231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3772 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3772  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 326 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3663  Lytic transglycosylase catalytic  55.22 
 
 		 309 aa  193  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3773  Lytic transglycosylase catalytic  48.65 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3465  lytic transglycosylase catalytic  48.82 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2397  lytic transglycosylase catalytic  62.05 
 
 		 375 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279322  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_004310  BR0067  transglycosylase SLT domain-containing protein  55.36 
 
 		 287 aa  129  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0066  transglycosylase SLT domain-containing protein  55.86 
 
 		 287 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0077  lytic transglycosylase catalytic  54.87 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3561  Lytic transglycosylase catalytic  44.2 
 
 		 428 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2103  lytic transglycosylase, catalytic  56.88 
 
 		 249 aa  125  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25465  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6221  hypothetical protein  57.55 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2108  lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 333 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.344374 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2912  lytic murein transglycosylase  50 
 
 		 368 aa  123  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.647608  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2814  Lytic transglycosylase catalytic  48.61 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2746  lytic transglycosylase catalytic  51.82 
 
 		 259 aa  108  9.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0550  lytic transglycosylase, catalytic  54.37 
 
 		 164 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2463  lytic transglycosylase, catalytic  53.27 
 
 		 158 aa  106  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2611  Lytic transglycosylase catalytic  42.61 
 
 		 310 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2890  lytic transglycosylase, catalytic  59.09 
 
 		 158 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.576703  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2871  Lytic transglycosylase catalytic  39.84 
 
 		 305 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0650  transglycosylase  48.15 
 
 		 150 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2303  lytic transglycosylase, catalytic  48.15 
 
 		 150 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.176095 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0582  lytic transglycosylase, catalytic  47.22 
 
 		 150 aa  99.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2904  soluble lytic transglycosylase  54.17 
 
 		 197 aa  98.6  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1443  transglycosylase SLT domain-containing protein  46.67 
 
 		 214 aa  94.7  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2017  lytic transglycosylase, catalytic  48.08 
 
 		 205 aa  95.1  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275292  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1399  transglycosylase SLT domain-containing protein  46.67 
 
 		 214 aa  94.7  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.861628  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  48.04 
 
 		 179 aa  93.6  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1733  lytic transglycosylase catalytic  45.63 
 
 		 219 aa  93.2  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254136  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2866  Lytic transglycosylase catalytic  46 
 
 		 206 aa  92.4  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918978  normal  0.297415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2606  Lytic transglycosylase catalytic  47.92 
 
 		 175 aa  92.4  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0514  Lytic transglycosylase catalytic  43.56 
 
 		 254 aa  89.7  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1017  lytic transglycosylase, catalytic  40.19 
 
 		 165 aa  86.7  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.520766 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1037  lytic transglycosylase, catalytic  44.76 
 
 		 156 aa  86.7  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166947 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8299  Lytic transglycosylase catalytic  42.45 
 
 		 325 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103911  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1014  Lytic transglycosylase catalytic  42.16 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2543  Lytic transglycosylase catalytic  44.21 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1465  lytic transglycosylase catalytic  42.27 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  44.79 
 
 		 263 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2909  lytic transglycosylase, catalytic  42.73 
 
 		 262 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.368798 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3883  lytic transglycosylase catalytic  42.11 
 
 		 252 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2555  Lytic transglycosylase catalytic  42.11 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2995  lytic transglycosylase, catalytic  39.22 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.891675  normal  0.0342596 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  39.05 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  38.78 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  39.8 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  35.92 
 
 		 198 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  41.41 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  39.42 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  39.42 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  38 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  35.05 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  38.78 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  40 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  39.42 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  40.4 
 
 		 188 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  36.11 
 
 		 207 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  40.62 
 
 		 203 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  34.02 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  30.36 
 
 		 223 aa  57  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  39.5 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  39.5 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  42.45 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  35.11 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  38.78 
 
 		 217 aa  55.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  37.08 
 
 		 603 aa  55.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  36 
 
 		 174 aa  55.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  39.81 
 
 		 212 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0376  Lytic transglycosylase catalytic  36 
 
 		 730 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  41.98 
 
 		 661 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  39.67 
 
 		 189 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  32.56 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  39.78 
 
 		 709 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  39.78 
 
 		 709 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3871  lytic murein transglycosylase  31.82 
 
 		 644 aa  53.9  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.006684  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  41.18 
 
 		 297 aa  53.5  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 		 297 aa  53.1  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3677  lytic murein transglycosylase  31.82 
 
 		 641 aa  53.1  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.994757  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  32 
 
 		 716 aa  53.1  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  35.96 
 
 		 197 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0399  Lytic transglycosylase catalytic  41.77 
 
 		 574 aa  52.8  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4176  lytic transglycosylase, catalytic  37.38 
 
 		 354 aa  52.8  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  34.83 
 
 		 224 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  36.45 
 
 		 191 aa  52.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  33.85 
 
 		 175 aa  52  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  35.96 
 
 		 218 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  31.96 
 
 		 241 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  39.58 
 
 		 208 aa  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  38.53 
 
 		 206 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  36.73 
 
 		 677 aa  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  32 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  41.25 
 
 		 388 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  36.27 
 
 		 197 aa  50.8  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1463  lytic transglycosylase, catalytic  39.53 
 
 		 413 aa  50.4  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  38.24 
 
 		 222 aa  50.4  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  37.76 
 
 		 247 aa  50.1  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  32 
 
 		 251 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1424  lytic transglycosylase, catalytic  44.74 
 
 		 191 aa  50.1  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0284128  normal  0.0259883 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  30.4 
 
 		 239 aa  49.7  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>