  49.7  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4180  lytic transglycosylase, catalytic  31.39 
 
 		 210 aa  49.3  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  32.04 
 
 		 280 aa  48.9  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  33.67 
 
 		 198 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  33.61 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0483  lytic transglycosylase, catalytic  33.94 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  38.14 
 
 		 677 aa  48.5  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9824  type IV system transglycosylase  32.71 
 
 		 322 aa  48.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  35.38 
 
 		 297 aa  48.1  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  35.38 
 
 		 297 aa  48.1  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2441  lytic transglycosylase, catalytic  31.07 
 
 		 300 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0168706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  32.37 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  31.91 
 
 		 198 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  29.85 
 
 		 715 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4565  lytic transglycosylase catalytic  35.56 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0155983  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  32.95 
 
 		 182 aa  47  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4448  lytic transglycosylase, catalytic  32.04 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6408  lytic transglycosylase catalytic  35.54 
 
 		 253 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  32.67 
 
 		 196 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  33.65 
 
 		 253 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  33.33 
 
 		 388 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3099  lytic transglycosylase, catalytic  32.67 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  32.08 
 
 		 215 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0306  lytic transglycosylase, catalytic  29.71 
 
 		 293 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0150  putative lytic transglycosylase catalytic  32.58 
 
 		 649 aa  47  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.862262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  33.65 
 
 		 253 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2348  Lytic transglycosylase catalytic  31.71 
 
 		 763 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0502018  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2068  soluble lytic transglycosylase  31 
 
 		 700 aa  46.2  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1603  lytic transglycosylase  31.71 
 
 		 830 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.807223  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24441  soluble lytic transglycosylase  36.47 
 
 		 677 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  30.91 
 
 		 260 aa  46.2  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3883  lytic transglycosylase catalytic  27.27 
 
 		 252 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  28.06 
 
 		 296 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  31.19 
 
 		 260 aa  46.6  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  35.05 
 
 		 198 aa  46.2  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  28.06 
 
 		 296 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2260  Lytic transglycosylase catalytic  31.71 
 
 		 763 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3276  lytic transglycosylase, catalytic  29.57 
 
 		 152 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  41.67 
 
 		 196 aa  45.8  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  31.33 
 
 		 278 aa  45.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  32.32 
 
 		 645 aa  45.4  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  32.32 
 
 		 709 aa  45.4  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1328  Lytic transglycosylase catalytic  27.07 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  29.46 
 
 		 188 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1463  lytic transglycosylase, catalytic  37.8 
 
 		 413 aa  45.4  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4513  Lytic transglycosylase catalytic  28.32 
 
 		 230 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  29.91 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  30.69 
 
 		 603 aa  45.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2611  lytic transglycosylase catalytic  27.46 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.59616 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  35.05 
 
 		 643 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  33.01 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  30.3 
 
 		 709 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  30.83 
 
 		 719 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  31.13 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  32.23 
 
 		 146 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  29.52 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  26.92 
 
 		 190 aa  43.9  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1911  soluble lytic murein transglycosylase  28.26 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0241391  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  34.91 
 
 		 669 aa  43.9  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0001  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  25.2 
 
 		 375 aa  43.9  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000403894  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  32.79 
 
 		 328 aa  43.9  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  31.73 
 
 		 207 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0525  lytic murein transglycosylase  31 
 
 		 643 aa  43.5  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0561  lytic transglycosylase, catalytic  28.26 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0976  Lytic transglycosylase catalytic  30.97 
 
 		 223 aa  43.5  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>