More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3883 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3883  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 252 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0514  Lytic transglycosylase catalytic  56.37 
 
 		 254 aa  198  9e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1465  lytic transglycosylase catalytic  47.15 
 
 		 294 aa  190  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2543  Lytic transglycosylase catalytic  47.76 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8299  Lytic transglycosylase catalytic  57.72 
 
 		 325 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103911  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2555  Lytic transglycosylase catalytic  62.5 
 
 		 260 aa  149  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1014  Lytic transglycosylase catalytic  49.73 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  55.81 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2909  lytic transglycosylase, catalytic  59.26 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.368798 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2995  lytic transglycosylase, catalytic  52.07 
 
 		 287 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.891675  normal  0.0342596 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2017  lytic transglycosylase, catalytic  43.75 
 
 		 205 aa  125  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275292  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  44.17 
 
 		 179 aa  125  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2904  soluble lytic transglycosylase  46.28 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2866  Lytic transglycosylase catalytic  44.92 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918978  normal  0.297415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2606  Lytic transglycosylase catalytic  42.96 
 
 		 175 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1733  lytic transglycosylase catalytic  41.53 
 
 		 219 aa  112  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254136  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1443  transglycosylase SLT domain-containing protein  40.5 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1399  transglycosylase SLT domain-containing protein  41.18 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.861628  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  40.16 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3772  lytic transglycosylase catalytic  42.55 
 
 		 326 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6221  hypothetical protein  41.41 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  43.4 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 709 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  40 
 
 		 709 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  40.78 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  40.78 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3773  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2814  Lytic transglycosylase catalytic  42.17 
 
 		 342 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3465  lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 298 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3561  Lytic transglycosylase catalytic  33.62 
 
 		 428 aa  67  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  41.75 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  41.24 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2108  lytic transglycosylase catalytic  38.95 
 
 		 333 aa  65.1  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.344374 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2397  lytic transglycosylase catalytic  40.96 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279322  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2463  lytic transglycosylase, catalytic  38.04 
 
 		 158 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  35.82 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  34.95 
 
 		 715 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2912  lytic murein transglycosylase  34.4 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.647608  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2890  lytic transglycosylase, catalytic  39.13 
 
 		 158 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.576703  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  40 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3663  Lytic transglycosylase catalytic  40.66 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  33.9 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2746  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  36.99 
 
 		 442 aa  62.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  38.24 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4513  Lytic transglycosylase catalytic  37.25 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  41.24 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  38.14 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  38.24 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  32.23 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  39.64 
 
 		 603 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  33.65 
 
 		 698 aa  60.1  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0650  transglycosylase  37.5 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2303  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.176095 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0187  lytic transglycosylase, catalytic  38.04 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0753643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  45.98 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  34.92 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  31.71 
 
 		 197 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  32.32 
 
 		 218 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  41.18 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0006  lytic transglycosylase catalytic  33.67 
 
 		 154 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  36.54 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  38.61 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  36.36 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  40.82 
 
 		 677 aa  57.4  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  34.31 
 
 		 196 aa  57  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2280  Slt family transglycosylase  34.69 
 
 		 688 aa  57  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  40.38 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  43.18 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  38.32 
 
 		 756 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  40.38 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  27.1 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24441  soluble lytic transglycosylase  36.36 
 
 		 677 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 721 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  38.14 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  37.38 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  39.51 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0582  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  41.24 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  38.95 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  37 
 
 		 719 aa  56.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  40.4 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  40.86 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  27.1 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  36 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  40.26 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  32.03 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2103  lytic transglycosylase, catalytic  35.79 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25465  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  40.21 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  33.33 
 
 		 747 aa  55.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  36.11 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  38.14 
 
 		 188 aa  55.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  44.71 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  27.1 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  38.61 
 
 		 750 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  27.1 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  37.65 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>