194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2463 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2463  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 158 aa  323  8.000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2890  lytic transglycosylase, catalytic  87.34 
 
 		 158 aa  257  4e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.576703  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6221  hypothetical protein  62.5 
 
 		 277 aa  144  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2108  lytic transglycosylase catalytic  58.18 
 
 		 333 aa  137  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.344374 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3561  Lytic transglycosylase catalytic  53.77 
 
 		 428 aa  133  8e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2746  lytic transglycosylase catalytic  60.78 
 
 		 259 aa  128  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2912  lytic murein transglycosylase  61.17 
 
 		 368 aa  128  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.647608  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0067  transglycosylase SLT domain-containing protein  52.94 
 
 		 287 aa  121  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0066  transglycosylase SLT domain-containing protein  52.94 
 
 		 287 aa  120  9e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0077  lytic transglycosylase catalytic  53.78 
 
 		 280 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0550  lytic transglycosylase, catalytic  52.31 
 
 		 164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2103  lytic transglycosylase, catalytic  52.14 
 
 		 249 aa  113  8.999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25465  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3772  lytic transglycosylase catalytic  60.75 
 
 		 326 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2611  Lytic transglycosylase catalytic  45.13 
 
 		 310 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3663  Lytic transglycosylase catalytic  51.88 
 
 		 309 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2871  Lytic transglycosylase catalytic  45.95 
 
 		 305 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2397  lytic transglycosylase catalytic  53.85 
 
 		 375 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279322  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1037  lytic transglycosylase, catalytic  52.75 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166947 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2814  Lytic transglycosylase catalytic  54.21 
 
 		 342 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0650  transglycosylase  49.04 
 
 		 150 aa  98.2  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2303  lytic transglycosylase, catalytic  49.04 
 
 		 150 aa  98.2  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.176095 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3465  lytic transglycosylase catalytic  53.76 
 
 		 298 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3773  Lytic transglycosylase catalytic  53.76 
 
 		 297 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0582  lytic transglycosylase, catalytic  50.96 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  43.22 
 
 		 179 aa  95.9  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1017  lytic transglycosylase, catalytic  45.79 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.520766 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2904  soluble lytic transglycosylase  47.12 
 
 		 197 aa  90.1  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2017  lytic transglycosylase, catalytic  43.36 
 
 		 205 aa  87.8  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275292  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1733  lytic transglycosylase catalytic  41.07 
 
 		 219 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254136  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1443  transglycosylase SLT domain-containing protein  37.7 
 
 		 214 aa  85.9  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1399  transglycosylase SLT domain-containing protein  37.7 
 
 		 214 aa  85.5  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.861628  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2866  Lytic transglycosylase catalytic  45.45 
 
 		 206 aa  84.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918978  normal  0.297415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2606  Lytic transglycosylase catalytic  40.37 
 
 		 175 aa  84  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2995  lytic transglycosylase, catalytic  38.05 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.891675  normal  0.0342596 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1014  Lytic transglycosylase catalytic  37.59 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2543  Lytic transglycosylase catalytic  40.2 
 
 		 249 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8299  Lytic transglycosylase catalytic  41.58 
 
 		 325 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103911  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0514  Lytic transglycosylase catalytic  36.27 
 
 		 254 aa  71.2  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1465  lytic transglycosylase catalytic  36.73 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3883  lytic transglycosylase catalytic  37.62 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2555  Lytic transglycosylase catalytic  39.6 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526771 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  38.89 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  38.78 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2909  lytic transglycosylase, catalytic  35.51 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.368798 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  36.63 
 
 		 260 aa  60.8  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  41.18 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  35.64 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  36.21 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1424  lytic transglycosylase, catalytic  41 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0284128  normal  0.0259883 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  38.14 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  36.19 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  38.82 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  34.02 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5914  Lytic transglycosylase catalytic  31.86 
 
 		 797 aa  54.3  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  33.96 
 
 		 208 aa  53.9  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 247 aa  53.9  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  37.21 
 
 		 197 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  38.38 
 
 		 203 aa  53.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  37.37 
 
 		 261 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  37.11 
 
 		 197 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  35.35 
 
 		 285 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  37.11 
 
 		 224 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  37 
 
 		 202 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  37.11 
 
 		 197 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  35.71 
 
 		 217 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  33.01 
 
 		 251 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  37.11 
 
 		 218 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 		 189 aa  50.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  34.21 
 
 		 603 aa  51.2  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  36.54 
 
 		 198 aa  50.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5361  lytic transglycosylase, catalytic  43.75 
 
 		 333 aa  50.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.716209 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  33.33 
 
 		 204 aa  50.4  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  39.56 
 
 		 292 aa  50.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0399  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 574 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  34.58 
 
 		 206 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  39.78 
 
 		 208 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 204 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 		 300 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  37.37 
 
 		 327 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  30.1 
 
 		 238 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  35.05 
 
 		 709 aa  48.9  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  37.11 
 
 		 206 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  35.35 
 
 		 281 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  27.18 
 
 		 261 aa  48.5  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  36.05 
 
 		 233 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  27.18 
 
 		 261 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  33.66 
 
 		 715 aa  48.5  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  31.37 
 
 		 747 aa  48.1  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  27.18 
 
 		 259 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  27.18 
 
 		 261 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  27.18 
 
 		 261 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  32.48 
 
 		 256 aa  47.8  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 243 aa  47.8  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  32.99 
 
 		 198 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3509  lytic transglycosylase catalytic  33.62 
 
 		 219 aa  47.8  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  27.18 
 
 		 261 aa  47.4  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  27.18 
 
 		 261 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  27.18 
 
 		 261 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>