More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3693 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3693  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 227 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00345887  hitchhiker  0.000000358582 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0262  hypothetical protein  82.95 
 
 		 217 aa  357  8e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447321 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  63.98 
 
 		 223 aa  231  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3509  lytic transglycosylase catalytic  67.11 
 
 		 219 aa  198  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4539  lytic transglycosylase, catalytic  63.58 
 
 		 224 aa  191  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0495  lytic transglycosylase, catalytic  52.29 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.358787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5063  lytic transglycosylase catalytic  64.34 
 
 		 228 aa  188  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5136  lytic transglycosylase catalytic  61.49 
 
 		 228 aa  185  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5146  lytic transglycosylase, catalytic  62.76 
 
 		 228 aa  184  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00474071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3221  lytic transglycosylase, catalytic  62.76 
 
 		 228 aa  184  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  47.73 
 
 		 217 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  40 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  33.56 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  40.59 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  40.59 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  39.36 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  36.08 
 
 		 209 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0968  lytic transglycosylase, catalytic  31.13 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.669307  normal  0.333056 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  29.87 
 
 		 304 aa  65.5  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  36.73 
 
 		 603 aa  65.1  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  36.19 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  35.29 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0365  Lytic transglycosylase catalytic  30.6 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  34.86 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  37.27 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  36.28 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3533  lytic transglycosylase, catalytic  30.89 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0364  lytic transglycosylase, catalytic  32.09 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  31.53 
 
 		 198 aa  62  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  33.88 
 
 		 238 aa  62  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  33.03 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  34.74 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  31.3 
 
 		 201 aa  61.6  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  33.94 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  33.94 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  33.03 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  33.03 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  33.03 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  35 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  33.03 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  33.03 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  33.03 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3276  lytic transglycosylase, catalytic  35.48 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  35.23 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2444  lytic transglycosylase catalytic  29.53 
 
 		 374 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  38.38 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  33.7 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  33.03 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  32.52 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  34.62 
 
 		 296 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0889  transglycosylase SLT domain-containing lipoprotein  29.93 
 
 		 398 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  33.61 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  33.65 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2995  lytic transglycosylase, catalytic  32.71 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.891675  normal  0.0342596 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0615  lytic transglycosylase catalytic  30.22 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.659925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  30.65 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  36.17 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1089  lytic transglycosylase catalytic  27.84 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  28.86 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  34.82 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  33.61 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  34.09 
 
 		 260 aa  57  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  35.64 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  31.36 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  31.43 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  33.64 
 
 		 782 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3105  Lytic transglycosylase catalytic  29.2 
 
 		 393 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  35.64 
 
 		 197 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  32.29 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2951  lytic transglycosylase, catalytic  33.67 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  39.36 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  31.86 
 
 		 206 aa  57  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2296  Lytic transglycosylase catalytic  28.7 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000211124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0538  lytic transglycosylase, catalytic  32.29 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.527113  hitchhiker  0.00520856 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0514  Lytic transglycosylase catalytic  34.19 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  27.7 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  35.23 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1226  Lytic transglycosylase catalytic  28.76 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793802  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  28.37 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0823  lytic transglycosylase catalytic  28.75 
 
 		 372 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.600223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0812  lytic transglycosylase, catalytic  28.03 
 
 		 372 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0915  lytic transglycosylase catalytic  28.26 
 
 		 378 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.423978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  35.16 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  34.86 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4054  lytic transglycosylase, catalytic  28.47 
 
 		 370 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8299  Lytic transglycosylase catalytic  35.51 
 
 		 325 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103911  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  34.86 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3099  lytic transglycosylase, catalytic  31.63 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0953  lytic transglycosylase, catalytic  28.26 
 
 		 378 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  34.74 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0474  lytic transglycosylase, catalytic  27.89 
 
 		 378 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  36.96 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  30.89 
 
 		 281 aa  54.7  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  40.28 
 
 		 179 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0421  lytic transglycosylase, catalytic  35.16 
 
 		 190 aa  54.7  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.829572 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  28.07 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  29.37 
 
 		 174 aa  54.3  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>