101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2871 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2871  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 305 aa  620  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2611  Lytic transglycosylase catalytic  92.26 
 
 		 310 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2912  lytic murein transglycosylase  45.79 
 
 		 368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.647608  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2108  lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.344374 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2103  lytic transglycosylase, catalytic  59.62 
 
 		 249 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25465  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0077  lytic transglycosylase catalytic  62.5 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0067  transglycosylase SLT domain-containing protein  61.54 
 
 		 287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0066  transglycosylase SLT domain-containing protein  61.54 
 
 		 287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0550  lytic transglycosylase, catalytic  55.96 
 
 		 164 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1037  lytic transglycosylase, catalytic  45.26 
 
 		 156 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166947 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0650  transglycosylase  52.29 
 
 		 150 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2303  lytic transglycosylase, catalytic  52.29 
 
 		 150 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.176095 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1017  lytic transglycosylase, catalytic  55.77 
 
 		 165 aa  116  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.520766 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2746  lytic transglycosylase catalytic  54.37 
 
 		 259 aa  114  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0582  lytic transglycosylase, catalytic  49.54 
 
 		 150 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3561  Lytic transglycosylase catalytic  46.15 
 
 		 428 aa  109  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6221  hypothetical protein  37.96 
 
 		 277 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2814  Lytic transglycosylase catalytic  46.43 
 
 		 342 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2397  lytic transglycosylase catalytic  45.13 
 
 		 375 aa  87  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279322  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3663  Lytic transglycosylase catalytic  46.99 
 
 		 309 aa  87  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2463  lytic transglycosylase, catalytic  42.55 
 
 		 158 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  47.57 
 
 		 179 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3772  lytic transglycosylase catalytic  42.34 
 
 		 326 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2890  lytic transglycosylase, catalytic  39.36 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.576703  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2606  Lytic transglycosylase catalytic  45.26 
 
 		 175 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3465  lytic transglycosylase catalytic  43.64 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3773  Lytic transglycosylase catalytic  43.64 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1443  transglycosylase SLT domain-containing protein  34.48 
 
 		 214 aa  75.5  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2866  Lytic transglycosylase catalytic  43.16 
 
 		 206 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918978  normal  0.297415 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1399  transglycosylase SLT domain-containing protein  34.48 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.861628  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2017  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275292  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2904  soluble lytic transglycosylase  40.35 
 
 		 197 aa  72.4  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1733  lytic transglycosylase catalytic  35.92 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254136  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2995  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.891675  normal  0.0342596 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1014  Lytic transglycosylase catalytic  28.18 
 
 		 250 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  36.49 
 
 		 197 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2555  Lytic transglycosylase catalytic  31.33 
 
 		 260 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  31.58 
 
 		 224 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  34.83 
 
 		 197 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  32.63 
 
 		 218 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 203 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  32.08 
 
 		 206 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  30.77 
 
 		 282 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 263 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8299  Lytic transglycosylase catalytic  31.76 
 
 		 325 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103911  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  33.65 
 
 		 215 aa  49.7  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  27.88 
 
 		 198 aa  49.3  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  36.26 
 
 		 299 aa  48.9  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  38.36 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  38.36 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1465  lytic transglycosylase catalytic  30.37 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0514  Lytic transglycosylase catalytic  28.04 
 
 		 254 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  38.36 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  38.36 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  32.05 
 
 		 438 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0175  transglycosylase SLT domain-containing protein  29.06 
 
 		 553 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  38.24 
 
 		 326 aa  47.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5361  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 333 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.716209 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  38.36 
 
 		 251 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  38.36 
 
 		 251 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.36 
 
 		 239 aa  47  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  29.52 
 
 		 241 aa  46.6  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  35.53 
 
 		 174 aa  46.6  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1463  transglycosylase  32 
 
 		 262 aa  46.6  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  32.43 
 
 		 245 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0399  Lytic transglycosylase catalytic  34.57 
 
 		 574 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  32.47 
 
 		 362 aa  46.2  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  35 
 
 		 370 aa  46.2  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 328 aa  46.2  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  31.25 
 
 		 243 aa  45.8  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  35.48 
 
 		 233 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  30.77 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2959  lytic transglycosylase catalytic  31.17 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  34.25 
 
 		 202 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  29.01 
 
 		 362 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  32.61 
 
 		 196 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  29.79 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  36.49 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  35.71 
 
 		 209 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3883  lytic transglycosylase catalytic  29.47 
 
 		 252 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2543  Lytic transglycosylase catalytic  27.88 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  34.15 
 
 		 242 aa  43.9  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  36.99 
 
 		 249 aa  44.3  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  33.98 
 
 		 247 aa  44.3  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1034  extracellular solute-binding protein  34.88 
 
 		 505 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4561  lytic transglycosylase catalytic  31.17 
 
 		 360 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000593543  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  29.79 
 
 		 260 aa  43.9  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  34.85 
 
 		 201 aa  43.9  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  32.11 
 
 		 202 aa  43.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  36.76 
 
 		 677 aa  43.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0177  Lytic transglycosylase catalytic  33.75 
 
 		 429 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119021 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  29.79 
 
 		 188 aa  43.1  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2909  lytic transglycosylase, catalytic  32.63 
 
 		 262 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.368798 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  31.76 
 
 		 207 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  28.92 
 
 		 251 aa  42.7  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2073  Lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 		 195 aa  42.7  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000112057  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  36.76 
 
 		 226 aa  42.7  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1463  lytic transglycosylase, catalytic  31.25 
 
 		 413 aa  42.4  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  35.14 
 
 		 245 aa  42.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  32.98 
 
 		 304 aa  42.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>