142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6221 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6221  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  547  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2890  lytic transglycosylase, catalytic  62.31 
 
 		 158 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.576703  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3561  Lytic transglycosylase catalytic  52.1 
 
 		 428 aa  126  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2463  lytic transglycosylase, catalytic  62.5 
 
 		 158 aa  123  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3663  Lytic transglycosylase catalytic  63.33 
 
 		 309 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2912  lytic murein transglycosylase  46.76 
 
 		 368 aa  116  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.647608  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3773  Lytic transglycosylase catalytic  62.22 
 
 		 297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3465  lytic transglycosylase catalytic  62.22 
 
 		 298 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2397  lytic transglycosylase catalytic  62.5 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279322  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2746  lytic transglycosylase catalytic  50.38 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2814  Lytic transglycosylase catalytic  60.23 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0067  transglycosylase SLT domain-containing protein  52.78 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0066  transglycosylase SLT domain-containing protein  52.78 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0077  lytic transglycosylase catalytic  42.14 
 
 		 280 aa  108  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3772  lytic transglycosylase catalytic  55.96 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0550  lytic transglycosylase, catalytic  47.76 
 
 		 164 aa  105  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2611  Lytic transglycosylase catalytic  37.32 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2871  Lytic transglycosylase catalytic  38.03 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2108  lytic transglycosylase catalytic  43.22 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.344374 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2103  lytic transglycosylase, catalytic  48.62 
 
 		 249 aa  99.8  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25465  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0582  lytic transglycosylase, catalytic  45.22 
 
 		 150 aa  92.8  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1733  lytic transglycosylase catalytic  49.41 
 
 		 219 aa  92  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254136  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0650  transglycosylase  43.48 
 
 		 150 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2303  lytic transglycosylase, catalytic  43.48 
 
 		 150 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.176095 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1017  lytic transglycosylase, catalytic  48.11 
 
 		 165 aa  87  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.520766 
 
 
-
 
NC_004310  BR1443  transglycosylase SLT domain-containing protein  40.46 
 
 		 214 aa  86.7  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2017  lytic transglycosylase, catalytic  33.91 
 
 		 205 aa  85.9  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275292  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1399  transglycosylase SLT domain-containing protein  43.3 
 
 		 214 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.861628  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1037  lytic transglycosylase, catalytic  40.19 
 
 		 156 aa  82  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166947 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2904  soluble lytic transglycosylase  38.1 
 
 		 197 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2866  Lytic transglycosylase catalytic  44.33 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918978  normal  0.297415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2606  Lytic transglycosylase catalytic  38.06 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1014  Lytic transglycosylase catalytic  39.62 
 
 		 250 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0514  Lytic transglycosylase catalytic  40.82 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8299  Lytic transglycosylase catalytic  37.84 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103911  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2555  Lytic transglycosylase catalytic  38.53 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2995  lytic transglycosylase, catalytic  35.43 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.891675  normal  0.0342596 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3883  lytic transglycosylase catalytic  41.41 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1465  lytic transglycosylase catalytic  32 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  40.21 
 
 		 179 aa  67  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2543  Lytic transglycosylase catalytic  41.49 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2909  lytic transglycosylase, catalytic  36.5 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.368798 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  40.48 
 
 		 603 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  32.82 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  33.06 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  33.82 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  36.51 
 
 		 197 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0495  lytic transglycosylase, catalytic  28.67 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.358787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4539  lytic transglycosylase, catalytic  29.17 
 
 		 224 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  34.75 
 
 		 203 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3221  lytic transglycosylase, catalytic  26.9 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5146  lytic transglycosylase, catalytic  26.9 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00474071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5136  lytic transglycosylase catalytic  26.9 
 
 		 228 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  31.68 
 
 		 260 aa  53.5  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5063  lytic transglycosylase catalytic  27.71 
 
 		 228 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  40.28 
 
 		 709 aa  53.1  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2959  lytic transglycosylase catalytic  41.1 
 
 		 280 aa  52.8  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  40.28 
 
 		 709 aa  52.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  33.67 
 
 		 282 aa  52.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  31.68 
 
 		 260 aa  52  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  37.11 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  30.82 
 
 		 677 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  35.24 
 
 		 197 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  31 
 
 		 716 aa  50.1  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3276  lytic transglycosylase, catalytic  40.23 
 
 		 152 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  35.24 
 
 		 218 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  26.97 
 
 		 194 aa  49.3  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  32.54 
 
 		 196 aa  48.9  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  32.23 
 
 		 206 aa  48.9  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3509  lytic transglycosylase catalytic  26.9 
 
 		 219 aa  48.9  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  34.29 
 
 		 224 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  32.65 
 
 		 747 aa  48.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  39.78 
 
 		 221 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  34.02 
 
 		 715 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  39.78 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  35.71 
 
 		 196 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  35.96 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  37.37 
 
 		 208 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  29.41 
 
 		 362 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  38.55 
 
 		 202 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  30.3 
 
 		 297 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3693  Lytic transglycosylase catalytic  31.16 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00345887  hitchhiker  0.000000358582 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5914  Lytic transglycosylase catalytic  31.4 
 
 		 797 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  36.78 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  30.3 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  36.11 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0262  hypothetical protein  32.17 
 
 		 217 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447321 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0399  Lytic transglycosylase catalytic  37.23 
 
 		 574 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  28.06 
 
 		 637 aa  46.6  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 217 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  30.77 
 
 		 241 aa  46.2  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  35.71 
 
 		 215 aa  46.2  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  35.96 
 
 		 174 aa  46.2  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  40.62 
 
 		 209 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  40.62 
 
 		 209 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  33.72 
 
 		 679 aa  45.8  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 261 aa  45.8  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  32.99 
 
 		 198 aa  45.8  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>