144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0582 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0582  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 150 aa  301  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0650  transglycosylase  87.1 
 
 		 150 aa  227  5e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2303  lytic transglycosylase, catalytic  87.1 
 
 		 150 aa  227  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.176095 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0550  lytic transglycosylase, catalytic  49.39 
 
 		 164 aa  150  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2103  lytic transglycosylase, catalytic  60.34 
 
 		 249 aa  140  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25465  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1017  lytic transglycosylase, catalytic  58.26 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.520766 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1037  lytic transglycosylase, catalytic  44.97 
 
 		 156 aa  130  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166947 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0066  transglycosylase SLT domain-containing protein  56.88 
 
 		 287 aa  124  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0067  transglycosylase SLT domain-containing protein  56.88 
 
 		 287 aa  124  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0077  lytic transglycosylase catalytic  55.75 
 
 		 280 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2108  lytic transglycosylase catalytic  49.59 
 
 		 333 aa  120  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.344374 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2912  lytic murein transglycosylase  48.06 
 
 		 368 aa  118  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.647608  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2611  Lytic transglycosylase catalytic  50.46 
 
 		 310 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2871  Lytic transglycosylase catalytic  49.54 
 
 		 305 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3561  Lytic transglycosylase catalytic  45.28 
 
 		 428 aa  95.9  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2746  lytic transglycosylase catalytic  45.95 
 
 		 259 aa  93.6  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6221  hypothetical protein  45.22 
 
 		 277 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2397  lytic transglycosylase catalytic  54.29 
 
 		 375 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279322  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2814  Lytic transglycosylase catalytic  51.92 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3663  Lytic transglycosylase catalytic  49.51 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3772  lytic transglycosylase catalytic  48.11 
 
 		 326 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2463  lytic transglycosylase, catalytic  49.44 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2890  lytic transglycosylase, catalytic  49.41 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.576703  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3773  Lytic transglycosylase catalytic  46.6 
 
 		 297 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3465  lytic transglycosylase catalytic  46.6 
 
 		 298 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2866  Lytic transglycosylase catalytic  44.21 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918978  normal  0.297415 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2904  soluble lytic transglycosylase  46.88 
 
 		 197 aa  74.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  42.16 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2606  Lytic transglycosylase catalytic  40.74 
 
 		 175 aa  73.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2017  lytic transglycosylase, catalytic  44.12 
 
 		 205 aa  70.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275292  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1465  lytic transglycosylase catalytic  37.93 
 
 		 294 aa  68.2  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2555  Lytic transglycosylase catalytic  38.39 
 
 		 260 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1014  Lytic transglycosylase catalytic  38.94 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8299  Lytic transglycosylase catalytic  39 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103911  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0514  Lytic transglycosylase catalytic  38.64 
 
 		 254 aa  63.5  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  37.23 
 
 		 197 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  37.23 
 
 		 218 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1733  lytic transglycosylase catalytic  38.95 
 
 		 219 aa  62  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254136  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  36.17 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_004310  BR1443  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.95 
 
 		 214 aa  62  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2543  Lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 		 249 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1399  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.95 
 
 		 214 aa  62  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.861628  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  43.24 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2995  lytic transglycosylase, catalytic  35.58 
 
 		 287 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.891675  normal  0.0342596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2909  lytic transglycosylase, catalytic  42.17 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.368798 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  34.74 
 
 		 263 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3883  lytic transglycosylase catalytic  37.08 
 
 		 252 aa  57  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  34.62 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  33.65 
 
 		 296 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  33.65 
 
 		 296 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  38.64 
 
 		 260 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  31.37 
 
 		 280 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  37.23 
 
 		 196 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  31.13 
 
 		 203 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  38.75 
 
 		 388 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1059  lytic transglycosylase, catalytic  40.51 
 
 		 608 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  40.54 
 
 		 709 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  34.69 
 
 		 203 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  35.79 
 
 		 215 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  35.11 
 
 		 207 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  34.04 
 
 		 206 aa  48.9  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  30.61 
 
 		 204 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1463  lytic transglycosylase, catalytic  36.25 
 
 		 413 aa  47.8  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  40.54 
 
 		 709 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  25.69 
 
 		 191 aa  47.4  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  43.48 
 
 		 199 aa  47  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0177  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 429 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119021 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  29.59 
 
 		 283 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  38.27 
 
 		 187 aa  46.2  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1089  lytic transglycosylase catalytic  30.19 
 
 		 238 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  32.67 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  30.61 
 
 		 204 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  36.49 
 
 		 256 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4513  Lytic transglycosylase catalytic  29.82 
 
 		 230 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 		 603 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  32.26 
 
 		 326 aa  45.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  34.52 
 
 		 280 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  32.65 
 
 		 198 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  33.93 
 
 		 202 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  37.84 
 
 		 247 aa  44.7  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2441  lytic transglycosylase, catalytic  36.05 
 
 		 300 aa  44.3  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0168706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  28.12 
 
 		 241 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  33.68 
 
 		 217 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  31.63 
 
 		 202 aa  43.5  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  26.47 
 
 		 260 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  30.17 
 
 		 233 aa  42.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1424  lytic transglycosylase, catalytic  36.84 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0284128  normal  0.0259883 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  36.05 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 		 281 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2689  Lytic transglycosylase catalytic  32.91 
 
 		 752 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  30.67 
 
 		 593 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  30.67 
 
 		 593 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  37.84 
 
 		 239 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  37.84 
 
 		 239 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  37.84 
 
 		 239 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  33.33 
 
 		 226 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  34.88 
 
 		 292 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  35.42 
 
 		 217 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  36.76 
 
 		 649 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>