More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2689 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2689  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
752 aa  1523    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  41.61 
 
 
804 aa  112  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  41.45 
 
 
715 aa  110  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  37.82 
 
 
195 aa  99.4  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  40.26 
 
 
709 aa  97.8  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  42.75 
 
 
776 aa  94.7  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  34.17 
 
 
719 aa  94.7  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  42.75 
 
 
774 aa  94.7  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  42.75 
 
 
774 aa  94.4  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  38.96 
 
 
709 aa  93.6  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  42.03 
 
 
757 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  34.57 
 
 
833 aa  93.2  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  40.58 
 
 
760 aa  92.4  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2690  lytic transglycosylase catalytic  32.75 
 
 
800 aa  90.5  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  41.13 
 
 
788 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3087  lytic transglycosylase catalytic  39.24 
 
 
726 aa  90.5  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522258  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  39.24 
 
 
747 aa  89  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  38.96 
 
 
664 aa  88.2  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  25.84 
 
 
729 aa  87  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  37.13 
 
 
782 aa  85.9  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  37.93 
 
 
650 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  37.97 
 
 
663 aa  84.7  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  37.93 
 
 
642 aa  84  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  38.26 
 
 
690 aa  84.3  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  36.24 
 
 
642 aa  83.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  36.81 
 
 
663 aa  83.6  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  37.24 
 
 
657 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  37.24 
 
 
649 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  37.93 
 
 
642 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1765  soluble lytic murein transglycosylase  37.09 
 
 
739 aa  83.2  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  34.93 
 
 
647 aa  83.2  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1874  lytic transglycosylase, catalytic  35.54 
 
 
706 aa  82.8  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.331721  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  38.57 
 
 
207 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0849  Lytic transglycosylase catalytic  36.84 
 
 
747 aa  82.8  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.943706 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  37.24 
 
 
660 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2046  lytic transglycosylase, catalytic  37.09 
 
 
735 aa  83.2  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.490447  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  37.24 
 
 
641 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  35.03 
 
 
637 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  34.39 
 
 
182 aa  81.6  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  36.36 
 
 
669 aa  81.6  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  34.59 
 
 
693 aa  81.6  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  36.24 
 
 
678 aa  81.6  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  35.71 
 
 
187 aa  81.3  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  36.55 
 
 
642 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  32.14 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  37.68 
 
 
654 aa  80.9  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  35.22 
 
 
603 aa  80.9  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  36.13 
 
 
716 aa  80.9  0.00000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  32.12 
 
 
777 aa  80.9  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  32.89 
 
 
653 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  36.17 
 
 
196 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  34.13 
 
 
593 aa  79.3  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  39.1 
 
 
748 aa  80.1  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  41.74 
 
 
657 aa  79.3  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  35.03 
 
 
660 aa  79.7  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  35.81 
 
 
686 aa  79.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  41.74 
 
 
657 aa  79.3  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  38.41 
 
 
645 aa  78.6  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1715  Lytic transglycosylase catalytic  35.95 
 
 
652 aa  78.6  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.728382  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  34.9 
 
 
690 aa  78.6  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0881  putative soluble lytic transglycosylase  36.08 
 
 
653 aa  78.2  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2541  lytic transglycosylase, catalytic  36.08 
 
 
677 aa  78.2  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00863759  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  34.19 
 
 
187 aa  78.6  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  32.89 
 
 
721 aa  78.2  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  33.53 
 
 
593 aa  78.2  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  38.36 
 
 
756 aa  78.2  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  34.73 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  37.41 
 
 
645 aa  77.4  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  37.41 
 
 
645 aa  77.4  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  37.41 
 
 
645 aa  77.4  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4906  lytic murein transglycosylase  37.41 
 
 
645 aa  77.4  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  37.41 
 
 
645 aa  77.4  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  33.96 
 
 
659 aa  77  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  38.31 
 
 
643 aa  77  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 
724 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  37.41 
 
 
645 aa  77.4  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  37.41 
 
 
645 aa  77.4  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4992  lytic murein transglycosylase  37.41 
 
 
645 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.971097 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  37.41 
 
 
645 aa  77.4  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4994  lytic murein transglycosylase  37.41 
 
 
645 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  35.86 
 
 
643 aa  77  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  37.41 
 
 
645 aa  77.4  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4833  lytic murein transglycosylase  37.41 
 
 
645 aa  77  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  35.66 
 
 
193 aa  76.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4940  lytic murein transglycosylase  37.41 
 
 
645 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.183926  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  37.41 
 
 
645 aa  77.4  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0652  lytic transglycosylase, catalytic  33.55 
 
 
707 aa  76.6  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2111  lytic transglycosylase, catalytic  40.74 
 
 
641 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.396511  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  33.77 
 
 
628 aa  75.9  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1863  lytic transglycosylase, catalytic  40.74 
 
 
641 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.646597  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  37.11 
 
 
750 aa  75.5  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  34.87 
 
 
650 aa  75.1  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0884  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 
188 aa  75.5  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.10912  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  37.11 
 
 
750 aa  75.1  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  27.56 
 
 
616 aa  75.5  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2105  lytic transglycosylase, catalytic  40.3 
 
 
641 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.828929  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  33.8 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  33.77 
 
 
730 aa  74.7  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  35.06 
 
 
642 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  35.06 
 
 
642 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>