More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2017 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2017  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 205 aa  414  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275292  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2606  Lytic transglycosylase catalytic  68.07 
 
 		 175 aa  181  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  59.74 
 
 		 179 aa  181  8.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2866  Lytic transglycosylase catalytic  69.23 
 
 		 206 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918978  normal  0.297415 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2904  soluble lytic transglycosylase  49.51 
 
 		 197 aa  179  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1733  lytic transglycosylase catalytic  49.32 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254136  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1399  transglycosylase SLT domain-containing protein  67.46 
 
 		 214 aa  177  8e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.861628  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1443  transglycosylase SLT domain-containing protein  71.3 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3883  lytic transglycosylase catalytic  44.54 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0514  Lytic transglycosylase catalytic  40.97 
 
 		 254 aa  121  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1465  lytic transglycosylase catalytic  45.3 
 
 		 294 aa  120  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8299  Lytic transglycosylase catalytic  41.74 
 
 		 325 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103911  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2543  Lytic transglycosylase catalytic  46.09 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  45.22 
 
 		 263 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2995  lytic transglycosylase, catalytic  46.09 
 
 		 287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.891675  normal  0.0342596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2555  Lytic transglycosylase catalytic  42.61 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1014  Lytic transglycosylase catalytic  43.48 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2909  lytic transglycosylase, catalytic  36.54 
 
 		 262 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.368798 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2746  lytic transglycosylase catalytic  43.48 
 
 		 259 aa  88.2  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3772  lytic transglycosylase catalytic  48.86 
 
 		 326 aa  87  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0550  lytic transglycosylase, catalytic  46.94 
 
 		 164 aa  86.7  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2912  lytic murein transglycosylase  41.84 
 
 		 368 aa  86.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.647608  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2463  lytic transglycosylase, catalytic  45.26 
 
 		 158 aa  84.7  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3561  Lytic transglycosylase catalytic  41.84 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6221  hypothetical protein  42.16 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2103  lytic transglycosylase, catalytic  45.92 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25465  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2890  lytic transglycosylase, catalytic  44.21 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.576703  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0067  transglycosylase SLT domain-containing protein  42.86 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0066  transglycosylase SLT domain-containing protein  42.86 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0077  lytic transglycosylase catalytic  41.84 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3663  Lytic transglycosylase catalytic  47.13 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2611  Lytic transglycosylase catalytic  41.05 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2108  lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.344374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  38 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2397  lytic transglycosylase catalytic  45.35 
 
 		 375 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279322  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2814  Lytic transglycosylase catalytic  43.02 
 
 		 342 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  38 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  33.87 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  37 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3773  Lytic transglycosylase catalytic  45.98 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2871  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3465  lytic transglycosylase catalytic  45.98 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  40.78 
 
 		 698 aa  72  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0582  lytic transglycosylase, catalytic  44.12 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  38 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  36.27 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  32.79 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0650  transglycosylase  38.46 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2303  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.176095 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  33.59 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  39.81 
 
 		 603 aa  68.9  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1037  lytic transglycosylase, catalytic  38.3 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166947 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  36.63 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2280  Slt family transglycosylase  38.32 
 
 		 688 aa  67  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  34.07 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  31.4 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  37.19 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  38.14 
 
 		 709 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  31.97 
 
 		 258 aa  65.1  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  28.85 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  33.07 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  38.14 
 
 		 709 aa  63.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  31.4 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  30.6 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5136  lytic transglycosylase catalytic  33.06 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  36.63 
 
 		 715 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  35.29 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  30.47 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  39.18 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  35.05 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0495  lytic transglycosylase, catalytic  33.88 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.358787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  26.86 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1017  lytic transglycosylase, catalytic  34.69 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.520766 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3221  lytic transglycosylase, catalytic  33.06 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  36.27 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5146  lytic transglycosylase, catalytic  33.06 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00474071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2007  lytic transglycosylase, catalytic  36.79 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00437999  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  36.63 
 
 		 719 aa  63.2  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  34.13 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  26.22 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  38 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  26.22 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  37.11 
 
 		 256 aa  62  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  33.64 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  35.35 
 
 		 242 aa  62  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  25.71 
 
 		 261 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  38 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  29.29 
 
 		 241 aa  62  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3276  lytic transglycosylase, catalytic  38.64 
 
 		 152 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  33.87 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  33.99 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3509  lytic transglycosylase catalytic  32.23 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0187  lytic transglycosylase, catalytic  34.48 
 
 		 165 aa  60.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0753643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1765  soluble lytic murein transglycosylase  30.6 
 
 		 739 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>