More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1319 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1319  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 185 aa  387  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  33.8 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0527  Lytic transglycosylase catalytic  33.09 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.193488 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  39.62 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  37.98 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0512  Lytic transglycosylase catalytic  33.09 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.318275 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  31.82 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  37.84 
 
 		 215 aa  72  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  43.75 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  41.84 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  37.98 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  40.4 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  37.4 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  37.4 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  37.8 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  36.43 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  36.43 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0006  lytic transglycosylase, catalytic  35.94 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  36.43 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  43.02 
 
 		 442 aa  68.6  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  37.68 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  40.21 
 
 		 242 aa  68.2  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  34.07 
 
 		 279 aa  68.2  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 249 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0006  lytic transglycosylase catalytic  36.89 
 
 		 154 aa  67.4  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  35.29 
 
 		 197 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  32.62 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 		 218 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  39.36 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  42.71 
 
 		 208 aa  67  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  45.05 
 
 		 217 aa  67  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5084  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 290 aa  67  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0436378  normal  0.0244706 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.78 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  30.71 
 
 		 256 aa  67  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  38.24 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  33.08 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  39.45 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  36.89 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  36.64 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  33.08 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  35.71 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3565  Lytic transglycosylase catalytic  40.7 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  37.84 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  35.62 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  33.58 
 
 		 281 aa  65.1  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  35.71 
 
 		 300 aa  65.1  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  35.71 
 
 		 292 aa  64.7  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2288  Lytic transglycosylase catalytic  34.43 
 
 		 482 aa  64.7  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  41.3 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  34.33 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2727  lytic transglycosylase, catalytic  32.68 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.742597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  30.36 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  34.34 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  43.33 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3164  lytic transglycosylase, catalytic  33.85 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.205276 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  39.36 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  36.84 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  27.89 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  40.66 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  40.48 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  37.17 
 
 		 260 aa  62  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  32.54 
 
 		 326 aa  62.4  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  33.07 
 
 		 179 aa  62  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2135  lytic transglycosylase catalytic  32.26 
 
 		 233 aa  62  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  40.66 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1248  Lytic transglycosylase catalytic  28.24 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00404625  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  39.18 
 
 		 247 aa  61.6  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3427  Lytic transglycosylase catalytic  32.09 
 
 		 295 aa  61.6  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  40.66 
 
 		 251 aa  61.6  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  40.66 
 
 		 260 aa  61.2  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  32.86 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  32.85 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  40.91 
 
 		 226 aa  60.8  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  39.56 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0850  lytic transglycosylase, catalytic  37.25 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0266609 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  33.06 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  39.18 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  37.62 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24441  soluble lytic transglycosylase  36.36 
 
 		 677 aa  59.7  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  38.54 
 
 		 663 aa  60.1  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  30.92 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3817  lytic transglycosylase, catalytic  38.38 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315131  normal  0.0342532 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3978  lytic transglycosylase catalytic  39.18 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2629  transglycosylase slt family protein  33.06 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00160181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1706  transglycosylase slt family protein  33.06 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.190325  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  35.25 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  39.58 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  37.62 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1603  lytic transglycosylase  29.22 
 
 		 830 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.807223  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  30.08 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1816  lytic transglycosylase catalytic  33.06 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  30.95 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1328  Lytic transglycosylase catalytic  32 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3643  lytic transglycosylase catalytic  37.37 
 
 		 384 aa  58.9  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0752757 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2007  lytic transglycosylase, catalytic  31.67 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00437999  normal  0.132428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>