More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0028 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  100 
 
 		 208 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  54.82 
 
 		 217 aa  167  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  42.74 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3693  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 227 aa  104  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00345887  hitchhiker  0.000000358582 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0262  hypothetical protein  40 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447321 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5136  lytic transglycosylase catalytic  39.19 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0495  lytic transglycosylase, catalytic  41.41 
 
 		 252 aa  99.4  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.358787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3509  lytic transglycosylase catalytic  40.54 
 
 		 219 aa  99.4  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3221  lytic transglycosylase, catalytic  39.19 
 
 		 228 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5146  lytic transglycosylase, catalytic  39.19 
 
 		 228 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00474071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  44.83 
 
 		 190 aa  95.9  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  33.14 
 
 		 175 aa  90.5  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4539  lytic transglycosylase, catalytic  38.28 
 
 		 224 aa  88.2  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5063  lytic transglycosylase catalytic  38.28 
 
 		 228 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0538  lytic transglycosylase, catalytic  43.24 
 
 		 194 aa  85.9  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.527113  hitchhiker  0.00520856 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0643  lytic transglycosylase, catalytic  37.36 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.849619  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0421  lytic transglycosylase, catalytic  47.37 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.829572 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0518  putative signal peptide protein  35.53 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106136 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2951  lytic transglycosylase, catalytic  36.55 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  37.59 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3099  lytic transglycosylase, catalytic  37.4 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4211  Lytic transglycosylase catalytic  34.94 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2113  hypothetical protein  35.06 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0575  lytic transglycosylase catalytic  42.71 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.445014 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  32.94 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1275  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  36.09 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1226  Lytic transglycosylase catalytic  35.22 
 
 		 221 aa  72  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793802  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3669  lytic transglycosylase, catalytic  34.42 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  43.96 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5480  lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0776  Lytic transglycosylase catalytic  33.97 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0847  lytic transglycosylase, catalytic  33.97 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  34.26 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0766  lytic transglycosylase, catalytic  32.47 
 
 		 354 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.892374  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0889  transglycosylase SLT domain-containing lipoprotein  31.94 
 
 		 398 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  44.57 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3105  Lytic transglycosylase catalytic  31.94 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  38.58 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3628  lytic transglycosylase, catalytic  35.88 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0832  lytic transglycosylase, catalytic  32.93 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0709  hypothetical protein  31.5 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 282 aa  67  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2391  lytic transglycosylase, catalytic  39.78 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0702  Lytic transglycosylase catalytic  31.5 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.417607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0658  Lytic transglycosylase catalytic  31.5 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.118125 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2937  hypothetical protein  31.54 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.88861 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2697  lytic transglycosylase, catalytic  30.83 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0615  lytic transglycosylase catalytic  32.85 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.659925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  34.9 
 
 		 258 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0365  Lytic transglycosylase catalytic  38.38 
 
 		 330 aa  67  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2659  Lytic transglycosylase catalytic  34.38 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.725375  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4954  lytic transglycosylase catalytic  31.45 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0744  lytic transglycosylase, catalytic  37.76 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0220327 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  43.68 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2926  lytic transglycosylase catalytic  32.52 
 
 		 311 aa  65.5  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2468  lytic transglycosylase catalytic  44.44 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  29.66 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2657  lytic transglycosylase, catalytic  35.43 
 
 		 267 aa  65.1  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00887082  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1297  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  46.08 
 
 		 603 aa  64.7  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  34.72 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2149  transglycosylase SLT domain-containing protein  31.47 
 
 		 370 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2021  Slt family transglycosylase  32.35 
 
 		 337 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3105  transglycosylase SLT domain-containing protein  31.47 
 
 		 370 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0759  Slt family transglycosylase  32.35 
 
 		 337 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.404866  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3021  Slt family transglycosylase  32.35 
 
 		 370 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.734248  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3074  Slt family transglycosylase  31.47 
 
 		 370 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2592  Slt family transglycosylase  31.47 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3533  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4054  lytic transglycosylase, catalytic  31.69 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2991  lytic transglycosylase, catalytic  33.08 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.617808  normal  0.305104 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2043  Lytic transglycosylase catalytic  36.96 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.944666  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1527  transglycosylase SLT domain-containing protein  31.47 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.165503  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  40.35 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1661  lytic transglycosylase, catalytic  36.96 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2563  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0148918  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0364  lytic transglycosylase, catalytic  34.4 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  34.46 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0474  lytic transglycosylase, catalytic  31.69 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0915  lytic transglycosylase catalytic  31.69 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.423978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  36.67 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0953  lytic transglycosylase, catalytic  31.69 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  43.68 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3099  Lytic transglycosylase catalytic  36.22 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  40.66 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  38.24 
 
 		 438 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  42.53 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  42.53 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  42.53 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2296  Lytic transglycosylase catalytic  36.28 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000211124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3427  Lytic transglycosylase catalytic  37.59 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  40.82 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  38.71 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  39.36 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  41.18 
 
 		 198 aa  62  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0006  lytic transglycosylase, catalytic  42.35 
 
 		 154 aa  62  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  42.53 
 
 		 260 aa  61.6  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  35.64 
 
 		 747 aa  61.6  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  29.41 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>