More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2342 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2342  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 272 aa  551  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0306  lytic transglycosylase, catalytic  50.75 
 
 		 293 aa  248  7e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1133  lytic transglycosylase catalytic  52.61 
 
 		 282 aa  246  3e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0561  lytic transglycosylase, catalytic  48.12 
 
 		 296 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1911  soluble lytic murein transglycosylase  49.45 
 
 		 296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0241391  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1002  lytic transglycosylase, catalytic  50.4 
 
 		 271 aa  218  7.999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.578014  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  58.82 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  40.98 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  47.5 
 
 		 271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  58.93 
 
 		 208 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  59.81 
 
 		 261 aa  128  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  49.61 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  55.96 
 
 		 207 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  46.67 
 
 		 196 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  47.89 
 
 		 212 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  41.81 
 
 		 188 aa  123  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  58.25 
 
 		 304 aa  122  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  47.69 
 
 		 247 aa  122  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  50.83 
 
 		 224 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  58.65 
 
 		 218 aa  122  8e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  55.34 
 
 		 328 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  54.87 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  54.87 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  54.46 
 
 		 197 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  49.14 
 
 		 217 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  54.46 
 
 		 218 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  49.3 
 
 		 296 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  54.29 
 
 		 189 aa  118  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  49.3 
 
 		 296 aa  118  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4351  lytic transglycosylase catalytic  59.82 
 
 		 194 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.744622  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  56.19 
 
 		 202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  55.08 
 
 		 199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  52.83 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  56.73 
 
 		 198 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  49.57 
 
 		 283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  48.59 
 
 		 285 aa  116  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  48.85 
 
 		 206 aa  116  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  39.73 
 
 		 215 aa  115  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  49.17 
 
 		 197 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  51.56 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  45.74 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  54.63 
 
 		 204 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  46.92 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  56.36 
 
 		 206 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  48.33 
 
 		 237 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  48.11 
 
 		 174 aa  113  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  44.44 
 
 		 249 aa  112  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  54.63 
 
 		 204 aa  112  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  43.75 
 
 		 239 aa  112  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  54.63 
 
 		 203 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  43.75 
 
 		 239 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  43.75 
 
 		 239 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  45.45 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  41.98 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  43.65 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  43.65 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  46.67 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  53.51 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  47.1 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  53.51 
 
 		 221 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  44.8 
 
 		 239 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  51.85 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  48.55 
 
 		 202 aa  109  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  40.61 
 
 		 228 aa  109  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 245 aa  109  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0406  Lytic transglycosylase catalytic  52.29 
 
 		 258 aa  109  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  0.0556667 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  49.55 
 
 		 222 aa  109  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 299 aa  109  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  51.28 
 
 		 203 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  43.09 
 
 		 305 aa  108  8.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  42.98 
 
 		 273 aa  108  9.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  41.3 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  56.6 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  41.61 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  51.43 
 
 		 200 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  48.72 
 
 		 442 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  47.33 
 
 		 291 aa  106  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3638  lytic transglycosylase catalytic  54.9 
 
 		 206 aa  106  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.237 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  52.94 
 
 		 327 aa  105  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0483  lytic transglycosylase, catalytic  49.53 
 
 		 299 aa  105  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  41.54 
 
 		 326 aa  105  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2441  lytic transglycosylase, catalytic  44.44 
 
 		 300 aa  105  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0168706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  43.18 
 
 		 146 aa  104  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  51.46 
 
 		 217 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  50.48 
 
 		 191 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  52.5 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  45.05 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  40.15 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  42.61 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  40.6 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  42.61 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  47.52 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  42.61 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  48 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  47.89 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  52.38 
 
 		 244 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  48.67 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  46.53 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  56.19 
 
 		 209 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>