More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3509 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3509  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
219 aa  434  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4539  lytic transglycosylase, catalytic  78.97 
 
 
224 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628549  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5136  lytic transglycosylase catalytic  76.58 
 
 
228 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206246  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5146  lytic transglycosylase, catalytic  76.58 
 
 
228 aa  298  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00474071  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3221  lytic transglycosylase, catalytic  76.58 
 
 
228 aa  298  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5063  lytic transglycosylase catalytic  76.71 
 
 
228 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126997  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0495  lytic transglycosylase, catalytic  77.52 
 
 
252 aa  294  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.358787  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0262  hypothetical protein  55.15 
 
 
217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447321 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3693  Lytic transglycosylase catalytic  67.11 
 
 
227 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00345887  hitchhiker  0.000000358582 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  52.15 
 
 
223 aa  179  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 
217 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  39.87 
 
 
208 aa  99.8  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  36.27 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  36.61 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0088  Lytic transglycosylase catalytic  35.66 
 
 
262 aa  67  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  35.71 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1089  lytic transglycosylase catalytic  29.76 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2995  lytic transglycosylase, catalytic  28.65 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.891675  normal  0.0342596 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  34.71 
 
 
238 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  33.06 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  34.86 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  33.06 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2866  Lytic transglycosylase catalytic  29.67 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918978  normal  0.297415 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  34.82 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  36.36 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  34.86 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  34.86 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  33.93 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  34.86 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0968  lytic transglycosylase, catalytic  28.67 
 
 
240 aa  64.3  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.669307  normal  0.333056 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  36.96 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  36.36 
 
 
245 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  34.48 
 
 
251 aa  63.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  25.9 
 
 
201 aa  63.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 
209 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  31.54 
 
 
282 aa  62.8  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  35.05 
 
 
209 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4054  lytic transglycosylase, catalytic  29.31 
 
 
370 aa  62  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  35.05 
 
 
209 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2904  soluble lytic transglycosylase  37.36 
 
 
197 aa  62  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  31.51 
 
 
253 aa  62  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0364  lytic transglycosylase, catalytic  31.82 
 
 
321 aa  62  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0538  lytic transglycosylase, catalytic  35 
 
 
194 aa  62  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.527113  hitchhiker  0.00520856 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0709  hypothetical protein  29.07 
 
 
362 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24101  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0702  Lytic transglycosylase catalytic  29.71 
 
 
394 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.417607  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2444  lytic transglycosylase catalytic  29.86 
 
 
374 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0658  Lytic transglycosylase catalytic  29.71 
 
 
395 aa  61.6  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.118125 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  35.04 
 
 
222 aa  61.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  35.14 
 
 
724 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  36 
 
 
253 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2017  lytic transglycosylase, catalytic  32.23 
 
 
205 aa  61.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275292  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0365  Lytic transglycosylase catalytic  29.55 
 
 
330 aa  60.5  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0615  lytic transglycosylase catalytic  30.43 
 
 
404 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.659925  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  31.97 
 
 
195 aa  60.1  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0953  lytic transglycosylase, catalytic  29.17 
 
 
378 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0915  lytic transglycosylase catalytic  29.17 
 
 
378 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.423978  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  38.3 
 
 
247 aa  60.1  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2873  lytic transglycosylase, catalytic  32.3 
 
 
296 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113557  normal  0.33639 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0474  lytic transglycosylase, catalytic  29.17 
 
 
378 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3628  lytic transglycosylase, catalytic  29.55 
 
 
252 aa  60.5  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  35.58 
 
 
197 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2149  transglycosylase SLT domain-containing protein  29.17 
 
 
370 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  34.09 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3074  Slt family transglycosylase  29.17 
 
 
370 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3105  transglycosylase SLT domain-containing protein  29.17 
 
 
370 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0759  Slt family transglycosylase  29.17 
 
 
337 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.404866  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1606  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 
166 aa  59.7  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000533374  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  35.58 
 
 
218 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3276  lytic transglycosylase, catalytic  34.51 
 
 
152 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3021  Slt family transglycosylase  29.17 
 
 
370 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.734248  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2021  Slt family transglycosylase  29.17 
 
 
337 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  34 
 
 
247 aa  60.1  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4351  lytic transglycosylase catalytic  30.57 
 
 
194 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.744622  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  37.08 
 
 
260 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1527  transglycosylase SLT domain-containing protein  29.17 
 
 
367 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.165503  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0889  transglycosylase SLT domain-containing lipoprotein  30.43 
 
 
398 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2697  lytic transglycosylase, catalytic  29.25 
 
 
355 aa  59.3  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0812  lytic transglycosylase, catalytic  29.63 
 
 
372 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  30.34 
 
 
182 aa  58.9  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  35.43 
 
 
208 aa  58.9  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  35 
 
 
782 aa  59.3  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0823  lytic transglycosylase catalytic  29.63 
 
 
372 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.600223  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2592  Slt family transglycosylase  29.17 
 
 
319 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  33.65 
 
 
196 aa  58.9  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  30.2 
 
 
304 aa  58.9  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  33 
 
 
190 aa  58.9  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  37.08 
 
 
260 aa  58.9  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 
198 aa  58.2  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1733  lytic transglycosylase catalytic  34.41 
 
 
219 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254136  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2606  Lytic transglycosylase catalytic  31.15 
 
 
175 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  34.78 
 
 
206 aa  57.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3105  Lytic transglycosylase catalytic  30.23 
 
 
393 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  31.01 
 
 
747 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  33.65 
 
 
224 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  33.67 
 
 
603 aa  57  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 
299 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  37.84 
 
 
179 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  34.41 
 
 
258 aa  57  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  31.19 
 
 
207 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  31.2 
 
 
233 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>