131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3663 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3663  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 309 aa  590  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3773  Lytic transglycosylase catalytic  74.24 
 
 		 297 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3465  lytic transglycosylase catalytic  75.25 
 
 		 298 aa  339  4e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3772  lytic transglycosylase catalytic  63.89 
 
 		 326 aa  188  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2397  lytic transglycosylase catalytic  73.64 
 
 		 375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279322  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_004310  BR0067  transglycosylase SLT domain-containing protein  58.93 
 
 		 287 aa  136  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0066  transglycosylase SLT domain-containing protein  58.93 
 
 		 287 aa  135  9e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6221  hypothetical protein  61.9 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2814  Lytic transglycosylase catalytic  69.91 
 
 		 342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0077  lytic transglycosylase catalytic  59.26 
 
 		 280 aa  132  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2103  lytic transglycosylase, catalytic  58.49 
 
 		 249 aa  122  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25465  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3561  Lytic transglycosylase catalytic  47.69 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2108  lytic transglycosylase catalytic  52.25 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.344374 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2912  lytic murein transglycosylase  50.94 
 
 		 368 aa  117  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.647608  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2871  Lytic transglycosylase catalytic  47.66 
 
 		 305 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2890  lytic transglycosylase, catalytic  51.82 
 
 		 158 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.576703  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0550  lytic transglycosylase, catalytic  54.37 
 
 		 164 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2746  lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 259 aa  107  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2611  Lytic transglycosylase catalytic  44.55 
 
 		 310 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2463  lytic transglycosylase, catalytic  51.82 
 
 		 158 aa  106  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0650  transglycosylase  50.49 
 
 		 150 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2303  lytic transglycosylase, catalytic  50.49 
 
 		 150 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.176095 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0582  lytic transglycosylase, catalytic  49.51 
 
 		 150 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1017  lytic transglycosylase, catalytic  46 
 
 		 165 aa  92.8  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.520766 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2904  soluble lytic transglycosylase  51.04 
 
 		 197 aa  88.6  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2866  Lytic transglycosylase catalytic  46 
 
 		 206 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918978  normal  0.297415 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1733  lytic transglycosylase catalytic  44.76 
 
 		 219 aa  86.7  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254136  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2606  Lytic transglycosylase catalytic  47.57 
 
 		 175 aa  85.9  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1399  transglycosylase SLT domain-containing protein  40.94 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.861628  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2017  lytic transglycosylase, catalytic  45.28 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275292  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1037  lytic transglycosylase, catalytic  44.12 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166947 
 
 
-
 
NC_004310  BR1443  transglycosylase SLT domain-containing protein  43.93 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  46.08 
 
 		 179 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1014  Lytic transglycosylase catalytic  41.75 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0514  Lytic transglycosylase catalytic  40.59 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2555  Lytic transglycosylase catalytic  42.11 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526771 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8299  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103911  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1465  lytic transglycosylase catalytic  41.24 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2543  Lytic transglycosylase catalytic  42.11 
 
 		 249 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  42.71 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3883  lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  40.82 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2995  lytic transglycosylase, catalytic  37.27 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.891675  normal  0.0342596 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  36.84 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2909  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.368798 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  38.14 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  36.73 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  41.24 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  36.43 
 
 		 285 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  35.58 
 
 		 251 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  33.99 
 
 		 223 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  36.08 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  35.9 
 
 		 197 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  38.3 
 
 		 203 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  38.78 
 
 		 206 aa  53.9  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  33.06 
 
 		 239 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  33.87 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  34.68 
 
 		 249 aa  53.5  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  38.38 
 
 		 196 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  33.06 
 
 		 239 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  33.06 
 
 		 239 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  38.79 
 
 		 216 aa  53.1  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  33.06 
 
 		 239 aa  52.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  38.79 
 
 		 221 aa  52.8  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  33.87 
 
 		 251 aa  52.4  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  33.87 
 
 		 251 aa  52.4  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  35.05 
 
 		 198 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  33.06 
 
 		 207 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  33.85 
 
 		 296 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  33.85 
 
 		 296 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  37.37 
 
 		 188 aa  50.1  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  40.74 
 
 		 603 aa  50.1  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  32.35 
 
 		 197 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  31.58 
 
 		 241 aa  49.3  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  36.89 
 
 		 204 aa  49.3  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  36.84 
 
 		 218 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  35.79 
 
 		 224 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0495  lytic transglycosylase, catalytic  34.65 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.358787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  34.55 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  39.36 
 
 		 174 aa  48.9  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  38.71 
 
 		 709 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1089  lytic transglycosylase catalytic  38.64 
 
 		 238 aa  48.5  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  34.62 
 
 		 202 aa  47.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1424  lytic transglycosylase, catalytic  45.21 
 
 		 191 aa  47.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0284128  normal  0.0259883 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3509  lytic transglycosylase catalytic  32.35 
 
 		 219 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  43.06 
 
 		 709 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  35 
 
 		 204 aa  47.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  39.58 
 
 		 208 aa  47  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3276  lytic transglycosylase, catalytic  36.46 
 
 		 152 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3099  lytic transglycosylase, catalytic  35.79 
 
 		 251 aa  46.6  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  31 
 
 		 716 aa  46.6  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0575  lytic transglycosylase catalytic  35.64 
 
 		 223 aa  46.6  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.445014 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  36.11 
 
 		 208 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  34.68 
 
 		 212 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  37.04 
 
 		 661 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  34.02 
 
 		 715 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  32 
 
 		 245 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  35.58 
 
 		 199 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  27.08 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>