More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2007 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2007  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 278 aa  576  1.0000000000000001e-163  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00437999  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0187  lytic transglycosylase, catalytic  55.08 
 
 		 165 aa  138  7.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0753643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0189  lytic transglycosylase, catalytic  36.07 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0519081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  36.13 
 
 		 247 aa  78.6  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  38.17 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  36.43 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  38.76 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2611  lytic transglycosylase catalytic  32.6 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.59616 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  36.64 
 
 		 261 aa  72  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1911  soluble lytic murein transglycosylase  38.31 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0241391  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6207  Lytic transglycosylase catalytic  31.21 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287429  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0561  lytic transglycosylase, catalytic  38.31 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  36.59 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  30.3 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  36.72 
 
 		 198 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2342  lytic transglycosylase, catalytic  42.48 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  37.84 
 
 		 202 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  33.83 
 
 		 643 aa  67.4  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  34.35 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  34.4 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  32.37 
 
 		 187 aa  67  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  32.56 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0306  lytic transglycosylase, catalytic  42.11 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  34.31 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  33.09 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  38.66 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 209 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  31.82 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  35.61 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  35.77 
 
 		 199 aa  65.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3164  lytic transglycosylase, catalytic  34.75 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.205276 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  32.52 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  37.01 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  35.97 
 
 		 686 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  31.03 
 
 		 690 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1328  Lytic transglycosylase catalytic  29.27 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  38.64 
 
 		 677 aa  64.7  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  38.94 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  32.06 
 
 		 698 aa  63.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  37.17 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1133  lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2017  lytic transglycosylase, catalytic  36.79 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275292  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  30.95 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  34.03 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  39.45 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  33.1 
 
 		 648 aa  62.8  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 709 aa  62.8  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  34.15 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  35.29 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  33.12 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1733  lytic transglycosylase catalytic  35.78 
 
 		 219 aa  62  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254136  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  32.52 
 
 		 329 aa  62  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  29.14 
 
 		 216 aa  62  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  30.6 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  29.14 
 
 		 221 aa  62  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5084  lytic transglycosylase catalytic  33.59 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0436378  normal  0.0244706 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  33.88 
 
 		 603 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  34.17 
 
 		 709 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  38.53 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  36.59 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  29.34 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  34.23 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  34.71 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  31.25 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  37.38 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1606  Lytic transglycosylase catalytic  28.39 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000533374  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2606  Lytic transglycosylase catalytic  37.96 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1002  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.578014  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  30.58 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  30.94 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  30.95 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  34.38 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  31.54 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  32.84 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  38.74 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  34.38 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  29.55 
 
 		 637 aa  59.7  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2866  Lytic transglycosylase catalytic  35.51 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918978  normal  0.297415 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  34.65 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  32 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  37.38 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  34.65 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  28.48 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  34.51 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  39.29 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2904  soluble lytic transglycosylase  34.13 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  33.07 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1319  lytic transglycosylase, catalytic  31.67 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  33.59 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2642  lytic transglycosylase catalytic  33.62 
 
 		 712 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1443  transglycosylase SLT domain-containing protein  34.86 
 
 		 214 aa  58.5  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  31.78 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  31.85 
 
 		 209 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2068  soluble lytic transglycosylase  33.04 
 
 		 700 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  34.11 
 
 		 197 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  36.29 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>