131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2397 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2397  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 375 aa  693    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279322  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2814  Lytic transglycosylase catalytic  69.89 
 
 		 342 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3663  Lytic transglycosylase catalytic  50.23 
 
 		 309 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3772  lytic transglycosylase catalytic  53.3 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3465  lytic transglycosylase catalytic  71.68 
 
 		 298 aa  138  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3773  Lytic transglycosylase catalytic  49.08 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6221  hypothetical protein  60.95 
 
 		 277 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0067  transglycosylase SLT domain-containing protein  55.83 
 
 		 287 aa  126  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2103  lytic transglycosylase, catalytic  59.81 
 
 		 249 aa  125  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25465  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0066  transglycosylase SLT domain-containing protein  55.83 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0077  lytic transglycosylase catalytic  55.83 
 
 		 280 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3561  Lytic transglycosylase catalytic  44.06 
 
 		 428 aa  122  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2912  lytic murein transglycosylase  50.45 
 
 		 368 aa  122  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.647608  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2108  lytic transglycosylase catalytic  49.12 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.344374 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2611  Lytic transglycosylase catalytic  45.13 
 
 		 310 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2746  lytic transglycosylase catalytic  48.78 
 
 		 259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2463  lytic transglycosylase, catalytic  55.56 
 
 		 158 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2890  lytic transglycosylase, catalytic  54.63 
 
 		 158 aa  114  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.576703  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2871  Lytic transglycosylase catalytic  45.13 
 
 		 305 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0582  lytic transglycosylase, catalytic  54.29 
 
 		 150 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0650  transglycosylase  51.92 
 
 		 150 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2303  lytic transglycosylase, catalytic  51.92 
 
 		 150 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.176095 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0550  lytic transglycosylase, catalytic  53.33 
 
 		 164 aa  98.6  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2904  soluble lytic transglycosylase  48.96 
 
 		 197 aa  85.9  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1037  lytic transglycosylase, catalytic  45.63 
 
 		 156 aa  84.3  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166947 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1017  lytic transglycosylase, catalytic  46.08 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.520766 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2017  lytic transglycosylase, catalytic  43.27 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275292  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1443  transglycosylase SLT domain-containing protein  41.9 
 
 		 214 aa  79  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1399  transglycosylase SLT domain-containing protein  41.9 
 
 		 214 aa  79  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.861628  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  42.57 
 
 		 179 aa  78.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1733  lytic transglycosylase catalytic  41.75 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254136  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0514  Lytic transglycosylase catalytic  38.61 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2866  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918978  normal  0.297415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2606  Lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1465  lytic transglycosylase catalytic  41.24 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1014  Lytic transglycosylase catalytic  41.58 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2555  Lytic transglycosylase catalytic  43.16 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2995  lytic transglycosylase, catalytic  36.19 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.891675  normal  0.0342596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2543  Lytic transglycosylase catalytic  38.95 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8299  Lytic transglycosylase catalytic  38.78 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103911  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3883  lytic transglycosylase catalytic  38.95 
 
 		 252 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2909  lytic transglycosylase, catalytic  40.62 
 
 		 262 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.368798 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  40.62 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  40.82 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  33.93 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  33.94 
 
 		 260 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  37.76 
 
 		 282 aa  59.3  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  37.5 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  35.66 
 
 		 285 aa  57  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  39.25 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  36.13 
 
 		 296 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  40.38 
 
 		 189 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  36.11 
 
 		 207 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  42.86 
 
 		 202 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  43.84 
 
 		 197 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  36.13 
 
 		 296 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1463  lytic transglycosylase, catalytic  34.62 
 
 		 413 aa  54.7  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4016  lytic transglycosylase, catalytic  46.15 
 
 		 239 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0926261  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  47.89 
 
 		 199 aa  55.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  38.37 
 
 		 188 aa  54.3  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  37.11 
 
 		 280 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  36.54 
 
 		 204 aa  54.3  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  38 
 
 		 328 aa  54.3  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  34.02 
 
 		 258 aa  53.5  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  40.38 
 
 		 198 aa  53.5  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  39.42 
 
 		 203 aa  53.1  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  34.95 
 
 		 196 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  44.12 
 
 		 197 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  35.42 
 
 		 217 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  44.12 
 
 		 218 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  42.65 
 
 		 224 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  31.25 
 
 		 283 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  50.98 
 
 		 174 aa  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  36.47 
 
 		 238 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  37.8 
 
 		 191 aa  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  29.41 
 
 		 261 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  43.84 
 
 		 203 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1424  lytic transglycosylase, catalytic  44.74 
 
 		 191 aa  51.2  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0284128  normal  0.0259883 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2611  lytic transglycosylase catalytic  45.45 
 
 		 251 aa  51.2  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.59616 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  37.11 
 
 		 217 aa  50.8  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  29.41 
 
 		 261 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  37.21 
 
 		 603 aa  50.4  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0029  Lytic transglycosylase catalytic  51.79 
 
 		 276 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240678  normal  0.132165 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  32.2 
 
 		 261 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  32.2 
 
 		 259 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  34.95 
 
 		 251 aa  50.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  32.52 
 
 		 747 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  34.02 
 
 		 198 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  36.71 
 
 		 211 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  37.93 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  36.47 
 
 		 243 aa  48.9  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2959  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 280 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2102  Lytic transglycosylase catalytic  39.24 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  35.64 
 
 		 239 aa  47.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  34.65 
 
 		 239 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  46.43 
 
 		 291 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  32.71 
 
 		 228 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  38.54 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  39.39 
 
 		 340 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  28.12 
 
 		 261 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>