155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2611 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2611  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 310 aa  630  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2871  Lytic transglycosylase catalytic  92.26 
 
 		 305 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2912  lytic murein transglycosylase  45.65 
 
 		 368 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.647608  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2108  lytic transglycosylase catalytic  38.39 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.344374 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2103  lytic transglycosylase, catalytic  45.09 
 
 		 249 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25465  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0077  lytic transglycosylase catalytic  62.5 
 
 		 280 aa  136  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0067  transglycosylase SLT domain-containing protein  61.54 
 
 		 287 aa  136  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0066  transglycosylase SLT domain-containing protein  61.54 
 
 		 287 aa  136  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0550  lytic transglycosylase, catalytic  55.96 
 
 		 164 aa  128  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1037  lytic transglycosylase, catalytic  46.72 
 
 		 156 aa  126  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166947 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0650  transglycosylase  55.05 
 
 		 150 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2303  lytic transglycosylase, catalytic  55.05 
 
 		 150 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.176095 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2746  lytic transglycosylase catalytic  56.31 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0582  lytic transglycosylase, catalytic  50.46 
 
 		 150 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1017  lytic transglycosylase, catalytic  53.85 
 
 		 165 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.520766 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3561  Lytic transglycosylase catalytic  47.86 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6221  hypothetical protein  37.23 
 
 		 277 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2814  Lytic transglycosylase catalytic  46.43 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2397  lytic transglycosylase catalytic  45.13 
 
 		 375 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279322  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2463  lytic transglycosylase, catalytic  42.55 
 
 		 158 aa  88.6  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  47.57 
 
 		 179 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3663  Lytic transglycosylase catalytic  44.58 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2890  lytic transglycosylase, catalytic  39.36 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.576703  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3772  lytic transglycosylase catalytic  42.34 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2606  Lytic transglycosylase catalytic  45.26 
 
 		 175 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2866  Lytic transglycosylase catalytic  43.16 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918978  normal  0.297415 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2017  lytic transglycosylase, catalytic  41.05 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275292  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1443  transglycosylase SLT domain-containing protein  36.79 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1399  transglycosylase SLT domain-containing protein  36.79 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.861628  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2904  soluble lytic transglycosylase  40.35 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3773  Lytic transglycosylase catalytic  41.82 
 
 		 297 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3465  lytic transglycosylase catalytic  41.82 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1733  lytic transglycosylase catalytic  35.92 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254136  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2995  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.891675  normal  0.0342596 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  35.11 
 
 		 197 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  35.96 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  33.68 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  34.19 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  31.58 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  32.08 
 
 		 206 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  32.63 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  29.25 
 
 		 198 aa  53.5  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1014  Lytic transglycosylase catalytic  25.6 
 
 		 250 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8299  Lytic transglycosylase catalytic  31.76 
 
 		 325 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103911  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0514  Lytic transglycosylase catalytic  27.78 
 
 		 254 aa  53.1  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  28.48 
 
 		 282 aa  53.1  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1465  lytic transglycosylase catalytic  30.37 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  32.99 
 
 		 215 aa  50.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2555  Lytic transglycosylase catalytic  29.27 
 
 		 260 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526771 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  35.56 
 
 		 328 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  32.05 
 
 		 438 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0399  Lytic transglycosylase catalytic  35.8 
 
 		 574 aa  50.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  33.77 
 
 		 362 aa  50.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  35.53 
 
 		 174 aa  49.3  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  29.52 
 
 		 241 aa  49.3  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3883  lytic transglycosylase catalytic  29.47 
 
 		 252 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  35.62 
 
 		 202 aa  49.3  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  29.79 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  35 
 
 		 370 aa  48.9  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  31.25 
 
 		 362 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  30.77 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2959  lytic transglycosylase catalytic  32.47 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  32.61 
 
 		 196 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  29.79 
 
 		 260 aa  47.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  25.47 
 
 		 261 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  36.49 
 
 		 272 aa  47.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  36.36 
 
 		 201 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0177  Lytic transglycosylase catalytic  36.25 
 
 		 429 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119021 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2543  Lytic transglycosylase catalytic  27.88 
 
 		 249 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5361  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 333 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.716209 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4561  lytic transglycosylase catalytic  32.47 
 
 		 360 aa  47.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000593543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  25.47 
 
 		 261 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  35.16 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  33.03 
 
 		 202 aa  47  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2909  lytic transglycosylase, catalytic  32.63 
 
 		 262 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.368798 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  25.47 
 
 		 261 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  35.11 
 
 		 304 aa  46.6  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  29.79 
 
 		 188 aa  46.2  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1463  transglycosylase  32 
 
 		 262 aa  46.2  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  35.62 
 
 		 239 aa  45.8  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  38.27 
 
 		 645 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  38.27 
 
 		 645 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  29.49 
 
 		 196 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  32.43 
 
 		 245 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  38.27 
 
 		 645 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  38.27 
 
 		 645 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0175  transglycosylase SLT domain-containing protein  27.35 
 
 		 553 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002444  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  30.3 
 
 		 372 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000187183  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1424  lytic transglycosylase, catalytic  41.27 
 
 		 191 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0284128  normal  0.0259883 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  35.62 
 
 		 239 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  35.62 
 
 		 239 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  35.14 
 
 		 189 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  30.43 
 
 		 204 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  38.27 
 
 		 645 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  36.76 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  35.62 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  38.27 
 
 		 645 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  38.27 
 
 		 645 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  38.27 
 
 		 645 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  31.76 
 
 		 207 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>