130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1265 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1265  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 407 aa  812    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.254605 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1239  lytic transglycosylase, catalytic  94.36 
 
 		 404 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4498  lytic transglycosylase, catalytic  78.42 
 
 		 404 aa  580  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1337  lytic transglycosylase catalytic  76.96 
 
 		 408 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.545884  normal  0.0328335 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1355  lytic transglycosylase, catalytic  76.19 
 
 		 408 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0669029  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0873  lytic transglycosylase, catalytic  84.24 
 
 		 599 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1938  lytic transglycosylase catalytic  71.84 
 
 		 438 aa  473  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0154763 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5422  Lytic transglycosylase catalytic  55.49 
 
 		 183 aa  179  8e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984316  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5017  Lytic transglycosylase catalytic  64.8 
 
 		 183 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.260237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5550  lytic transglycosylase catalytic  66.37 
 
 		 141 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0239978 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6566  lytic transglycosylase catalytic  59.52 
 
 		 140 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6296  lytic transglycosylase, catalytic  63.56 
 
 		 140 aa  157  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.270773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5196  Lytic transglycosylase catalytic  64.29 
 
 		 158 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1531  Lytic transglycosylase catalytic  64.29 
 
 		 158 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7409  Lytic transglycosylase catalytic  62.61 
 
 		 226 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5033  Lytic transglycosylase catalytic  62.07 
 
 		 145 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5439  Lytic transglycosylase catalytic  61.74 
 
 		 145 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0379  invasion protein  56.41 
 
 		 146 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135493  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05356  putative lipoprotein  54.46 
 
 		 232 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.592846  normal  0.453874 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0053  lytic transglycosylase, catalytic  49.22 
 
 		 159 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0063  lytic transglycosylase catalytic  49.22 
 
 		 149 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0565  BapC protein  49.24 
 
 		 187 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146526  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3245  lytic transglycosylase  48.44 
 
 		 149 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0007  lytic transglycosylase, catalytic  50.86 
 
 		 164 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37161  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0063  lytic transglycosylase, catalytic  50.86 
 
 		 164 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0082  lytic transglycosylase catalytic  50.86 
 
 		 161 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0006  BapC protein  47.15 
 
 		 149 aa  123  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1524  BapC protein  51.69 
 
 		 187 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177877  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2079  BapC protein  51.69 
 
 		 187 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.22209  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2156  BapC protein  51.69 
 
 		 187 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2068  BapC protein  51.69 
 
 		 187 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0527025  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0760  BapC protein  51.69 
 
 		 187 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.832936  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0064  lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 148 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3519  putative ipgF protein  47.41 
 
 		 216 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2787  ipgF protein, putative  47.41 
 
 		 152 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.062319  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0219  HpaH precursor  47.41 
 
 		 161 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1891  putative ipgF protein  47.41 
 
 		 152 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.65052  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0006  putative invasion protein  47.41 
 
 		 161 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2661  putative ipgF protein  47.41 
 
 		 152 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0006  putative invasion protein  47.41 
 
 		 161 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0847  BapC protein  46.38 
 
 		 182 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0195  lytic transglycosylase catalytic protein  46.15 
 
 		 239 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2121  transglycosylase SLT domain-containing protein  42.28 
 
 		 168 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3069  lytic transglycosylase catalytic  45.45 
 
 		 147 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0145622 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0177  Lytic transglycosylase catalytic  45.3 
 
 		 239 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000012846 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4502  hypothetical protein  42.14 
 
 		 148 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.362894 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5894  lytic transglycosylase catalytic  47.37 
 
 		 161 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.431421  normal  0.0993718 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1098  Lytic transglycosylase catalytic  35 
 
 		 213 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.891571  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3796  lytic transglycosylase, catalytic  47.06 
 
 		 179 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.823369  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5666  lytic transglycosylase catalytic  44.72 
 
 		 155 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326026  hitchhiker  0.0069947 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5883  lytic transglycosylase, catalytic  45.16 
 
 		 155 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.161206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2896  hypothetical protein  46.15 
 
 		 170 aa  111  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3673  lytic transglycosylase catalytic  47.75 
 
 		 164 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.25232 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3935  Lytic transglycosylase catalytic  43.8 
 
 		 148 aa  110  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_23  transglycosylase PilT  45.74 
 
 		 145 aa  109  8.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.846222  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0193  lytic transglycosylase, catalytic  44.96 
 
 		 168 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1431  lytic transglycosylase, catalytic  41.83 
 
 		 170 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3138  Lytic transglycosylase catalytic  45.95 
 
 		 157 aa  106  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.82617  normal  0.443685 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2099  lytic transglycosylase, catalytic  40.6 
 
 		 210 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462435  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0005  transglycosylase SLT domain-containing protein  47.62 
 
 		 168 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2772  Lytic transglycosylase catalytic  45.95 
 
 		 157 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4766  Lytic transglycosylase catalytic  46.43 
 
 		 161 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0248  Lytic transglycosylase catalytic  46.55 
 
 		 168 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2644  lytic transglycosylase, catalytic  40.85 
 
 		 182 aa  103  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5006  lytic transglycosylase catalytic  60 
 
 		 136 aa  103  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0840995  normal  0.821315 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2361  lytic transglycosylase, catalytic  42.48 
 
 		 155 aa  99.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0782158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2999  invasion protein IagB  40.94 
 
 		 160 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000303944  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3066  invasion protein IagB  40.94 
 
 		 160 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.490533 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3082  cell invasion protein  40.94 
 
 		 160 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000116628 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3187  cell invasion protein  40.94 
 
 		 160 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.927975 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3030  invasion protein IagB  40.94 
 
 		 160 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0325324 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2311  lytic transglycosylase, catalytic  43.41 
 
 		 183 aa  96.7  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0964  Lytic transglycosylase catalytic  40.62 
 
 		 153 aa  96.3  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4488  lytic transglycosylase, catalytic  36.57 
 
 		 248 aa  96.3  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1544  lytic transglycosylase, catalytic  42.52 
 
 		 175 aa  91.3  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0439375  normal  0.269164 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6234  lytic transglycosylase catalytic  39.55 
 
 		 151 aa  90.5  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5233  lytic transglycosylase, catalytic  44.35 
 
 		 203 aa  89.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00145184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0168  protein IpgF  42.37 
 
 		 152 aa  86.3  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00546577  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5437  lytic transglycosylase, catalytic  39.47 
 
 		 179 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.43825  normal  0.56373 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4243  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 178 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.547585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4187  lytic transglycosylase, catalytic  38.62 
 
 		 166 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000629  decreased coverage  0.0000117899 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03391  Hpa2  42.27 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4280  lytic transglycosylase, catalytic  39.82 
 
 		 157 aa  81.3  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0111  lytic transglycosylase PilT  32.33 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4125  lytic transglycosylase PilT  31.25 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476698 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5072  transglycosylase SLT domain protein  34.33 
 
 		 152 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.110513 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0632  Lytic transglycosylase catalytic  37.27 
 
 		 175 aa  77.8  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0043  lytic transglycosylase  35.37 
 
 		 215 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0042  pilT protein  35.95 
 
 		 163 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0049  pilT protein, putative  37.14 
 
 		 150 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0163  lytic transglycosylase, catalytic  38.83 
 
 		 145 aa  73.9  0.000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0042056  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0253  Lytic transglycosylase catalytic  31.1 
 
 		 164 aa  70.9  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0011  conjugal transfer protein  32.03 
 
 		 159 aa  67.8  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1033  Lytic transglycosylase catalytic  37.07 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6789  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 165 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0060  hypothetical protein  30.16 
 
 		 187 aa  65.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00816784 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0882  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 132 aa  62.8  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3682  lytic transglycosylase catalytic  31.45 
 
 		 170 aa  60.8  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.325069 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4262  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 162 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5238  hypothetical protein  30.05 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.413163  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>