109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2746 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2746  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 259 aa  517  1e-146  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3561  Lytic transglycosylase catalytic  59.71 
 
 		 428 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2108  lytic transglycosylase catalytic  56.64 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.344374 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2912  lytic murein transglycosylase  52.25 
 
 		 368 aa  128  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.647608  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2103  lytic transglycosylase, catalytic  58.26 
 
 		 249 aa  128  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25465  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0067  transglycosylase SLT domain-containing protein  58.72 
 
 		 287 aa  126  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0066  transglycosylase SLT domain-containing protein  57.39 
 
 		 287 aa  126  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0077  lytic transglycosylase catalytic  57.8 
 
 		 280 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2611  Lytic transglycosylase catalytic  56.31 
 
 		 310 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2871  Lytic transglycosylase catalytic  54.37 
 
 		 305 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1037  lytic transglycosylase, catalytic  51.28 
 
 		 156 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166947 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6221  hypothetical protein  50.38 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0550  lytic transglycosylase, catalytic  57.27 
 
 		 164 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2463  lytic transglycosylase, catalytic  61.9 
 
 		 158 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2890  lytic transglycosylase, catalytic  58.62 
 
 		 158 aa  105  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.576703  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2814  Lytic transglycosylase catalytic  57.47 
 
 		 342 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0650  transglycosylase  46.85 
 
 		 150 aa  99  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2303  lytic transglycosylase, catalytic  46.85 
 
 		 150 aa  99  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.176095 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1017  lytic transglycosylase, catalytic  42.28 
 
 		 165 aa  99  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.520766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2397  lytic transglycosylase catalytic  56.32 
 
 		 375 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279322  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3772  lytic transglycosylase catalytic  52.29 
 
 		 326 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3663  Lytic transglycosylase catalytic  40.5 
 
 		 309 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0582  lytic transglycosylase, catalytic  45.95 
 
 		 150 aa  92.8  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2017  lytic transglycosylase, catalytic  43.48 
 
 		 205 aa  87.8  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275292  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1443  transglycosylase SLT domain-containing protein  45.74 
 
 		 214 aa  87  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1399  transglycosylase SLT domain-containing protein  45.74 
 
 		 214 aa  87  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.861628  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3465  lytic transglycosylase catalytic  51.76 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3773  Lytic transglycosylase catalytic  51.76 
 
 		 297 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1733  lytic transglycosylase catalytic  41.35 
 
 		 219 aa  85.5  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254136  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2606  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2866  Lytic transglycosylase catalytic  48.96 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918978  normal  0.297415 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2904  soluble lytic transglycosylase  47.92 
 
 		 197 aa  81.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  44.74 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2543  Lytic transglycosylase catalytic  43.68 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  39.83 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8299  Lytic transglycosylase catalytic  37.23 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103911  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3883  lytic transglycosylase catalytic  36.21 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0514  Lytic transglycosylase catalytic  39.53 
 
 		 254 aa  62  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2909  lytic transglycosylase, catalytic  40.4 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.368798 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1014  Lytic transglycosylase catalytic  38.3 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1465  lytic transglycosylase catalytic  36.08 
 
 		 294 aa  57  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2995  lytic transglycosylase, catalytic  38.2 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.891675  normal  0.0342596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2555  Lytic transglycosylase catalytic  44.26 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526771 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  35.85 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  35.71 
 
 		 260 aa  53.5  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  35.71 
 
 		 260 aa  52.8  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  39.78 
 
 		 603 aa  51.2  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  32.17 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  32.17 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  33.04 
 
 		 285 aa  50.4  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  34.02 
 
 		 198 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  34.69 
 
 		 251 aa  50.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  34.78 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2359  lytic transglycosylase, catalytic  43.06 
 
 		 203 aa  48.5  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  34.78 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  36.73 
 
 		 188 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1816  lytic transglycosylase catalytic  34.82 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  37.63 
 
 		 197 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1706  transglycosylase slt family protein  34.82 
 
 		 212 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.190325  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2629  transglycosylase slt family protein  34.82 
 
 		 212 aa  47.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00160181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  33.65 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  31.96 
 
 		 196 aa  46.6  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  39.36 
 
 		 292 aa  46.6  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  39.36 
 
 		 300 aa  46.6  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  32.08 
 
 		 282 aa  46.2  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  38.54 
 
 		 218 aa  46.2  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  33.91 
 
 		 224 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02793  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  38.46 
 
 		 359 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3368  murein transglycosylase C  37.36 
 
 		 359 aa  45.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0187243 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3124  murein transglycosylase C  38.46 
 
 		 359 aa  44.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3309  murein transglycosylase C  38.46 
 
 		 359 aa  44.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02756  hypothetical protein  38.46 
 
 		 359 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.128702  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0751  murein transglycosylase C  38.46 
 
 		 360 aa  44.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3106  murein transglycosylase C  38.46 
 
 		 359 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368993 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3396  murein transglycosylase C  38.46 
 
 		 359 aa  44.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4267  murein transglycosylase C  38.46 
 
 		 359 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.59829  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0732  Lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  30.97 
 
 		 747 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  32.74 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  39.51 
 
 		 197 aa  44.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1407  lytic transglycosylase, catalytic  25.97 
 
 		 179 aa  44.3  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  38.14 
 
 		 719 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  39.22 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  39.22 
 
 		 297 aa  43.5  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  39.22 
 
 		 328 aa  43.5  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  36 
 
 		 645 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  36 
 
 		 645 aa  43.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  33.98 
 
 		 206 aa  43.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  36 
 
 		 645 aa  43.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  36 
 
 		 645 aa  43.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  39.33 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  36 
 
 		 645 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  36 
 
 		 645 aa  43.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  36 
 
 		 645 aa  43.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  36 
 
 		 645 aa  43.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  36 
 
 		 645 aa  43.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2073  Lytic transglycosylase catalytic  28.89 
 
 		 195 aa  43.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000112057  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1424  lytic transglycosylase, catalytic  43.42 
 
 		 191 aa  42.7  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0284128  normal  0.0259883 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  28.37 
 
 		 442 aa  42.7  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>