More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2606 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2606  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 175 aa  360  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2866  Lytic transglycosylase catalytic  65.38 
 
 		 206 aa  261  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918978  normal  0.297415 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  62.5 
 
 		 179 aa  206  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2904  soluble lytic transglycosylase  53.33 
 
 		 197 aa  194  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2017  lytic transglycosylase, catalytic  68.07 
 
 		 205 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275292  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1733  lytic transglycosylase catalytic  65.25 
 
 		 219 aa  167  8e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254136  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1399  transglycosylase SLT domain-containing protein  55.41 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.861628  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1443  transglycosylase SLT domain-containing protein  65.25 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  52.54 
 
 		 263 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3883  lytic transglycosylase catalytic  44.92 
 
 		 252 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8299  Lytic transglycosylase catalytic  45.76 
 
 		 325 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103911  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2543  Lytic transglycosylase catalytic  46.61 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1465  lytic transglycosylase catalytic  43.07 
 
 		 294 aa  114  8.999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2909  lytic transglycosylase, catalytic  43.23 
 
 		 262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.368798 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0514  Lytic transglycosylase catalytic  43.22 
 
 		 254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2555  Lytic transglycosylase catalytic  45.61 
 
 		 260 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1014  Lytic transglycosylase catalytic  43.9 
 
 		 250 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2995  lytic transglycosylase, catalytic  44.74 
 
 		 287 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.891675  normal  0.0342596 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2103  lytic transglycosylase, catalytic  45.69 
 
 		 249 aa  90.5  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25465  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0067  transglycosylase SLT domain-containing protein  48.96 
 
 		 287 aa  90.1  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0066  transglycosylase SLT domain-containing protein  48.96 
 
 		 287 aa  90.1  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0077  lytic transglycosylase catalytic  48.96 
 
 		 280 aa  89  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0550  lytic transglycosylase, catalytic  51.58 
 
 		 164 aa  87.8  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3772  lytic transglycosylase catalytic  49.43 
 
 		 326 aa  87  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2912  lytic murein transglycosylase  48.42 
 
 		 368 aa  86.3  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.647608  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2746  lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2463  lytic transglycosylase, catalytic  43.75 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2611  Lytic transglycosylase catalytic  45.26 
 
 		 310 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3663  Lytic transglycosylase catalytic  51.81 
 
 		 309 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2890  lytic transglycosylase, catalytic  42.71 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.576703  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  39.02 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2871  Lytic transglycosylase catalytic  45.26 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  38.79 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3465  lytic transglycosylase catalytic  49.4 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3773  Lytic transglycosylase catalytic  49.4 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  39.37 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2814  Lytic transglycosylase catalytic  43.68 
 
 		 342 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  45.74 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6221  hypothetical protein  38.66 
 
 		 277 aa  75.1  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  40.82 
 
 		 197 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  40.82 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2397  lytic transglycosylase catalytic  43.68 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279322  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2108  lytic transglycosylase catalytic  40.38 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.344374 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  37.84 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0582  lytic transglycosylase, catalytic  40.74 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  36.29 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  39.22 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3561  Lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 		 428 aa  72.4  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  36.44 
 
 		 260 aa  72  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  36.03 
 
 		 258 aa  72  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3276  lytic transglycosylase, catalytic  38.89 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  43.16 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  36.44 
 
 		 260 aa  70.9  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  39.83 
 
 		 206 aa  70.9  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0650  transglycosylase  37.96 
 
 		 150 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2303  lytic transglycosylase, catalytic  37.96 
 
 		 150 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.176095 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  35.56 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  35.56 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  35.56 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  35.54 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  43.14 
 
 		 603 aa  68.9  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  38.53 
 
 		 645 aa  68.9  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  38.61 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  33.33 
 
 		 241 aa  67.4  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  34.15 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  34.48 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  34.15 
 
 		 261 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  34.15 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.1 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  34.15 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  31.94 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  34.92 
 
 		 645 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  34.92 
 
 		 645 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  34.92 
 
 		 645 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  37.9 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  34.92 
 
 		 645 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  37.61 
 
 		 645 aa  65.9  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  37.61 
 
 		 645 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  34.92 
 
 		 645 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  34.92 
 
 		 645 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  37.61 
 
 		 645 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  37.4 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2280  Slt family transglycosylase  36.19 
 
 		 688 aa  65.5  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  33.33 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1037  lytic transglycosylase, catalytic  38.3 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166947 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  33.88 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3871  lytic murein transglycosylase  38.24 
 
 		 644 aa  64.3  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.006684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  33.33 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  36.44 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  33.33 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  45.21 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  37.1 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  40.59 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3677  lytic murein transglycosylase  38.32 
 
 		 641 aa  63.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.994757  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  36.54 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  40.59 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  36.54 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>