More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3156 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 321 aa  629  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5136  Lytic transglycosylase catalytic  58.4 
 
 		 291 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1822  Lytic transglycosylase catalytic  54.58 
 
 		 307 aa  280  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4519  lytic transglycosylase catalytic  55.68 
 
 		 291 aa  272  6e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.821488 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2207  Lytic transglycosylase catalytic  53 
 
 		 328 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1931  lytic transglycosylase catalytic  52 
 
 		 328 aa  271  9e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.338077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0165  lytic transglycosylase catalytic  45.51 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  47.12 
 
 		 340 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0812  lytic transglycosylase catalytic  51.23 
 
 		 318 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5561  lytic transglycosylase catalytic  46.77 
 
 		 340 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0083  lytic transglycosylase catalytic  44.89 
 
 		 363 aa  232  6e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2453  lytic transglycosylase, catalytic  43.95 
 
 		 313 aa  222  8e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1423  lytic transglycosylase, catalytic  44.78 
 
 		 380 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.371346  normal  0.777047 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3321  lytic transglycosylase, catalytic  43.92 
 
 		 341 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3051  lytic transglycosylase, catalytic  42.67 
 
 		 347 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3554  Lytic transglycosylase catalytic  43.34 
 
 		 343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.278452  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2399  lytic transglycosylase, catalytic  40.85 
 
 		 330 aa  205  9e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.537476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4762  hypothetical protein  43.87 
 
 		 359 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1908  lytic transglycosylase catalytic  63.51 
 
 		 340 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1642  Lytic transglycosylase catalytic  39.31 
 
 		 318 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.517952 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1242  lytic transglycosylase catalytic  39.72 
 
 		 328 aa  172  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.270703  normal  0.374797 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1459  Lytic transglycosylase catalytic  41.06 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1651  lytic transglycosylase catalytic  45.8 
 
 		 299 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1512  lytic transglycosylase, catalytic  40.98 
 
 		 286 aa  162  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.219216  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0809  lytic transglycosylase, catalytic  41.54 
 
 		 303 aa  152  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2733  lytic transglycosylase, catalytic  63.41 
 
 		 246 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2102  Lytic transglycosylase catalytic  58.27 
 
 		 239 aa  135  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1463  transglycosylase  59.86 
 
 		 262 aa  129  9.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3004  lytic transglycosylase catalytic  56.25 
 
 		 278 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1277  Lytic transglycosylase catalytic  64.57 
 
 		 264 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0029  Lytic transglycosylase catalytic  62.81 
 
 		 276 aa  116  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240678  normal  0.132165 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  43.09 
 
 		 280 aa  93.6  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  46.96 
 
 		 291 aa  92.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4537  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  56.6 
 
 		 448 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  46.49 
 
 		 438 aa  92  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  43.44 
 
 		 1160 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  40.77 
 
 		 260 aa  92  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  43.97 
 
 		 251 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  40.52 
 
 		 261 aa  90.9  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2210  lytic transglycosylase, catalytic  49.12 
 
 		 218 aa  90.5  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 260 aa  90.1  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  44.2 
 
 		 370 aa  89.7  7e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  39.66 
 
 		 261 aa  89  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  39.66 
 
 		 261 aa  89  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  39.66 
 
 		 261 aa  89  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  39.66 
 
 		 261 aa  89  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  47.06 
 
 		 217 aa  89  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  47.37 
 
 		 215 aa  89  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0443  lytic transglycosylase, catalytic  49.12 
 
 		 218 aa  88.6  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.270121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  39.66 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2959  lytic transglycosylase catalytic  42.75 
 
 		 280 aa  88.2  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  39.66 
 
 		 261 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  39.66 
 
 		 261 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  39.66 
 
 		 259 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  40.52 
 
 		 238 aa  87  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  47.79 
 
 		 202 aa  87  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  42.74 
 
 		 242 aa  86.7  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  41.94 
 
 		 283 aa  86.3  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  40.4 
 
 		 206 aa  85.9  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  38.16 
 
 		 196 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  42.52 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  41.12 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  40.24 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  44.35 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  44.63 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  45.61 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  45.54 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  41.18 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  39.58 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  39.06 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  39.01 
 
 		 442 aa  83.2  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  44.92 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  44.35 
 
 		 247 aa  82  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  42.02 
 
 		 174 aa  82  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 191 aa  81.6  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  45.22 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0976  Lytic transglycosylase catalytic  42.31 
 
 		 223 aa  82  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  50 
 
 		 201 aa  81.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  38.79 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  41.54 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3823  lytic transglycosylase catalytic  34.97 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  40.32 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  41.67 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0754  lytic transglycosylase catalytic  42.61 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  42.98 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  42.98 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  40.29 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3082  Lytic transglycosylase catalytic  43.59 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  37.68 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  43.75 
 
 		 217 aa  79  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1794  putative lytic transglycosylase  40.69 
 
 		 204 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4016  lytic transglycosylase, catalytic  45.05 
 
 		 239 aa  79  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0926261  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  41.53 
 
 		 212 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  43.69 
 
 		 199 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  44.25 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  44.25 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  39.5 
 
 		 228 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4010  lytic transglycosylase catalytic  35.86 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132288 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  42.98 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>