More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0514 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0514  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 254 aa  501  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1465  lytic transglycosylase catalytic  53.36 
 
 		 294 aa  249  4e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2543  Lytic transglycosylase catalytic  56.35 
 
 		 249 aa  195  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8299  Lytic transglycosylase catalytic  68.22 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103911  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3883  lytic transglycosylase catalytic  56.77 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1014  Lytic transglycosylase catalytic  53.55 
 
 		 250 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  62.9 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2555  Lytic transglycosylase catalytic  53.67 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2995  lytic transglycosylase, catalytic  54.79 
 
 		 287 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.891675  normal  0.0342596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2909  lytic transglycosylase, catalytic  61.48 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.368798 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2017  lytic transglycosylase, catalytic  38.69 
 
 		 205 aa  123  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275292  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2904  soluble lytic transglycosylase  44.92 
 
 		 197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  44.35 
 
 		 179 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2866  Lytic transglycosylase catalytic  43.33 
 
 		 206 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918978  normal  0.297415 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1733  lytic transglycosylase catalytic  37.66 
 
 		 219 aa  115  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254136  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2606  Lytic transglycosylase catalytic  43.22 
 
 		 175 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1443  transglycosylase SLT domain-containing protein  40.98 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1399  transglycosylase SLT domain-containing protein  40.98 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.861628  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3772  lytic transglycosylase catalytic  45.16 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3561  Lytic transglycosylase catalytic  37.76 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  41.82 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  39.09 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  39.09 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2814  Lytic transglycosylase catalytic  41.57 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3773  Lytic transglycosylase catalytic  42.22 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3663  Lytic transglycosylase catalytic  42.22 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3465  lytic transglycosylase catalytic  42.22 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6221  hypothetical protein  40.82 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2397  lytic transglycosylase catalytic  40.45 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279322  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  34.91 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5084  lytic transglycosylase catalytic  32.61 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0436378  normal  0.0244706 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  38 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2912  lytic murein transglycosylase  32.31 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.647608  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  38 
 
 		 221 aa  67  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2463  lytic transglycosylase, catalytic  36.56 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0650  transglycosylase  39.77 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2303  lytic transglycosylase, catalytic  39.77 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.176095 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  36.84 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3164  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.205276 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  37.04 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2108  lytic transglycosylase catalytic  35.64 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.344374 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0582  lytic transglycosylase, catalytic  38.64 
 
 		 150 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  32.69 
 
 		 715 aa  63.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  37.23 
 
 		 709 aa  62.8  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2746  lytic transglycosylase catalytic  39.53 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  36.54 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  34 
 
 		 709 aa  62.4  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  34.69 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  39.81 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  36.63 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2890  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.576703  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  38.89 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  42.53 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  40.7 
 
 		 388 aa  58.5  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  33.33 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2280  Slt family transglycosylase  33.68 
 
 		 688 aa  58.5  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  35.35 
 
 		 174 aa  58.5  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  34.58 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  38.38 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1595  lytic transglycosylase, catalytic  40.48 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  32.46 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  35.51 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  29.37 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  33.06 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0550  lytic transglycosylase, catalytic  34.91 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  37.76 
 
 		 218 aa  57  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  33.63 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  32.46 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3693  Lytic transglycosylase catalytic  34.19 
 
 		 227 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00345887  hitchhiker  0.000000358582 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  36.89 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2135  lytic transglycosylase catalytic  27.63 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  33.68 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  33.68 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  36.19 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0495  lytic transglycosylase, catalytic  37.74 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.358787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  35 
 
 		 698 aa  55.8  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  32.63 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  34.95 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2103  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25465  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0575  lytic transglycosylase catalytic  33.01 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.445014 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4176  lytic transglycosylase, catalytic  37 
 
 		 354 aa  55.1  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  32.79 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0944  lytic transglycosylase, catalytic  36.46 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  31 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  32.63 
 
 		 747 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  38.68 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2611  Lytic transglycosylase catalytic  28.04 
 
 		 310 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  28 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  35 
 
 		 719 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  29.17 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0262  hypothetical protein  34.78 
 
 		 217 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447321 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  28 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  28 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  37.11 
 
 		 442 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  28.4 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  30.33 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  27.16 
 
 		 197 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  33.96 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>