More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1443 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1443  transglycosylase SLT domain-containing protein  100 
 
 		 214 aa  436  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1399  transglycosylase SLT domain-containing protein  99.07 
 
 		 214 aa  433  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.861628  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1733  lytic transglycosylase catalytic  80 
 
 		 219 aa  343  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254136  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2017  lytic transglycosylase, catalytic  71.3 
 
 		 205 aa  176  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275292  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  64.75 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2866  Lytic transglycosylase catalytic  52.3 
 
 		 206 aa  168  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918978  normal  0.297415 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2904  soluble lytic transglycosylase  53.9 
 
 		 197 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2606  Lytic transglycosylase catalytic  65.25 
 
 		 175 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2543  Lytic transglycosylase catalytic  39.76 
 
 		 249 aa  121  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2555  Lytic transglycosylase catalytic  48.28 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526771 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8299  Lytic transglycosylase catalytic  42.37 
 
 		 325 aa  115  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103911  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1014  Lytic transglycosylase catalytic  45.38 
 
 		 250 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  45.24 
 
 		 263 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0514  Lytic transglycosylase catalytic  40.98 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2909  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 262 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.368798 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2995  lytic transglycosylase, catalytic  42.06 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.891675  normal  0.0342596 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3883  lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1465  lytic transglycosylase catalytic  42.37 
 
 		 294 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3772  lytic transglycosylase catalytic  48.31 
 
 		 326 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2746  lytic transglycosylase catalytic  45.74 
 
 		 259 aa  86.3  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2912  lytic murein transglycosylase  50.68 
 
 		 368 aa  85.9  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.647608  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6221  hypothetical protein  43.3 
 
 		 277 aa  85.9  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2463  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 158 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3561  Lytic transglycosylase catalytic  40.82 
 
 		 428 aa  84  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  43.14 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2890  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 158 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.576703  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0067  transglycosylase SLT domain-containing protein  40.4 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3663  Lytic transglycosylase catalytic  46.59 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0066  transglycosylase SLT domain-containing protein  41.24 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0077  lytic transglycosylase catalytic  40.21 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2397  lytic transglycosylase catalytic  45.35 
 
 		 375 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279322  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2611  Lytic transglycosylase catalytic  36.79 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2814  Lytic transglycosylase catalytic  43.02 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3465  lytic transglycosylase catalytic  46.59 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3773  Lytic transglycosylase catalytic  46.59 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2108  lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 333 aa  75.9  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.344374 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2871  Lytic transglycosylase catalytic  34.48 
 
 		 305 aa  75.5  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2103  lytic transglycosylase, catalytic  41.24 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25465  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0550  lytic transglycosylase, catalytic  41.05 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  29.53 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  40.82 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  32.54 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  32.33 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  36.29 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  34.4 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  34.86 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  34.86 
 
 		 261 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  34.86 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2280  Slt family transglycosylase  39.8 
 
 		 688 aa  67  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  35.71 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  33.94 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  33.59 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  34.38 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  38.83 
 
 		 603 aa  65.5  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  33.94 
 
 		 261 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  33.94 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  33.94 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  33.94 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  33.94 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  33.09 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  33.09 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  33.09 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  33.6 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  35.64 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0582  lytic transglycosylase, catalytic  38.95 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  30.9 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  32.46 
 
 		 199 aa  62  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  33 
 
 		 197 aa  62  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  37.37 
 
 		 709 aa  61.6  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  31.48 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  32.99 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  32.8 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  35.35 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  31.86 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  30.2 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  30.26 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  32.8 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  38.14 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2303  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.176095 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0650  transglycosylase  35.29 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1706  transglycosylase slt family protein  35.96 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.190325  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  37.08 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2629  transglycosylase slt family protein  35.96 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00160181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3276  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1816  lytic transglycosylase catalytic  35.96 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  35.58 
 
 		 698 aa  58.9  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  35.92 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  31.71 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  35.35 
 
 		 709 aa  58.9  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  39.42 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  38 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  35 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2007  lytic transglycosylase, catalytic  34.86 
 
 		 278 aa  58.5  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00437999  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2135  lytic transglycosylase catalytic  33.59 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  34.31 
 
 		 258 aa  58.2  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  34.65 
 
 		 719 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  33.6 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>