67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_0066 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_0066  transglycosylase SLT domain-containing protein  100 
 
 
287 aa  579  1e-164  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0067  transglycosylase SLT domain-containing protein  98.95 
 
 
287 aa  570  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0077  lytic transglycosylase catalytic  81.79 
 
 
280 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2103  lytic transglycosylase, catalytic  74.11 
 
 
249 aa  175  8e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25465  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0550  lytic transglycosylase, catalytic  63.91 
 
 
164 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2912  lytic murein transglycosylase  55.08 
 
 
368 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.647608  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2611  Lytic transglycosylase catalytic  61.54 
 
 
310 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2871  Lytic transglycosylase catalytic  61.54 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2303  lytic transglycosylase, catalytic  56.88 
 
 
150 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.176095 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0650  transglycosylase  56.88 
 
 
150 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3561  Lytic transglycosylase catalytic  52.17 
 
 
428 aa  129  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2108  lytic transglycosylase catalytic  51.94 
 
 
333 aa  129  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.344374 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2746  lytic transglycosylase catalytic  57.39 
 
 
259 aa  127  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1037  lytic transglycosylase, catalytic  52.89 
 
 
156 aa  125  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.166947 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1017  lytic transglycosylase, catalytic  53.72 
 
 
165 aa  125  8.000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.520766 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0582  lytic transglycosylase, catalytic  56.88 
 
 
150 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.378834  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6221  hypothetical protein  41.77 
 
 
277 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3663  Lytic transglycosylase catalytic  58.93 
 
 
309 aa  109  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3465  lytic transglycosylase catalytic  57.14 
 
 
298 aa  102  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3773  Lytic transglycosylase catalytic  57.14 
 
 
297 aa  102  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3772  lytic transglycosylase catalytic  56.88 
 
 
326 aa  102  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2463  lytic transglycosylase, catalytic  47.22 
 
 
158 aa  99.8  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2890  lytic transglycosylase, catalytic  49.5 
 
 
158 aa  97.4  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.576703  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2814  Lytic transglycosylase catalytic  54.7 
 
 
342 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2866  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 
206 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918978  normal  0.297415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2606  Lytic transglycosylase catalytic  48.96 
 
 
175 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2904  soluble lytic transglycosylase  49.48 
 
 
197 aa  85.1  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2017  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 
205 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275292  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1733  lytic transglycosylase catalytic  42.72 
 
 
219 aa  81.6  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254136  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1399  transglycosylase SLT domain-containing protein  41.24 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.861628  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1443  transglycosylase SLT domain-containing protein  41.24 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2397  lytic transglycosylase catalytic  53.45 
 
 
375 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279322  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  44.21 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  40.62 
 
 
263 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2909  lytic transglycosylase, catalytic  32.52 
 
 
262 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.368798 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2995  lytic transglycosylase, catalytic  34.02 
 
 
287 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.891675  normal  0.0342596 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1014  Lytic transglycosylase catalytic  33.96 
 
 
250 aa  57  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8299  Lytic transglycosylase catalytic  30.38 
 
 
325 aa  57  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  36.08 
 
 
260 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  36.08 
 
 
260 aa  53.5  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0514  Lytic transglycosylase catalytic  30.33 
 
 
254 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2555  Lytic transglycosylase catalytic  33.01 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00526771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2543  Lytic transglycosylase catalytic  32.63 
 
 
249 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  33.86 
 
 
196 aa  50.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1465  lytic transglycosylase catalytic  33.98 
 
 
294 aa  49.7  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  34.29 
 
 
282 aa  49.3  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  34.29 
 
 
198 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  34.91 
 
 
188 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3883  lytic transglycosylase catalytic  39.66 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  33.67 
 
 
196 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  34.31 
 
 
258 aa  47  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  32.99 
 
 
207 aa  45.8  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  34.02 
 
 
251 aa  45.8  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  32.73 
 
 
204 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  34.48 
 
 
203 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  36.78 
 
 
217 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  32 
 
 
202 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  33.66 
 
 
223 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  33.06 
 
 
603 aa  43.9  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  32.73 
 
 
204 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  32.65 
 
 
198 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5136  lytic transglycosylase catalytic  33.65 
 
 
228 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206246  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0399  Lytic transglycosylase catalytic  34.65 
 
 
574 aa  42.7  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5146  lytic transglycosylase, catalytic  32.65 
 
 
228 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00474071  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3221  lytic transglycosylase, catalytic  32.65 
 
 
228 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1168  lytic transglycosylase, catalytic  36.17 
 
 
669 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129127 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  29.91 
 
 
241 aa  42.7  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>