More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1007 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1007  transglycosylase, putative  100 
 
 		 209 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232372  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  43.09 
 
 		 191 aa  87.8  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  45.22 
 
 		 222 aa  86.7  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  41.07 
 
 		 326 aa  84.7  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  41.07 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  42.28 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1248  Lytic transglycosylase catalytic  34.75 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00404625  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  39.81 
 
 		 299 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  38.39 
 
 		 249 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  45.63 
 
 		 329 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  41.12 
 
 		 243 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  37.41 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  43.64 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  43.36 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  38.39 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  38.39 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  38.39 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  38.41 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 239 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  43.81 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  43.81 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  39.13 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  31.82 
 
 		 235 aa  77.8  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  43.93 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  39.5 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  39.02 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  39.84 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  47.37 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  49.52 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  39.83 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  44.09 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  35.71 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  41.51 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  44.44 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  41.84 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1028  Lytic transglycosylase catalytic  44.44 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  43.64 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  43.93 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  40.19 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  40.57 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  38.18 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  43.81 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  39.8 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  40.74 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  38.18 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3973  lytic transglycosylase catalytic  60.56 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1886  lytic transglycosylase, catalytic  49.51 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158781  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  42.45 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  38.21 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  40.57 
 
 		 218 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  40.57 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  40.82 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  34.69 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  40.82 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  39.84 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0850  lytic transglycosylase, catalytic  42.99 
 
 		 336 aa  72  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0266609 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  45.54 
 
 		 318 aa  72  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  41.8 
 
 		 245 aa  72  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  42.99 
 
 		 254 aa  71.6  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  37.27 
 
 		 261 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  39.2 
 
 		 244 aa  71.6  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  42.72 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  46.32 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  37.27 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0306  lytic transglycosylase, catalytic  40.6 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  39.81 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  44.76 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  37.27 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  37.4 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  43.3 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  47.92 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  45.45 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  42.31 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  37.27 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  43.3 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  32.65 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  39.62 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0754  lytic transglycosylase catalytic  42.99 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  43.59 
 
 		 438 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  37.4 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  37.27 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  37.27 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  37.27 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  46.46 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  37.27 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  46.32 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  38.83 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  43.14 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3638  lytic transglycosylase catalytic  55.88 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.237 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3822  lytic transglycosylase, catalytic  55.88 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.539253  normal  0.0346403 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4176  lytic transglycosylase, catalytic  40.48 
 
 		 354 aa  68.9  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  36.8 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  38.18 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  41 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1794  putative lytic transglycosylase  46.73 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>