123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1017 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1017  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 165 aa  330  5e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.520766 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0550  lytic transglycosylase, catalytic  52.1 
 
 		 164 aa  154  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1037  lytic transglycosylase, catalytic  53.47 
 
 		 156 aa  150  8.999999999999999e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166947 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0650  transglycosylase  59.13 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2303  lytic transglycosylase, catalytic  59.13 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.176095 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0582  lytic transglycosylase, catalytic  58.26 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0066  transglycosylase SLT domain-containing protein  53.72 
 
 		 287 aa  125  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0077  lytic transglycosylase catalytic  54.55 
 
 		 280 aa  125  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0067  transglycosylase SLT domain-containing protein  53.72 
 
 		 287 aa  124  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2103  lytic transglycosylase, catalytic  50.86 
 
 		 249 aa  120  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25465  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2871  Lytic transglycosylase catalytic  56.86 
 
 		 305 aa  117  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2611  Lytic transglycosylase catalytic  54.9 
 
 		 310 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2108  lytic transglycosylase catalytic  47.83 
 
 		 333 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.344374 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2912  lytic murein transglycosylase  49.54 
 
 		 368 aa  107  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.647608  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2746  lytic transglycosylase catalytic  42.28 
 
 		 259 aa  99  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3561  Lytic transglycosylase catalytic  42.45 
 
 		 428 aa  92  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6221  hypothetical protein  47.27 
 
 		 277 aa  85.5  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3663  Lytic transglycosylase catalytic  44.19 
 
 		 309 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3465  lytic transglycosylase catalytic  43.02 
 
 		 298 aa  71.2  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3773  Lytic transglycosylase catalytic  43.02 
 
 		 297 aa  71.2  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2463  lytic transglycosylase, catalytic  43.82 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2890  lytic transglycosylase, catalytic  45.88 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.576703  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3772  lytic transglycosylase catalytic  40.23 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  37.89 
 
 		 179 aa  67.4  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  39.18 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2814  Lytic transglycosylase catalytic  41.94 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2017  lytic transglycosylase, catalytic  34.69 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275292  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2397  lytic transglycosylase catalytic  44.71 
 
 		 375 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279322  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2866  Lytic transglycosylase catalytic  36.46 
 
 		 206 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918978  normal  0.297415 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  40.43 
 
 		 197 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8299  Lytic transglycosylase catalytic  37.17 
 
 		 325 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103911  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2904  soluble lytic transglycosylase  39.8 
 
 		 197 aa  60.5  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2606  Lytic transglycosylase catalytic  35.42 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  42.71 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  42.71 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1465  lytic transglycosylase catalytic  32.11 
 
 		 294 aa  58.5  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1443  transglycosylase SLT domain-containing protein  27.91 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  40.62 
 
 		 224 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1399  transglycosylase SLT domain-containing protein  27.91 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.861628  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1733  lytic transglycosylase catalytic  31.25 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254136  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  37.23 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2909  lytic transglycosylase, catalytic  34.17 
 
 		 262 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.368798 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2995  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 287 aa  54.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.891675  normal  0.0342596 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  30.17 
 
 		 241 aa  53.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2555  Lytic transglycosylase catalytic  39 
 
 		 260 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526771 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0514  Lytic transglycosylase catalytic  32.03 
 
 		 254 aa  52.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  31.67 
 
 		 188 aa  52.4  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1014  Lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 250 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  35.92 
 
 		 217 aa  51.6  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  31.73 
 
 		 280 aa  51.6  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  36.54 
 
 		 206 aa  51.2  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  40.23 
 
 		 201 aa  51.2  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  29.06 
 
 		 207 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  32.08 
 
 		 296 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  33.01 
 
 		 244 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  34.04 
 
 		 247 aa  49.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3883  lytic transglycosylase catalytic  34.34 
 
 		 252 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  34.12 
 
 		 388 aa  48.5  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  31.13 
 
 		 296 aa  48.5  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  33.63 
 
 		 212 aa  48.1  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  29.79 
 
 		 260 aa  47.8  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  40.51 
 
 		 215 aa  47.8  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9824  type IV system transglycosylase  35.78 
 
 		 322 aa  47.4  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 		 261 aa  47.4  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  29.59 
 
 		 233 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  39.53 
 
 		 256 aa  47  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  29.06 
 
 		 260 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2543  Lytic transglycosylase catalytic  32.63 
 
 		 249 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  31.13 
 
 		 285 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 279 aa  46.6  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  32.48 
 
 		 214 aa  45.8  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  36.84 
 
 		 300 aa  45.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  36.84 
 
 		 292 aa  45.4  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  28.32 
 
 		 282 aa  45.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  33.68 
 
 		 245 aa  45.1  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 208 aa  44.7  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2185  lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 427 aa  44.3  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000212239  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  39.73 
 
 		 202 aa  44.3  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 208 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  35.48 
 
 		 326 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  31.11 
 
 		 281 aa  43.9  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  35.92 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  38.78 
 
 		 593 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  38.78 
 
 		 593 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0652  lytic transglycosylase, catalytic  36.9 
 
 		 707 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  26.6 
 
 		 251 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  32.91 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  32.18 
 
 		 368 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  31.63 
 
 		 222 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  31 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  32.18 
 
 		 327 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  34.38 
 
 		 239 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  34.74 
 
 		 206 aa  42.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  33.65 
 
 		 243 aa  42.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  34.69 
 
 		 603 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  31.91 
 
 		 196 aa  42  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  29.47 
 
 		 198 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 		 217 aa  42  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  35.58 
 
 		 657 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  34.38 
 
 		 249 aa  42  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>