148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2303 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0650  transglycosylase  100 
 
 		 150 aa  303  6e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2303  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 150 aa  303  6e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.176095 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0582  lytic transglycosylase, catalytic  85.71 
 
 		 150 aa  227  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0550  lytic transglycosylase, catalytic  49.39 
 
 		 164 aa  156  9e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1017  lytic transglycosylase, catalytic  59.13 
 
 		 165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.520766 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2103  lytic transglycosylase, catalytic  51.61 
 
 		 249 aa  142  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25465  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1037  lytic transglycosylase, catalytic  46.98 
 
 		 156 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166947 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0077  lytic transglycosylase catalytic  56.64 
 
 		 280 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0066  transglycosylase SLT domain-containing protein  56.88 
 
 		 287 aa  130  7.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0067  transglycosylase SLT domain-containing protein  56.88 
 
 		 287 aa  130  9e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2611  Lytic transglycosylase catalytic  55.05 
 
 		 310 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2108  lytic transglycosylase catalytic  49.59 
 
 		 333 aa  124  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.344374 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2871  Lytic transglycosylase catalytic  52.29 
 
 		 305 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2912  lytic murein transglycosylase  50 
 
 		 368 aa  117  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.647608  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2746  lytic transglycosylase catalytic  42.55 
 
 		 259 aa  100  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3561  Lytic transglycosylase catalytic  46.23 
 
 		 428 aa  99  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6221  hypothetical protein  43.48 
 
 		 277 aa  90.1  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3663  Lytic transglycosylase catalytic  50.49 
 
 		 309 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2814  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 342 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2397  lytic transglycosylase catalytic  51.92 
 
 		 375 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279322  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3772  lytic transglycosylase catalytic  49.06 
 
 		 326 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2463  lytic transglycosylase, catalytic  47.19 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3773  Lytic transglycosylase catalytic  47.57 
 
 		 297 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3465  lytic transglycosylase catalytic  47.57 
 
 		 298 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2890  lytic transglycosylase, catalytic  47.06 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.576703  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2904  soluble lytic transglycosylase  47.92 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2555  Lytic transglycosylase catalytic  40.57 
 
 		 260 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526771 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2866  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918978  normal  0.297415 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8299  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103911  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1014  Lytic transglycosylase catalytic  39.62 
 
 		 250 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2606  Lytic transglycosylase catalytic  37.96 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2017  lytic transglycosylase, catalytic  37.82 
 
 		 205 aa  70.1  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275292  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1465  lytic transglycosylase catalytic  38.95 
 
 		 294 aa  68.2  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0514  Lytic transglycosylase catalytic  39.77 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2543  Lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  34.95 
 
 		 224 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  34.95 
 
 		 197 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  34.95 
 
 		 218 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  37.23 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  32.38 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2909  lytic transglycosylase, catalytic  40.96 
 
 		 262 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.368798 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2995  lytic transglycosylase, catalytic  34.62 
 
 		 287 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.891675  normal  0.0342596 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1733  lytic transglycosylase catalytic  34.74 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254136  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3883  lytic transglycosylase catalytic  37.08 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_004310  BR1443  transglycosylase SLT domain-containing protein  34.74 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1399  transglycosylase SLT domain-containing protein  34.74 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.861628  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  32.73 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  35.11 
 
 		 206 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  40 
 
 		 388 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  31.91 
 
 		 215 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4498  lytic transglycosylase, catalytic  37.27 
 
 		 404 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  31.73 
 
 		 296 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  31.73 
 
 		 296 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1059  lytic transglycosylase, catalytic  40.51 
 
 		 608 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  30.77 
 
 		 285 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1463  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 413 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  29.41 
 
 		 280 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  36.49 
 
 		 196 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  35.23 
 
 		 260 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  32.65 
 
 		 283 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  36.49 
 
 		 207 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0177  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 429 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119021 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1239  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 404 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  32 
 
 		 198 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1337  lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 		 408 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.545884  normal  0.0328335 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1407  lytic transglycosylase, catalytic  34.62 
 
 		 179 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1265  lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 		 407 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.254605 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1355  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 408 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0669029  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  32.98 
 
 		 203 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 326 aa  47  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  35.56 
 
 		 226 aa  47  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  26.36 
 
 		 241 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2689  Lytic transglycosylase catalytic  36.71 
 
 		 752 aa  46.2  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  30.16 
 
 		 233 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  34.04 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  29.59 
 
 		 204 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  32.63 
 
 		 198 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  31.19 
 
 		 208 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0193  lytic transglycosylase, catalytic  36.17 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  31.68 
 
 		 603 aa  45.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  31.63 
 
 		 204 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  32.98 
 
 		 202 aa  44.7  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  29.57 
 
 		 190 aa  44.3  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1424  lytic transglycosylase, catalytic  35.64 
 
 		 191 aa  44.3  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0284128  normal  0.0259883 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2135  lytic transglycosylase catalytic  32.61 
 
 		 233 aa  44.3  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0873  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 599 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  34.41 
 
 		 202 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1089  lytic transglycosylase catalytic  28.3 
 
 		 238 aa  43.9  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  35.71 
 
 		 280 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  33.68 
 
 		 218 aa  43.9  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  32.43 
 
 		 256 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0297  lytic transglycosylase, catalytic  27.43 
 
 		 385 aa  43.9  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.277763  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 222 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  27.66 
 
 		 282 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  31.82 
 
 		 247 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0964  Lytic transglycosylase catalytic  35.05 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1328  Lytic transglycosylase catalytic  30.97 
 
 		 218 aa  43.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1938  lytic transglycosylase catalytic  34.55 
 
 		 438 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0154763 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  34.12 
 
 		 199 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>